; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG08G008480 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG08G008480
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
Descriptionchlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic
Genome locationCG_Chr08:20962222..20968922
RNA-Seq ExpressionClCG08G008480
SyntenyClCG08G008480
Gene Ontology termsGO:0015996 - chlorophyll catabolic process (biological process)
GO:0034256 - chlorophyll(ide) b reductase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002347 - Short-chain dehydrogenase/reductase SDR
IPR020904 - Short-chain dehydrogenase/reductase, conserved site
IPR036291 - NAD(P)-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004140918.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus]5.1e-17489.04Show/hide
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XP_022992660.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic [Cucurbita maxima]1.1e-17389.97Show/hide
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XP_023550435.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-17389.69Show/hide
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XP_038885313.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]2.8e-18091.71Show/hide
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XP_038885315.1 chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic isoform X2 [Benincasa hispida]5.1e-18292.74Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KE83 Uncharacterized protein2.5e-17489.04Show/hide
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A0A1S3C3P2 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic isoform X19.4e-17489.3Show/hide
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A0A6J1BXF3 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic4.1e-16988.27Show/hide
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A0A6J1FGR3 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic7.2e-17489.69Show/hide
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A0A6J1JWB8 chlorophyll(Ide) b reductase NOL, chloroplastic5.5e-17489.97Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
D2WKD9 Farnesol dehydrogenase4.1e-1731.34Show/hide
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        L   + + L EV+ TN +GL++C ++A + M  +   GHI +I+   G      P+   Y A+K +V  +T++++ ELR      + V ++SPG+V T++
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        L
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Q5N800 Probable chlorophyll(ide) b reductase NYC1, chloroplastic6.8e-5245.9Show/hide
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Query:  VKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLT
           V VH  SPGMV TDLL+SG++ +  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G      I +LT
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Q84ST4 Chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic5.6e-13181.4Show/hide
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        NAGSNAYS+KPLVE SDE L+EV+TTN LGLMICCREAI MM NQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+M +V NV+VHN
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Query:  LSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYLLED
        LSPGMVTTDLLMSGA TKQAKFFIN+LAEP  VVA+YLVPNIR+IPTN S +PTYIRFLTGLKAYS+IFSR+AFGARRN+Y+ ED
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Q8LEU3 Chlorophyll(ide) b reductase NOL, chloroplastic4.4e-13675.52Show/hide
Query:  FFSPPSRIRLSLYKLESFSRSVARSRDISNIPTNGVVNLNSVSTNAEESQQREPMVPPYNVLITGSTKGVPVSLSRIGYALAREFLKAGDNVVICSRSAE
        F SP  R RL   +    +  V R         N  V  +S +  A  S +REPM PPYN+LITGSTKG       IGYALAREFLKAGDNVVICSRSAE
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Query:  RVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGH
        RVE++VQSL+EEFGE HVWGTKCDV EG+DV+ LVA+ QKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPL EASDEDLIEVV TN LGLM+CCREA+ MML Q RGGH
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Query:  IFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGS
        IFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGA TKQAKFFINVLAEP EVVAEYLVPNIR+IP +GS
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Query:  TRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYLLED
         +PTYIRFLTG+KAY++IFSR+A GAR+NRY+ E+
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Q93ZA0 Probable chlorophyll(ide) b reductase NYC1, chloroplastic7.7e-4843.19Show/hide
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        P NV+ITGST+G       +G ALAREFL +GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV + EDV+ L  F  K L
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Query:  KYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQD
          I+IWINNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E     
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Query:  VKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG
          NV +H  SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G13250.1 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein5.5e-4943.19Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGVPVSLSRIGYALAREFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNL
        P NV+ITGST+G       +G ALAREFL +GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV + EDV+ L  F  K L
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Query:  KYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQD
          I+IWINNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E     
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Query:  VKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG
          NV +H  SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G
Subjt:  VKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG

AT4G13250.2 NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein1.5e-4642.02Show/hide
Query:  PYNVLITGSTKGVPVSLSRIGYALAREFLKAGDNVVICSRSAERVESSV---------------QSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNL
        P NV+ITG           +G ALAREFL +GD V++ SRS+E V+ +V               +S R++  +  V G  CDV + EDV+ L  F  K L
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Query:  KYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQD
          I+IWINNAG+N   F+PL+E ++ED+ ++V+TN +G ++C R A+ +M  Q  GGHIFN+DGAGS G  TP  A YG+TK  +     S+  E     
Subjt:  KYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQD

Query:  VKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG
          NV +H  SPGMV T+LL+SG++ K  + F N++ E PE VA  LVP +R +  +G
Subjt:  VKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNG

AT5G04900.1 NYC1-like3.1e-13775.52Show/hide
Query:  FFSPPSRIRLSLYKLESFSRSVARSRDISNIPTNGVVNLNSVSTNAEESQQREPMVPPYNVLITGSTKGVPVSLSRIGYALAREFLKAGDNVVICSRSAE
        F SP  R RL   +    +  V R         N  V  +S +  A  S +REPM PPYN+LITGSTKG       IGYALAREFLKAGDNVVICSRSAE
Subjt:  FFSPPSRIRLSLYKLESFSRSVARSRDISNIPTNGVVNLNSVSTNAEESQQREPMVPPYNVLITGSTKGVPVSLSRIGYALAREFLKAGDNVVICSRSAE

Query:  RVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRGGH
        RVE++VQSL+EEFGE HVWGTKCDV EG+DV+ LVA+ QKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPL EASDEDLIEVV TN LGLM+CCREA+ MML Q RGGH
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Query:  IFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGS
        IFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAEL+MQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGA TKQAKFFINVLAEP EVVAEYLVPNIR+IP +GS
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Query:  TRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYLLED
         +PTYIRFLTG+KAY++IFSR+A GAR+NRY+ E+
Subjt:  TRPTYIRFLTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYLLED


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCAGCTTCGTCTTCCTCCCTCCTCTTTCCGTCCCTGTTGGTCCCCCATAACCATGGCTTCTTCTTCTCTCCTCCTTCCCGAATCCGCCTATCACTCTACAAATT
GGAGAGTTTCAGTCGTTCCGTAGCTCGTTCGCGCGACATATCCAACATTCCGACGAATGGCGTCGTGAATTTGAATTCCGTATCGACAAATGCCGAAGAATCTCAGCAGA
GGGAGCCTATGGTTCCTCCTTACAACGTTTTGATCACCGGCTCCACTAAAGGTGTGCCGGTCTCTCTTTCTCGAATAGGATATGCATTGGCCAGAGAGTTTCTGAAAGCA
GGTGACAATGTCGTTATCTGTTCACGATCAGCTGAGAGGGTTGAGTCTTCTGTTCAAAGCCTGAGAGAAGAATTTGGGGAGCAGCATGTGTGGGGTACTAAATGTGACGT
GCGAGAAGGAGAGGATGTAAAGAATTTAGTTGCATTTGTGCAGAAAAATCTTAAATATATTGACATATGGATCAATAATGCAGGATCAAATGCTTATAGCTTTAAGCCTT
TGGTCGAGGCTTCAGATGAAGATCTCATTGAAGTTGTCACTACAAATGCTCTTGGTTTGATGATATGTTGCCGAGAGGCAATAAAGATGATGTTAAACCAACCTCGAGGG
GGTCATATTTTCAACATTGATGGGGCTGGTTCTGATGGACGGCCCACCCCTAGGTTTGCTGCATATGGGGCAACTAAAAGAAGTGTTGTCCATTTAACAAAGTCATTACA
GGCTGAATTGCGGATGCAGGACGTGAAAAATGTTGTAGTGCACAATCTTTCGCCTGGGATGGTTACAACTGATCTTCTCATGTCTGGTGCTAATACAAAGCAGGCGAAAT
TTTTCATCAACGTTTTGGCGGAACCACCTGAAGTGGTGGCAGAATACCTTGTCCCAAACATACGATCTATCCCAACCAATGGTTCAACAAGGCCCACATACATCCGTTTC
CTCACTGGACTGAAAGCTTATTCCCAGATTTTCTCAAGACTTGCTTTCGGTGCAAGAAGAAACAGATATCTTCTAGAAGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCAGCTTCGTCTTCCTCCCTCCTCTTTCCGTCCCTGTTGGTCCCCCATAACCATGGCTTCTTCTTCTCTCCTCCTTCCCGAATCCGCCTATCACTCTACAAATT
GGAGAGTTTCAGTCGTTCCGTAGCTCGTTCGCGCGACATATCCAACATTCCGACGAATGGCGTCGTGAATTTGAATTCCGTATCGACAAATGCCGAAGAATCTCAGCAGA
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GGTGACAATGTCGTTATCTGTTCACGATCAGCTGAGAGGGTTGAGTCTTCTGTTCAAAGCCTGAGAGAAGAATTTGGGGAGCAGCATGTGTGGGGTACTAAATGTGACGT
GCGAGAAGGAGAGGATGTAAAGAATTTAGTTGCATTTGTGCAGAAAAATCTTAAATATATTGACATATGGATCAATAATGCAGGATCAAATGCTTATAGCTTTAAGCCTT
TGGTCGAGGCTTCAGATGAAGATCTCATTGAAGTTGTCACTACAAATGCTCTTGGTTTGATGATATGTTGCCGAGAGGCAATAAAGATGATGTTAAACCAACCTCGAGGG
GGTCATATTTTCAACATTGATGGGGCTGGTTCTGATGGACGGCCCACCCCTAGGTTTGCTGCATATGGGGCAACTAAAAGAAGTGTTGTCCATTTAACAAAGTCATTACA
GGCTGAATTGCGGATGCAGGACGTGAAAAATGTTGTAGTGCACAATCTTTCGCCTGGGATGGTTACAACTGATCTTCTCATGTCTGGTGCTAATACAAAGCAGGCGAAAT
TTTTCATCAACGTTTTGGCGGAACCACCTGAAGTGGTGGCAGAATACCTTGTCCCAAACATACGATCTATCCCAACCAATGGTTCAACAAGGCCCACATACATCCGTTTC
CTCACTGGACTGAAAGCTTATTCCCAGATTTTCTCAAGACTTGCTTTCGGTGCAAGAAGAAACAGATATCTTCTAGAAGATTGATGATAATTTAGAAGTACAATTTCCCA
TCCTCATGGTAGACTCTTTTGGACTGCTCCTAAAAGACGACCCAAGGAAATGATGCCCTCTTGTCTTTGAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASASSSSLLFPSLLVPHNHGFFFSPPSRIRLSLYKLESFSRSVARSRDISNIPTNGVVNLNSVSTNAEESQQREPMVPPYNVLITGSTKGVPVSLSRIGYALAREFLKA
GDNVVICSRSAERVESSVQSLREEFGEQHVWGTKCDVREGEDVKNLVAFVQKNLKYIDIWINNAGSNAYSFKPLVEASDEDLIEVVTTNALGLMICCREAIKMMLNQPRG
GHIFNIDGAGSDGRPTPRFAAYGATKRSVVHLTKSLQAELRMQDVKNVVVHNLSPGMVTTDLLMSGANTKQAKFFINVLAEPPEVVAEYLVPNIRSIPTNGSTRPTYIRF
LTGLKAYSQIFSRLAFGARRNRYLLED