; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG08G013690 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG08G013690
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionWRKY protein
Genome locationCG_Chr08:26537072..26539209
RNA-Seq ExpressionClCG08G013690
SyntenyClCG08G013690
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR003657 - WRKY domain
IPR036576 - WRKY domain superfamily
IPR044810 - WRKY transcription factor, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0064890.1 putative WRKY transcription factor 40 [Cucumis melo var. makuwa]1.4e-12478.68Show/hide
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KAG6598546.1 putative WRKY transcription factor 40, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.6e-12377.04Show/hide
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XP_008445262.1 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 40 [Cucumis melo]2.2e-12579.43Show/hide
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XP_022961730.1 probable WRKY transcription factor 40 [Cucurbita moschata]4.6e-12376.73Show/hide
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XP_038885570.1 probable WRKY transcription factor 40 [Benincasa hispida]2.2e-13382.86Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BC94 probable WRKY transcription factor 401.1e-12579.43Show/hide
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A0A5A7VCH3 Putative WRKY transcription factor 407.0e-12578.68Show/hide
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A0A6J1HD49 probable WRKY transcription factor 402.2e-12376.73Show/hide
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A0A6J1K8R9 probable WRKY transcription factor 402.1e-12176.1Show/hide
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E7CEW3 WRKY protein8.0e-12178.98Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6IEL0 WRKY transcription factor WRKY714.5e-3634.01Show/hide
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Q6QHD1 WRKY transcription factor WRKY717.6e-3634.01Show/hide
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Q9C5T4 WRKY transcription factor 181.9e-4237.91Show/hide
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        ++    D +  F    S       S + D  ++             KRP  +S  K KV  V VPT  SD++L VKDG+QWRKYGQKVT+DNPSPRAY++
Subjt:  RKAAGCDNYCNFNRSGSDQYCGCCSDDNDSCYN-------------KRPRENS--KPKVMRVLVPTPVSDSTLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYK

Query:  CSFAPSCPVKRKVQRSVEDPSYLIATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLSSNLDSACGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTNSLKASLPQPETPSTTSASAS
        CSFAPSCPVK+KVQRS EDPS L+ATYEG HNH  PN+                          +S   S ++   +V    + +L + E  +T      
Subjt:  CSFAPSCPVKRKVQRSVEDPSYLIATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLSSNLDSACGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTNSLKASLPQPETPSTTSASAS

Query:  STQKLLVQQMATLLTKDPNFTRALATAITGNMVDK
          Q++L+QQMA+ LTKD  FT ALA AI+G ++++
Subjt:  STQKLLVQQMATLLTKDPNFTRALATAITGNMVDK

Q9SAH7 Probable WRKY transcription factor 407.1e-5042.68Show/hide
Query:  SSTTIKTSLDLNFNPPPYTADESPLTHTPSPLKEQAPAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENCNVLQHQVIDLMMKS-----------RKRKAAGCDN
        SS+ + TSLDL         +E P T           + L E+LNR+S+EN+KL++ML L+ +N NVL+ Q+++ + KS           +KRK+   ++
Subjt:  SSTTIKTSLDLNFNPPPYTADESPLTHTPSPLKEQAPAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENCNVLQHQVIDLMMKS-----------RKRKAAGCDN

Query:  YCNFNRSGSDQYCGCCSDDNDSCYNKRPRENSKPKVMRVLVPTPVSDSTLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPSCPVKRKVQRSVEDPSYL
          +    G          D   C  +R     K KV RV   T  SD+TLVVKDGYQWRKYGQKVT+DNPSPRAY+KC+ APSC VK+KVQRSVED S L
Subjt:  YCNFNRSGSDQYCGCCSDDNDSCYNKRPRENSKPKVMRVLVPTPVSDSTLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPSCPVKRKVQRSVEDPSYL

Query:  IATYEGEHNHAKP-----NSGIEYQLIGPIHLSSNLDSACGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTNSLKASLPQPETPSTTSASASSTQKLLVQQMATLLTKDP
        +ATYEGEHNH  P     N+G+        H+S       G +S+P ++ +  SL   + T  +  S  +  T  T+       QKLLV+QMA+ LTKDP
Subjt:  IATYEGEHNHAKP-----NSGIEYQLIGPIHLSSNLDSACGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTNSLKASLPQPETPSTTSASASSTQKLLVQQMATLLTKDP

Query:  NFTRALATAITGNM
        NFT ALA A+TG +
Subjt:  NFTRALATAITGNM

Q9SK33 Probable WRKY transcription factor 608.1e-3837.96Show/hide
Query:  LKEQAPAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENCNVLQHQVIDLMMKSRKRKAAGCDNYCNFNRSGS-----DQYCGCCSDDNDSCYNKRPRENSKPKVM
        +K++   +L +++NR++SEN+KL +ML  V E    L     +LM + + RK+    N+ N   +G      D++    S    S        N K  V 
Subjt:  LKEQAPAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENCNVLQHQVIDLMMKSRKRKAAGCDNYCNFNRSGS-----DQYCGCCSDDNDSCYNKRPRENSKPKVM

Query:  RVLVPTPVSDSTLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPSCPVKRKVQRSVEDPSYLIATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLSSNLDSACGV
                SD++L VKDGYQWRKYGQK+T+DNPSPRAY++CSF+PSC VK+KVQRS EDPS+L+ATYEG HNH  P++ +                    
Subjt:  RVLVPTPVSDSTLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPSCPVKRKVQRSVEDPSYLIATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLSSNLDSACGV

Query:  SSSPSSSVKSPSLMTSIVTNSLKASLPQPETPSTTSASASSTQKLLVQQMATLLTKDPNFTRALATAITGNMVD
                 S ++   +V   L+        P        + Q++LVQQMA+ LTKDP FT ALATAI+G +++
Subjt:  SSSPSSSVKSPSLMTSIVTNSLKASLPQPETPSTTSASASSTQKLLVQQMATLLTKDPNFTRALATAITGNMVD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18860.1 WRKY DNA-binding protein 618.7e-1938.86Show/hide
Query:  NFNRSGSDQYCGCCSDDNDSCYNKRPRENSKPKVMRVLVPTPVSDSTLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPSCPVKRKVQRSVEDPSYLIA
        N N+  S    G  +D +D          +  K  RV V +     T+   DG QWRKYGQK+ K NP PRAYY+C+ A SCPV+++VQR  ED S LI+
Subjt:  NFNRSGSDQYCGCCSDDNDSCYNKRPRENSKPKVMRVLVPTPVSDSTLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPSCPVKRKVQRSVEDPSYLIA

Query:  TYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLSSNLDSACGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTNSLKASLPQPETPSTTSASAS
        TYEG HNH  P S            S  L    G SSS S++     L  S+  N++    P+P+T    S S+S
Subjt:  TYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLSSNLDSACGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTNSLKASLPQPETPSTTSASAS

AT1G80840.1 WRKY DNA-binding protein 405.0e-5142.68Show/hide
Query:  SSTTIKTSLDLNFNPPPYTADESPLTHTPSPLKEQAPAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENCNVLQHQVIDLMMKS-----------RKRKAAGCDN
        SS+ + TSLDL         +E P T           + L E+LNR+S+EN+KL++ML L+ +N NVL+ Q+++ + KS           +KRK+   ++
Subjt:  SSTTIKTSLDLNFNPPPYTADESPLTHTPSPLKEQAPAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENCNVLQHQVIDLMMKS-----------RKRKAAGCDN

Query:  YCNFNRSGSDQYCGCCSDDNDSCYNKRPRENSKPKVMRVLVPTPVSDSTLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPSCPVKRKVQRSVEDPSYL
          +    G          D   C  +R     K KV RV   T  SD+TLVVKDGYQWRKYGQKVT+DNPSPRAY+KC+ APSC VK+KVQRSVED S L
Subjt:  YCNFNRSGSDQYCGCCSDDNDSCYNKRPRENSKPKVMRVLVPTPVSDSTLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPSCPVKRKVQRSVEDPSYL

Query:  IATYEGEHNHAKP-----NSGIEYQLIGPIHLSSNLDSACGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTNSLKASLPQPETPSTTSASASSTQKLLVQQMATLLTKDP
        +ATYEGEHNH  P     N+G+        H+S       G +S+P ++ +  SL   + T  +  S  +  T  T+       QKLLV+QMA+ LTKDP
Subjt:  IATYEGEHNHAKP-----NSGIEYQLIGPIHLSSNLDSACGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTNSLKASLPQPETPSTTSASASSTQKLLVQQMATLLTKDP

Query:  NFTRALATAITGNM
        NFT ALA A+TG +
Subjt:  NFTRALATAITGNM

AT2G25000.1 WRKY DNA-binding protein 605.8e-3937.96Show/hide
Query:  LKEQAPAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENCNVLQHQVIDLMMKSRKRKAAGCDNYCNFNRSGS-----DQYCGCCSDDNDSCYNKRPRENSKPKVM
        +K++   +L +++NR++SEN+KL +ML  V E    L     +LM + + RK+    N+ N   +G      D++    S    S        N K  V 
Subjt:  LKEQAPAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENCNVLQHQVIDLMMKSRKRKAAGCDNYCNFNRSGS-----DQYCGCCSDDNDSCYNKRPRENSKPKVM

Query:  RVLVPTPVSDSTLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPSCPVKRKVQRSVEDPSYLIATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLSSNLDSACGV
                SD++L VKDGYQWRKYGQK+T+DNPSPRAY++CSF+PSC VK+KVQRS EDPS+L+ATYEG HNH  P++ +                    
Subjt:  RVLVPTPVSDSTLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPSCPVKRKVQRSVEDPSYLIATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLSSNLDSACGV

Query:  SSSPSSSVKSPSLMTSIVTNSLKASLPQPETPSTTSASASSTQKLLVQQMATLLTKDPNFTRALATAITGNMVD
                 S ++   +V   L+        P        + Q++LVQQMA+ LTKDP FT ALATAI+G +++
Subjt:  SSSPSSSVKSPSLMTSIVTNSLKASLPQPETPSTTSASASSTQKLLVQQMATLLTKDPNFTRALATAITGNMVD

AT4G31800.1 WRKY DNA-binding protein 181.3e-4337.91Show/hide
Query:  MESSTTIKTSLDLNFNP-----PPYTADESPLTHTPSPLKEQ--APAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENCNVLQHQVIDLMMKSR----------K
        M+ S+ +  SLDLN NP     P         TH      EQ  + + L E+LNR++SEN+KL +ML  V E+ N L + +  L  +            K
Subjt:  MESSTTIKTSLDLNFNP-----PPYTADESPLTHTPSPLKEQ--APAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENCNVLQHQVIDLMMKSR----------K

Query:  RKAAGCDNYCNFNRSGSDQYCGCCSDDNDSCYN-------------KRPRENS--KPKVMRVLVPTPVSDSTLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYK
        ++    D +  F    S       S + D  ++             KRP  +S  K KV  V VPT  SD++L VKDG+QWRKYGQKVT+DNPSPRAY++
Subjt:  RKAAGCDNYCNFNRSGSDQYCGCCSDDNDSCYN-------------KRPRENS--KPKVMRVLVPTPVSDSTLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYK

Query:  CSFAPSCPVKRKVQRSVEDPSYLIATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLSSNLDSACGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTNSLKASLPQPETPSTTSASAS
        CSFAPSCPVK+KVQRS EDPS L+ATYEG HNH  PN+                          +S   S ++   +V    + +L + E  +T      
Subjt:  CSFAPSCPVKRKVQRSVEDPSYLIATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLSSNLDSACGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTNSLKASLPQPETPSTTSASAS

Query:  STQKLLVQQMATLLTKDPNFTRALATAITGNMVDK
          Q++L+QQMA+ LTKD  FT ALA AI+G ++++
Subjt:  STQKLLVQQMATLLTKDPNFTRALATAITGNMVDK

AT4G31800.2 WRKY DNA-binding protein 181.7e-4338.02Show/hide
Query:  MESSTTIKTSLDLNFNP----PPYTADESPLTHTPSPLKEQ--APAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENCNVLQHQVIDLMMKSR----------KR
        M+ S+ +  SLDLN NP     P        TH      EQ  + + L E+LNR++SEN+KL +ML  V E+ N L + +  L  +            K+
Subjt:  MESSTTIKTSLDLNFNP----PPYTADESPLTHTPSPLKEQ--APAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENCNVLQHQVIDLMMKSR----------KR

Query:  KAAGCDNYCNFNRSGSDQYCGCCSDDNDSCYN-------------KRPRENS--KPKVMRVLVPTPVSDSTLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKC
        +    D +  F    S       S + D  ++             KRP  +S  K KV  V VPT  SD++L VKDG+QWRKYGQKVT+DNPSPRAY++C
Subjt:  KAAGCDNYCNFNRSGSDQYCGCCSDDNDSCYN-------------KRPRENS--KPKVMRVLVPTPVSDSTLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKC

Query:  SFAPSCPVKRKVQRSVEDPSYLIATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLSSNLDSACGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTNSLKASLPQPETPSTTSASASS
        SFAPSCPVK+KVQRS EDPS L+ATYEG HNH  PN+                          +S   S ++   +V    + +L + E  +T       
Subjt:  SFAPSCPVKRKVQRSVEDPSYLIATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLSSNLDSACGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTNSLKASLPQPETPSTTSASASS

Query:  TQKLLVQQMATLLTKDPNFTRALATAITGNMVDK
         Q++L+QQMA+ LTKD  FT ALA AI+G ++++
Subjt:  TQKLLVQQMATLLTKDPNFTRALATAITGNMVDK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAATCCTCAACTACCATCAAAACCTCTCTCGACCTTAATTTCAATCCTCCGCCGTACACCGCCGACGAATCTCCTCTCACTCACACTCCTTCTCCACTCAAAGAACA
GGCTCCAGCCATTCTTGCGGAAAAATTGAATCGGATAAGTTCGGAGAATCAGAAACTGAATCAGATGCTAGGGCTGGTGGTTGAGAATTGCAATGTTCTGCAACATCAGG
TAATCGATTTGATGATGAAATCCAGGAAACGAAAAGCTGCAGGCTGCGATAATTATTGCAATTTCAATCGGAGCGGATCCGATCAATATTGCGGTTGCTGTAGCGACGAT
AATGATTCGTGTTACAACAAAAGGCCTAGAGAAAACAGTAAACCCAAGGTTATGAGAGTTTTGGTTCCCACGCCCGTTTCCGATTCCACCTTGGTTGTGAAGGATGGATA
TCAATGGAGGAAATATGGTCAAAAGGTGACTAAAGACAATCCTTCCCCAAGAGCTTACTATAAATGCTCATTTGCCCCTAGCTGTCCGGTGAAGAGAAAGGTTCAAAGAA
GTGTTGAAGATCCATCTTATTTAATAGCTACATATGAAGGAGAGCACAATCATGCAAAACCCAATTCAGGAATTGAGTATCAATTAATTGGACCAATTCATTTAAGTTCA
AACCTTGATTCTGCTTGTGGTGTTTCATCATCACCTTCTTCCTCAGTCAAATCTCCATCATTAATGACTTCTATTGTCACTAACTCTTTGAAAGCTTCACTTCCACAACC
TGAGACACCCTCAACTACTTCAGCTTCAGCTTCTTCAACTCAAAAGCTTCTAGTTCAACAAATGGCTACCCTTTTGACCAAAGATCCAAATTTCACTAGAGCCCTTGCCA
CTGCCATTACTGGAAATATGGTAGATAAAGAAATTTGGCGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAATCCTCAACTACCATCAAAACCTCTCTCGACCTTAATTTCAATCCTCCGCCGTACACCGCCGACGAATCTCCTCTCACTCACACTCCTTCTCCACTCAAAGAACA
GGCTCCAGCCATTCTTGCGGAAAAATTGAATCGGATAAGTTCGGAGAATCAGAAACTGAATCAGATGCTAGGGCTGGTGGTTGAGAATTGCAATGTTCTGCAACATCAGG
TAATCGATTTGATGATGAAATCCAGGAAACGAAAAGCTGCAGGCTGCGATAATTATTGCAATTTCAATCGGAGCGGATCCGATCAATATTGCGGTTGCTGTAGCGACGAT
AATGATTCGTGTTACAACAAAAGGCCTAGAGAAAACAGTAAACCCAAGGTTATGAGAGTTTTGGTTCCCACGCCCGTTTCCGATTCCACCTTGGTTGTGAAGGATGGATA
TCAATGGAGGAAATATGGTCAAAAGGTGACTAAAGACAATCCTTCCCCAAGAGCTTACTATAAATGCTCATTTGCCCCTAGCTGTCCGGTGAAGAGAAAGGTTCAAAGAA
GTGTTGAAGATCCATCTTATTTAATAGCTACATATGAAGGAGAGCACAATCATGCAAAACCCAATTCAGGAATTGAGTATCAATTAATTGGACCAATTCATTTAAGTTCA
AACCTTGATTCTGCTTGTGGTGTTTCATCATCACCTTCTTCCTCAGTCAAATCTCCATCATTAATGACTTCTATTGTCACTAACTCTTTGAAAGCTTCACTTCCACAACC
TGAGACACCCTCAACTACTTCAGCTTCAGCTTCTTCAACTCAAAAGCTTCTAGTTCAACAAATGGCTACCCTTTTGACCAAAGATCCAAATTTCACTAGAGCCCTTGCCA
CTGCCATTACTGGAAATATGGTAGATAAAGAAATTTGGCGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MESSTTIKTSLDLNFNPPPYTADESPLTHTPSPLKEQAPAILAEKLNRISSENQKLNQMLGLVVENCNVLQHQVIDLMMKSRKRKAAGCDNYCNFNRSGSDQYCGCCSDD
NDSCYNKRPRENSKPKVMRVLVPTPVSDSTLVVKDGYQWRKYGQKVTKDNPSPRAYYKCSFAPSCPVKRKVQRSVEDPSYLIATYEGEHNHAKPNSGIEYQLIGPIHLSS
NLDSACGVSSSPSSSVKSPSLMTSIVTNSLKASLPQPETPSTTSASASSTQKLLVQQMATLLTKDPNFTRALATAITGNMVDKEIWR