; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG08G008070 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG08G008070
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionRibosomal protein S14
Genome locationCG_Chr08:20598719..20600955
RNA-Seq ExpressionClCG08G008070
SyntenyClCG08G008070
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0015935 - small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001209 - Ribosomal protein S14
IPR018271 - Ribosomal protein S14, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032953.1 Ribosomal protein S14, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.4e-4594.06Show/hide
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XP_022938933.1 uncharacterized protein LOC111444996 [Cucurbita moschata]4.7e-4695.05Show/hide
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XP_023550870.1 uncharacterized protein LOC111808878 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.2e-4694.06Show/hide
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XP_038884392.1 ribosomal protein S14, mitochondrial [Benincasa hispida]2.8e-4696.04Show/hide
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A0A0A0LSR8 Uncharacterized protein1.4e-4085.15Show/hide
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A0A1S4E169 ribosomal protein S14, mitochondrial2.2e-4186.14Show/hide
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A0A5D3CKB3 Ribosomal protein S142.2e-4186.14Show/hide
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A0A6J1C264 uncharacterized protein LOC1110067331.9e-4595.05Show/hide
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A0A6J1FKA4 uncharacterized protein LOC1114449962.3e-4695.05Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P05716 Ribosomal protein S14, mitochondrial3.5e-3673.47Show/hide
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P14875 Ribosomal protein S14, mitochondrial5.5e-3773.47Show/hide
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P26873 Ribosomal protein S14, mitochondrial1.5e-3170.21Show/hide
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P46752 Ribosomal protein S14, mitochondrial6.1e-2057.3Show/hide
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P49387 Ribosomal protein S14, mitochondrial3.3e-3470.41Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G34520.1 mitochondrial ribosomal protein S148.9e-3570.1Show/hide
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ATCG00330.1 chloroplast ribosomal protein S142.1e-0737.08Show/hide
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        R++L  K+ L R+  K   +     ++  + H  KL   PRNS+ TRL  RC  TGRPRA Y+ F +S  + R++    L+ G  +SSW
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GCTAAAAGCTAGCCAGCCATTGCAGAGGATTTCAAAGCTTGAAGTTTTCACTCTCCGCATTCAAACGGATGAGTTTGGATCAACGAGGGCCCGTTTAGATAGTTGGAACG
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CTTCTTGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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AATATAGACACTGAAAAAGGTGATGTTAATTGTAAGTTCCTTGGACATGATTCATGCCCGTTTACAAATATGACCAAAGAAGAGTAAAGGCTTTACTTTTGCTATTCAAT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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