; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG09G006060 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG09G006060
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
Descriptionrapid alkalinization factor-like
Genome locationCG_Chr09:5190077..5195348
RNA-Seq ExpressionClCG09G006060
SyntenyClCG09G006060
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7014377.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-4479.66Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAK+S LLPF FIAA L V ST V AT+TK PSWVLD A A CHGSMA+CMMD+IEF+M+SEINRRILAD+NYISYDAL+ N VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGCSAI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

XP_011659776.1 rapid alkalinization factor [Cucumis sativus]6.0e-4378.81Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MA  VS LLP F + AIL VSSTA      KTPSWVLD A A CHGSMAECMM++IEF+M+SEINRRILADLNYISYDALK N+VPCSRKGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGC+AISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

XP_022153599.1 protein RALF-like 33 [Momordica charantia]4.0e-4783.9Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAKVS LLPF  I AIL VSSTAVFA ST++PSWVLD ARA CHGSMAECMMD IE+EMNSEINRRILA  NYISY+ALK NTVPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGCSAI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

XP_022953165.1 rapid alkalinization factor-like [Cucurbita moschata]6.4e-4580.51Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAK+S LLPF FIAA L V STAV AT+TK PSWVLD A A CHGSMA+CMMD+IEF+M+SEINRRILAD+NYISYDAL+ N VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGCSAI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

XP_038896330.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]3.8e-5087.29Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAKVS LLPFF +AAIL VSSTAV  TSTKTPSWVLD ARA CHGSMAECMM +IEFEMNS+INRRILADLNYISYDALK NTVPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGC+AISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K607 Uncharacterized protein2.9e-4378.81Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MA  VS LLP F + AIL VSSTA      KTPSWVLD A A CHGSMAECMM++IEF+M+SEINRRILADLNYISYDALK N+VPCSRKGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGC+AISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

A0A1S3BRF1 rapid alkalinization factor-like3.2e-4277.97Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAKVS LLP F + AIL VSSTA       TPSWVL  A A CHGSMAECM ++IEFEM+SEINRRILADLNYISYDAL+ N+VPCSRKGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGC+AISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

A0A5A7VLB3 Rapid alkalinization factor-like3.2e-4277.97Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAKVS LLP F + AIL VSSTA       TPSWVL  A A CHGSMAECM ++IEFEM+SEINRRILADLNYISYDAL+ N+VPCSRKGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGC+AISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

A0A6J1DJJ4 protein RALF-like 331.9e-4783.9Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAKVS LLPF  I AIL VSSTAVFA ST++PSWVLD ARA CHGSMAECMMD IE+EMNSEINRRILA  NYISY+ALK NTVPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGCSAI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

A0A6J1GNW5 rapid alkalinization factor-like3.1e-4580.51Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAK+S LLPF FIAA L V STAV AT+TK PSWVLD A A CHGSMA+CMMD+IEF+M+SEINRRILAD+NYISYDAL+ N VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGCSAI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 331.7e-2456.64Show/hide
Query:  SLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNI--EFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN
        S  P   I AIL V    +FA  T   S       + C+G++AEC +     EFEM+SEINRRILA   YISY AL+ NTVPCSR+GASYYNC+ GA+AN
Subjt:  SLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNI--EFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN

Query:  PYNRGCSAISRCR
        PY+RGCSAI+RCR
Subjt:  PYNRGCSAISRCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor2.0e-2564.71Show/hide
Query:  WVLDA-ARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCRS
        WV+ A +   C GS+ EC+ +  EFE++SE NRRILA   YISY AL+ N+VPCSR+GASYYNC+PGA+ANPY+RGCSAI+RCRS
Subjt:  WVLDA-ARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCRS

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 231.8e-2147.29Show/hide
Query:  SSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTP-SWVLDAARAHCHGSMAECMMD----------------NIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCS
        S     F I  IL V + +V  +S  T  +         C G++AEC +                   EFEM+SEINRRILA   YISY AL+ NT+PCS
Subjt:  SSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTP-SWVLDAARAHCHGSMAECMMD----------------NIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCS

Query:  RKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCR
        R+GASYYNC+ GA+ANPY+RGCSAI+RCR
Subjt:  RKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCR

Q9MA62 Protein RALF-like 222.7e-2252.21Show/hide
Query:  FFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARA-------HCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN
        + + AIL +  +AV +T     S  LD  RA        C GS+AEC+ +  E E +S+I+RRILA   YISY A++ N+VPCSR+GASYYNCQ GA+AN
Subjt:  FFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARA-------HCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN

Query:  PYNRGCSAISRCR
        PY+RGCS I+RCR
Subjt:  PYNRGCSAISRCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 12.4e-2355.96Show/hide
Query:  IAAILMVSSTAV---FATSTKTPSWVLDAAR-AHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRG
        I  + ++SS  V   FA      +W       + CHGS+AEC+    E EM+SEINRRILA   YISY +LK N+VPCSR+GASYYNCQ GA+ANPY+RG
Subjt:  IAAILMVSSTAV---FATSTKTPSWVLDAAR-AHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRG

Query:  CSAISRCRS
        CS I+RCRS
Subjt:  CSAISRCRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 11.7e-2455.96Show/hide
Query:  IAAILMVSSTAV---FATSTKTPSWVLDAAR-AHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRG
        I  + ++SS  V   FA      +W       + CHGS+AEC+    E EM+SEINRRILA   YISY +LK N+VPCSR+GASYYNCQ GA+ANPY+RG
Subjt:  IAAILMVSSTAV---FATSTKTPSWVLDAAR-AHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRG

Query:  CSAISRCRS
        CS I+RCRS
Subjt:  CSAISRCRS

AT2G33775.1 ralf-like 198.1e-1443.27Show/hide
Query:  IAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRR-ILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSA
        I  IL + + AV A S    +W L  +  +  G + E     +++ M+SE NRR + A  +YISY AL+ N VPCSR+G SYY+C+    ANPY RGCS 
Subjt:  IAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRR-ILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSA

Query:  ISRC
        I+ C
Subjt:  ISRC

AT3G05490.1 ralf-like 221.9e-2352.21Show/hide
Query:  FFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARA-------HCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN
        + + AIL +  +AV +T     S  LD  RA        C GS+AEC+ +  E E +S+I+RRILA   YISY A++ N+VPCSR+GASYYNCQ GA+AN
Subjt:  FFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARA-------HCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN

Query:  PYNRGCSAISRCR
        PY+RGCS I+RCR
Subjt:  PYNRGCSAISRCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.2e-2247.29Show/hide
Query:  SSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTP-SWVLDAARAHCHGSMAECMMD----------------NIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCS
        S     F I  IL V + +V  +S  T  +         C G++AEC +                   EFEM+SEINRRILA   YISY AL+ NT+PCS
Subjt:  SSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTP-SWVLDAARAHCHGSMAECMMD----------------NIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCS

Query:  RKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCR
        R+GASYYNC+ GA+ANPY+RGCSAI+RCR
Subjt:  RKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCR

AT4G15800.1 ralf-like 331.2e-2556.64Show/hide
Query:  SLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNI--EFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN
        S  P   I AIL V    +FA  T   S       + C+G++AEC +     EFEM+SEINRRILA   YISY AL+ NTVPCSR+GASYYNC+ GA+AN
Subjt:  SLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNI--EFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN

Query:  PYNRGCSAISRCR
        PY+RGCSAI+RCR
Subjt:  PYNRGCSAISRCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTAGCACTCGATGTTAAAGTTTTTCGATTTGCTTCAAATTTTGAGTACCTTGAAGGACCACCTCCTATTGGTGCTCAAAAGGCTAATTTAGATCATGTCTACGCTAA
CATCTTCGAGGAATTTGGATACCAAGAACTTGGACAACTAGGCGGCCTCGCTGCTTGGTGGCAAAATGTCGTTATACGAACATTGTTGTACCAAAGGGCTAACGAGATTG
TGGTTCCATATAACCTAACCGTGGCAAAGTCCACTAACCTCACCTCAACGCTAGCAAACCAGCTTGGGAAATGTGGGCTCAAAGACGAAGGGATTGTGGTCCCTCGATCG
CTCGTGGTAGAGAATCAAACCGAGAGCAACATTCTCGCTACCGACGTTAACTCTCTTCGTATTCTCGAACAATACAAGAGATCTTACGGATATTGTATGGAAGTGGTAGT
GAAACTAAGGCTGGTGCCTTTTTTTCCAAGGGTGCTGATGATTAAAGAAGTGGGTTGTATAGACATACCAAGGAGAGCAGAGAAAGCAACAATGGCAGCCAAGGTTTCTT
CTCTCCTACCATTTTTCTTTATCGCTGCAATCCTGATGGTCTCCTCCACTGCGGTATTTGCCACCAGCACCAAGACCCCAAGCTGGGTCCTCGATGCAGCTCGAGCTCAC
TGTCACGGCTCCATGGCAGAGTGCATGATGGACAATATTGAATTTGAGATGAACTCTGAGATCAATAGACGCATATTGGCAGATTTAAACTACATAAGCTACGACGCGCT
CAAGGTCAACACAGTGCCATGCTCACGCAAAGGAGCATCTTACTACAATTGTCAGCCAGGTGCCGAAGCCAACCCCTACAACCGTGGCTGCAGTGCTATTTCTCGTTGCC
GAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTAGCACTCGATGTTAAAGTTTTTCGATTTGCTTCAAATTTTGAGTACCTTGAAGGACCACCTCCTATTGGTGCTCAAAAGGCTAATTTAGATCATGTCTACGCTAA
CATCTTCGAGGAATTTGGATACCAAGAACTTGGACAACTAGGCGGCCTCGCTGCTTGGTGGCAAAATGTCGTTATACGAACATTGTTGTACCAAAGGGCTAACGAGATTG
TGGTTCCATATAACCTAACCGTGGCAAAGTCCACTAACCTCACCTCAACGCTAGCAAACCAGCTTGGGAAATGTGGGCTCAAAGACGAAGGGATTGTGGTCCCTCGATCG
CTCGTGGTAGAGAATCAAACCGAGAGCAACATTCTCGCTACCGACGTTAACTCTCTTCGTATTCTCGAACAATACAAGAGATCTTACGGATATTGTATGGAAGTGGTAGT
GAAACTAAGGCTGGTGCCTTTTTTTCCAAGGGTGCTGATGATTAAAGAAGTGGGTTGTATAGACATACCAAGGAGAGCAGAGAAAGCAACAATGGCAGCCAAGGTTTCTT
CTCTCCTACCATTTTTCTTTATCGCTGCAATCCTGATGGTCTCCTCCACTGCGGTATTTGCCACCAGCACCAAGACCCCAAGCTGGGTCCTCGATGCAGCTCGAGCTCAC
TGTCACGGCTCCATGGCAGAGTGCATGATGGACAATATTGAATTTGAGATGAACTCTGAGATCAATAGACGCATATTGGCAGATTTAAACTACATAAGCTACGACGCGCT
CAAGGTCAACACAGTGCCATGCTCACGCAAAGGAGCATCTTACTACAATTGTCAGCCAGGTGCCGAAGCCAACCCCTACAACCGTGGCTGCAGTGCTATTTCTCGTTGCC
GAAGCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVALDVKVFRFASNFEYLEGPPPIGAQKANLDHVYANIFEEFGYQELGQLGGLAAWWQNVVIRTLLYQRANEIVVPYNLTVAKSTNLTSTLANQLGKCGLKDEGIVVPRS
LVVENQTESNILATDVNSLRILEQYKRSYGYCMEVVVKLRLVPFFPRVLMIKEVGCIDIPRRAEKATMAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAH
CHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILADLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCRS