| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0064834.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucumis melo var. makuwa] | 4.2e-122 | 96.03 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDD+RDRDYRRRSRSRSR+RYDRDRPHRSER+RYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSP RHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDADIS
PDTRRSISPRRTPPSRGRSD+E SPK DNGSP+DKPVDSRSPSPA+SDAD+S
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDADIS
|
|
| KAG6598682.1 Serine/arginine-rich splicing factor SC35, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 1.5e-119 | 94.82 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPR RHRDD+RDRDYRRRSRSRSR+R+DRDRPHRSER+RYRSRSRSASPDR KDRRRGRDD ERRSASHSDRSMSPARHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDADI
PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDE SP+RDNGSP+DKPVDSRSPSPAKSDAD+
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDADI
|
|
| XP_008445340.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SC35-like [Cucumis melo] | 3.6e-121 | 96.4 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDD+RDRDYRRRSRSRSR+RYDRDRPHRSER+RYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSP RHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDAD
PDTRRSISPRRTPPSRGRSD+E SPK DNGSP+DKPVDSRSPSPA+SDAD
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDAD
|
|
| XP_011649457.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 isoform X2 [Cucumis sativus] | 2.7e-121 | 96.4 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSR+RYDRDRPHRSER+RYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSP RHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDAD
PDTRRSISPR+TPPSR RSDDE SPK DNGSP+DKPVDSRSPSPA+SDAD
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDAD
|
|
| XP_031736561.1 serine/arginine-rich splicing factor SC35 isoform X1 [Cucumis sativus] | 2.6e-119 | 94.14 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDR------SM
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSR+RYDRDRPHRSER+RYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDR SM
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDR------SM
Query: SPARHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDAD
SP RHSPDTRRSISPR+TPPSR RSDDE SPK DNGSP+DKPVDSRSPSPA+SDAD
Subjt: SPARHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDAD
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LQG4 RRM domain-containing protein | 1.3e-121 | 96.4 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSR+RYDRDRPHRSER+RYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSP RHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDAD
PDTRRSISPR+TPPSR RSDDE SPK DNGSP+DKPVDSRSPSPA+SDAD
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDAD
|
|
| A0A1S3BCG4 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 1.7e-121 | 96.4 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDD+RDRDYRRRSRSRSR+RYDRDRPHRSER+RYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSP RHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDAD
PDTRRSISPRRTPPSRGRSD+E SPK DNGSP+DKPVDSRSPSPA+SDAD
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDAD
|
|
| A0A5A7VC44 Serine/arginine-rich splicing factor SC35-like | 2.0e-122 | 96.03 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDD+RDRDYRRRSRSRSR+RYDRDRPHRSER+RYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSP RHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDADIS
PDTRRSISPRRTPPSRGRSD+E SPK DNGSP+DKPVDSRSPSPA+SDAD+S
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDADIS
|
|
| A0A6J1HFJ8 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 | 4.7e-119 | 94.42 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPR RHRDD+RDRDYRRRSRSRSR+R+DRDRPHRSER+RYRSRSRSASPDR KDR RGRDD ERRSASHSDRSMSPARHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDADI
PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDE SP+RDNGSP+DKPVDSRSPSPAKSDAD+
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDADI
|
|
| A0A6J1K4H2 serine/arginine-rich splicing factor SC35-like isoform X2 | 2.1e-119 | 94.42 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
IRKG+VMESSSK RGRSRSRSPR RHRDD+RDRDYRRRSRSRSR+R+DRDRPHRSER+RYRSRSRSASPDR KDRRRGRDD ERRSASHSDRSMSPARHS
Subjt: IRKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHS
Query: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDADI
PDTRRSISPRRTPPSRGRSD+E SP+RDNGSP+DKPVDSRSPSPAKSDAD+
Subjt: PDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDADI
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P30352 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 5.3e-27 | 45.29 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
R+G + RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S RS R + + RS S S RS SP
Subjt: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
Query: --ARHSPDTRRSISPRRTPPSRG
R S RS SP ++P G
Subjt: --ARHSPDTRRSISPRRTPPSRG
|
|
| Q01130 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.6e-26 | 45.29 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S RS R + + RS S S RS SP
Subjt: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
Query: --ARHSPDTRRSISPRRTPPSRG
R S RS SP ++P G
Subjt: --ARHSPDTRRSISPRRTPPSRG
|
|
| Q3MHR5 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.6e-26 | 45.29 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S RS R + + RS S S RS SP
Subjt: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
Query: --ARHSPDTRRSISPRRTPPSRG
R S RS SP ++P G
Subjt: --ARHSPDTRRSISPRRTPPSRG
|
|
| Q62093 Serine/arginine-rich splicing factor 2 | 1.6e-26 | 45.29 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
+GR PPD+ SL V N+T+RT+ D L +F+KYG+V DV+IPRDR T +SRGFAFVR+ +A+ A+D +DG +LDGRE+ VQ A+YG P++
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYG--PNAEKI
Query: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
R+G RSRSPR R R R R RSRSRSR RY R + R R RSRSRS S RS R + + RS S S RS SP
Subjt: RKGRVMESSSKTRGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHS---DRSMSP--
Query: --ARHSPDTRRSISPRRTPPSRG
R S RS SP ++P G
Subjt: --ARHSPDTRRSISPRRTPPSRG
|
|
| Q9FMG4 Serine/arginine-rich splicing factor SC35 | 4.9e-65 | 62.59 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERD-RYRSRSRSASPDRSKDRR
I KGRV+E S ++R RS RSRSPR R RDD+R++DYR+RSRSRS DR R+R +RD R R+RSRSASPD K R
Subjt: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERD-RYRSRSRSASPDRSKDRR
Query: RGRDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSP-SPAKSDADISK
RGR D+E RS S S S SPAR SP RS SP++T P+R E+SP + + + P S SP SPA A SK
Subjt: RGRDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSP-SPAKSDADISK
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G55310.1 SC35-like splicing factor 33 | 2.5e-11 | 38.55 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGR
SLLV N+ +DL F+++G V D+++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG +L GRE+ V FA+ N +K + R E R R
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGR
Query: SRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYD----RDRPH----RSER-DRYRSRSRSASPDRSKDR--------RRGRDDDERRSASHSD-RSMSPAR
R R+P + R RSRSRS D Y R P R ER D RS SRS + D S+ R R RRS S S RS SP
Subjt: SRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYD----RDRPH----RSER-DRYRSRSRSASPDRSKDR--------RRGRDDDERRSASHSD-RSMSPAR
Query: HSPDTRRSISPRRT---PPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSP
SP RS+SPRR+ P R R SP+R S +P SRS SP
Subjt: HSPDTRRSISPRRT---PPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSP
|
|
| AT1G55310.2 SC35-like splicing factor 33 | 4.6e-10 | 33.05 | Show/hide |
Query: SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGR
SLLV N+ +DL F+++G V D+++PRD TGD RGF FV++ +A A +DG +L GRE+ V FA+ R
Subjt: SLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRKGRVMESSSKTRGR
Query: SRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRRTPPSR
+ R+R R R RD RR RY SRSRS P R + R R D H RS+SP D RRS S R+P S
Subjt: SRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRRTPPSR
Query: GRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDA
G L+P R SRS SP + +A
Subjt: GRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAKSDA
|
|
| AT3G13570.1 SC35-like splicing factor 30A | 3.6e-10 | 33.6 | Show/hide |
Query: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRK
FG S D+ SLLV N+ +DL F+++G V D+++PRD TGD RGF F+++ +A +A ++DG +L GRE+ V FA+ N +K +
Subjt: FGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEKIRK
Query: GRVMESSSKT-RGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSD---RSMSPAR-
R + ++ R + R RSP R RR RSRSR R P + R +SRS SP +DRR ++ RS H+ RS SP R
Subjt: GRVMESSSKT-RGRSRSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERDRYRSRSRSASPDRSKDRRRGRDDDERRSASHSD---RSMSPAR-
Query: --HSPDTRRSISPRRT---PPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAK
HS RRS+SPR+ P + RS + + + +P + + SP++
Subjt: --HSPDTRRSISPRRT---PPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSPSPAK
|
|
| AT5G64200.1 ortholog of human splicing factor SC35 | 3.5e-66 | 62.59 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERD-RYRSRSRSASPDRSKDRR
I KGRV+E S ++R RS RSRSPR R RDD+R++DYR+RSRSRS DR R+R +RD R R+RSRSASPD K R
Subjt: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERD-RYRSRSRSASPDRSKDRR
Query: RGRDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSP-SPAKSDADISK
RGR D+E RS S S S SPAR SP RS SP++T P+R E+SP + + + P S SP SPA A SK
Subjt: RGRDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSP-SPAKSDADISK
|
|
| AT5G64200.2 ortholog of human splicing factor SC35 | 3.5e-66 | 62.59 | Show/hide |
Query: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
MSHFGRSGPPDI DTYSLLVLNITFRTTADDLYPLF KYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKY DEA KA+++LDGR++DGREI VQFAKYGPNAEK
Subjt: MSHFGRSGPPDIRDTYSLLVLNITFRTTADDLYPLFDKYGKVVDVFIPRDRRTGDSRGFAFVRYKYADEAQKAIDKLDGRMLDGREIMVQFAKYGPNAEK
Query: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERD-RYRSRSRSASPDRSKDRR
I KGRV+E S ++R RS RSRSPR R RDD+R++DYR+RSRSRS DR R+R +RD R R+RSRSASPD K R
Subjt: IRKGRVME---SSSKTRGRS--------------------RSRSPRSRHRDDHRDRDYRRRSRSRSRDRYDRDRPHRSERD-RYRSRSRSASPDRSKDRR
Query: RGRDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSP-SPAKSDADISK
RGR D+E RS S S S SPAR SP RS SP++T P+R E+SP + + + P S SP SPA A SK
Subjt: RGRDDDERRSASHSDRSMSPARHSPDTRRSISPRRTPPSRGRSDDELSPKRDNGSPNDKPVDSRSP-SPAKSDADISK
|
|
