; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG07G007010 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG07G007010
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionNuclear ribonuclease Z
Genome locationCG_Chr07:14348712..14350184
RNA-Seq ExpressionClCG07G007010
SyntenyClCG07G007010
Gene Ontology termsGO:0034414 - tRNA 3'-trailer cleavage, endonucleolytic (biological process)
GO:0042781 - 3'-tRNA processing endoribonuclease activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6604210.1 tRNase Z TRZ1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.8e-1085Show/hide
Query:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
        ++KMEPPTIIVPK I NDVE+LLE+HRRLDQSELRCNLIG
Subjt:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
KAG7034370.1 tRNase Z TRZ1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.8e-1085Show/hide
Query:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
        ++KMEPPTIIVPK I NDVE+LLE+HRRLDQSELRCNLIG
Subjt:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
XP_022950835.1 tRNase Z TRZ1 [Cucurbita moschata]2.8e-1085Show/hide
Query:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
        ++KMEPPTIIVPK I NDVE+LLE+HRRLDQSELRCNLIG
Subjt:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
XP_022979026.1 tRNase Z TRZ1 [Cucurbita maxima]2.8e-1085Show/hide
Query:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
        ++KMEPPTIIVPK I NDVE+LLE+HRRLDQSELRCNLIG
Subjt:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
XP_038882014.1 nuclear ribonuclease Z isoform X3 [Benincasa hispida]8.3e-1082.5Show/hide
Query:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
        ++KM+PPTIIVPK I NDVE+LLE+HRRLDQSELRCNLIG
Subjt:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C5G3 nuclear ribonuclease Z6.8e-1080Show/hide
Query:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
        ++KM PPTI+VPK I NDVE+LLE+HRRLDQSELRCNLIG
Subjt:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
A0A5A7V6W7 Nuclear ribonuclease Z6.8e-1080Show/hide
Query:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
        ++KM PPTI+VPK I NDVE+LLE+HRRLDQSELRCNLIG
Subjt:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
A0A5D3DXQ4 Nuclear ribonuclease Z6.8e-1080Show/hide
Query:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
        ++KM PPTI+VPK I NDVE+LLE+HRRLDQSELRCNLIG
Subjt:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
A0A6J1GGV3 tRNase Z TRZ11.4e-1085Show/hide
Query:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
        ++KMEPPTIIVPK I NDVE+LLE+HRRLDQSELRCNLIG
Subjt:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
A0A6J1IPL7 tRNase Z TRZ11.4e-1085Show/hide
Query:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
        ++KMEPPTIIVPK I NDVE+LLE+HRRLDQSELRCNLIG
Subjt:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
SwissProt top hitse value%identityAlignment
P60193 Nuclear ribonuclease Z (Fragment)8.3e-0548.72Show/hide
Query:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLI
        ++++ PPTI VPKY+   VE L ++HR +DQSEL   L+
Subjt:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLI
Q8L633 tRNase Z TRZ2, chloroplastic5.4e-0453.85Show/hide
Query:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLI
        ++ +EPP I VP  I  DVE LLEIHR + Q EL   LI
Subjt:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLI
Q8LGU7 tRNase Z TRZ14.0e-0760Show/hide
Query:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
        ++KM+PPTIIVP  I   VE L E+HR+LD SEL+ NL+G
Subjt:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G74700.1 tRNAse Z12.8e-0860Show/hide
Query:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
        ++KM+PPTIIVP  I   VE L E+HR+LD SEL+ NL+G
Subjt:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIG
AT2G04530.1 Metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein3.8e-0553.85Show/hide
Query:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLI
        ++ +EPP I VP  I  DVE LLEIHR + Q EL   LI
Subjt:  IHKMEPPTIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLI

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTATTGTCATCTTATGGTTGCAAGCTTTTGAGAATTAAAAAGGCCTTTAGAAATCTTCTAGAAAAGGTTTTAAATATTTTTATCCTTAATATAAAATTCCAAATTCG
GTTGGGTATCCCTCGATTTCTTTTTCTTCATCATCGTTCGTCGGCGATCGGCACCTCCAAACTTCTTCTCTTCATCGGTATGTCGTCTTCTCTTTTTCTTCTTCAGCTAA
AACCTATTTTGGACATGTTTAAACATCGTTCGTCCTTTCTGCCCTTGAACATGGGGACTTCCCTTGTATGTGGCTACGACCTGTGGATTATACACAAAATGGAACCGCCA
ACAATTATTGTACCAAAATATATAAATAATGATGTAGAAGATCTCTTAGAGATACACAGAAGATTGGATCAATCTGAGCTGAGATGTAATTTGATTGGCTGGAAGGGAAC
AGTTGTCATTGAGAAGGGACCTCAAAGTGAGGGTGTTGAAGACATACCATGTCATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTATTGTCATCTTATGGTTGCAAGCTTTTGAGAATTAAAAAGGCCTTTAGAAATCTTCTAGAAAAGGTTTTAAATATTTTTATCCTTAATATAAAATTCCAAATTCG
GTTGGGTATCCCTCGATTTCTTTTTCTTCATCATCGTTCGTCGGCGATCGGCACCTCCAAACTTCTTCTCTTCATCGGTATGTCGTCTTCTCTTTTTCTTCTTCAGCTAA
AACCTATTTTGGACATGTTTAAACATCGTTCGTCCTTTCTGCCCTTGAACATGGGGACTTCCCTTGTATGTGGCTACGACCTGTGGATTATACACAAAATGGAACCGCCA
ACAATTATTGTACCAAAATATATAAATAATGATGTAGAAGATCTCTTAGAGATACACAGAAGATTGGATCAATCTGAGCTGAGATGTAATTTGATTGGCTGGAAGGGAAC
AGTTGTCATTGAGAAGGGACCTCAAAGTGAGGGTGTTGAAGACATACCATGTCATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVLSSYGCKLLRIKKAFRNLLEKVLNIFILNIKFQIRLGIPRFLFLHHRSSAIGTSKLLLFIGMSSSLFLLQLKPILDMFKHRSSFLPLNMGTSLVCGYDLWIIHKMEPP
TIIVPKYINNDVEDLLEIHRRLDQSELRCNLIGWKGTVVIEKGPQSEGVEDIPCH