; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG09G009930 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG09G009930
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionExtensin-3-like
Genome locationCG_Chr09:9694679..9694939
RNA-Seq ExpressionClCG09G009930
SyntenyClCG09G009930
Gene Ontology termsGO:0009664 - plant-type cell wall organization (biological process)
GO:0005199 - structural constituent of cell wall (molecular function)
InterPro domainsIPR006706 - Extensin domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0048790.1 extensin-3-like [Cucumis melo var. makuwa]1.9e-2680.23Show/hide
Query:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY
        M + RS MAYLV  ILVATLSL SV A  YVYSSPPPPYYVYKSP PP+Y SPPPPKVKYEYKSPPPP+Y+SPPPP+YHSPPPP+Y
Subjt:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY

TYK31543.1 extensin-3-like [Cucumis melo var. makuwa]1.9e-2680.23Show/hide
Query:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY
        M + RS MAYLV  ILVATLSL SV A  YVYSSPPPPYYVYKSP PP+Y SPPPPKVKYEYKSPPPP+Y+SPPPP+YHSPPPP+Y
Subjt:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY

XP_022976064.1 extensin-3-like isoform X1 [Cucurbita maxima]5.1e-2780.23Show/hide
Query:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY
        MG+ RSSMAYL+  +LVATLSL SV A +YVYSSPPPPYY Y SP PP+Y SPPPPKVKYEY SPPPPVYYSPPPP+YHSPPPPVY
Subjt:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY

XP_022976065.1 extensin-3-like isoform X2 [Cucurbita maxima]5.1e-2780.23Show/hide
Query:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY
        MG+ RSSMAYL+  +LVATLSL SV A +YVYSSPPPPYY Y SP PP+Y SPPPPKVKYEY SPPPPVYYSPPPP+YHSPPPPVY
Subjt:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY

XP_023535223.1 extensin-3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.9e-2682.76Show/hide
Query:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKS-PPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY
        MG+ RSSMAYLV  ILVATLSL SV A +YVYSSPPPPYY Y SP PP+Y SPPPPKVKYEYKS PPPPVYYSPPPP+YHSPPPPVY
Subjt:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKS-PPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7U062 Extensin-3-like9.3e-2780.23Show/hide
Query:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY
        M + RS MAYLV  ILVATLSL SV A  YVYSSPPPPYYVYKSP PP+Y SPPPPKVKYEYKSPPPP+Y+SPPPP+YHSPPPP+Y
Subjt:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY

A0A5D3E640 Extensin-3-like9.3e-2780.23Show/hide
Query:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY
        M + RS MAYLV  ILVATLSL SV A  YVYSSPPPPYYVYKSP PP+Y SPPPPKVKYEYKSPPPP+Y+SPPPP+YHSPPPP+Y
Subjt:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY

A0A6J1IER1 extensin-3-like1.2e-2680.23Show/hide
Query:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY
        MG  + SMAYLV  +LVA LS  SVIA +Y YSSPPPPYYVYKSP PP+Y SPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPP+YHSPPPPVY
Subjt:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY

A0A6J1IIH0 extensin-3-like isoform X22.5e-2780.23Show/hide
Query:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY
        MG+ RSSMAYL+  +LVATLSL SV A +YVYSSPPPPYY Y SP PP+Y SPPPPKVKYEY SPPPPVYYSPPPP+YHSPPPPVY
Subjt:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY

A0A6J1IMG6 extensin-3-like isoform X12.5e-2780.23Show/hide
Query:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY
        MG+ RSSMAYL+  +LVATLSL SV A +YVYSSPPPPYY Y SP PP+Y SPPPPKVKYEY SPPPPVYYSPPPP+YHSPPPPVY
Subjt:  MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65375 Leucine-rich repeat extensin-like protein 12.1e-0768.42Show/hide
Query:  YVYSSPPPPYYVYKSPLPP--IYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPP
        YVYSSPPPP YVY SP PP  +Y SPPPP   Y Y SPPPP  YS PPP   SPPPP
Subjt:  YVYSSPPPPYYVYKSPLPP--IYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPP

P06599 Extensin2.7e-0758.82Show/hide
Query:  NYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPP-PIY---------HSPPPPVY
        +Y Y SPPPP  VYKSP PP + SPPPP   Y+YKSPPPP++  PPP P+Y         HSPPPPVY
Subjt:  NYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPP-PIY---------HSPPPPVY

Q38913 Extensin-18.5e-0952.22Show/hide
Query:  ILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPP--YY----VYKSP--------LPPIYQSPPPPKVKYE----YKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY
        +L  +L+  S    NY YSSPPPP  +Y    VYKSP         PP+Y+SPPPP   Y     YKSPPPPV Y  PPP+Y SPPPPVY
Subjt:  ILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPP--YY----VYKSP--------LPPIYQSPPPPKVKYE----YKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY

Q9FS16 Extensin-33.3e-1359.3Show/hide
Query:  SSMAYLVVAILVATLSLK--SVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPL-----PPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPP
        S MA LV  +LV T+SL   S    NY YSSPPPP   Y  P+     PP+Y SPPPPK  YEYKSPPPPV +  PPP+YHSPPPP
Subjt:  SSMAYLVVAILVATLSLK--SVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPL-----PPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPP

Q9M1G9 Extensin-21.6e-0761.76Show/hide
Query:  YVYSSPPPPYY------VYKSPLPP-IYQSPPP----PKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY
        YVYSSPPPPYY       YKSP PP +Y SPPP    P  K  YKSPPPP  YS PPP Y+SP P VY
Subjt:  YVYSSPPPPYY------VYKSPLPP-IYQSPPP----PKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G21310.1 extensin 32.4e-1459.3Show/hide
Query:  SSMAYLVVAILVATLSLK--SVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPL-----PPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPP
        S MA LV  +LV T+SL   S    NY YSSPPPP   Y  P+     PP+Y SPPPPK  YEYKSPPPPV +  PPP+YHSPPPP
Subjt:  SSMAYLVVAILVATLSLK--SVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPL-----PPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPP

AT1G26240.1 Proline-rich extensin-like family protein1.2e-1071.43Show/hide
Query:  YVYSSPPPPYYVYKSPLPP--IYQSPPPPKVKYEYKSPPPP--VYYSPPPP--IYHSPPPPVY
        YVYSSPPPP YVYKSP PP  +Y SPPPP   Y YKSPPPP  VY SPPPP  +Y SPPPP Y
Subjt:  YVYSSPPPPYYVYKSPLPP--IYQSPPPPKVKYEYKSPPPP--VYYSPPPP--IYHSPPPPVY

AT1G26250.1 Proline-rich extensin-like family protein2.7e-1068.85Show/hide
Query:  YVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPP--VYYSPPPP--IYHSPPPPVY
        YVYSSPPPP YVYKSP PP Y   PPP   Y Y+SPPPP  VY SPPPP  +Y SPPPP Y
Subjt:  YVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPP--VYYSPPPP--IYHSPPPPVY

AT1G76930.1 extensin 46.0e-1052.22Show/hide
Query:  ILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPP--YY----VYKSP--------LPPIYQSPPPPKVKYE----YKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY
        +L  +L+  S    NY YSSPPPP  +Y    VYKSP         PP+Y+SPPPP   Y     YKSPPPPV Y  PPP+Y SPPPPVY
Subjt:  ILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPP--YY----VYKSP--------LPPIYQSPPPPKVKYE----YKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY

AT1G76930.2 extensin 46.0e-1052.22Show/hide
Query:  ILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPP--YY----VYKSP--------LPPIYQSPPPPKVKYE----YKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY
        +L  +L+  S    NY YSSPPPP  +Y    VYKSP         PP+Y+SPPPP   Y     YKSPPPPV Y  PPP+Y SPPPPVY
Subjt:  ILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPP--YY----VYKSP--------LPPIYQSPPPPKVKYE----YKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAAGATTTAGGTCATCAATGGCCTACCTAGTAGTAGCAATTTTGGTGGCAACTTTGAGTTTGAAATCGGTAATCGCTACCAATTATGTGTATTCTTCTCCACCACC
TCCTTACTATGTTTACAAATCTCCTCTTCCTCCTATCTATCAATCTCCCCCACCACCAAAAGTAAAGTATGAGTACAAATCACCGCCACCTCCAGTTTATTACTCTCCTC
CACCTCCTATTTACCATTCTCCTCCTCCTCCAGTTTACTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGAAGATTTAGGTCATCAATGGCCTACCTAGTAGTAGCAATTTTGGTGGCAACTTTGAGTTTGAAATCGGTAATCGCTACCAATTATGTGTATTCTTCTCCACCACC
TCCTTACTATGTTTACAAATCTCCTCTTCCTCCTATCTATCAATCTCCCCCACCACCAAAAGTAAAGTATGAGTACAAATCACCGCCACCTCCAGTTTATTACTCTCCTC
CACCTCCTATTTACCATTCTCCTCCTCCTCCAGTTTACTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGRFRSSMAYLVVAILVATLSLKSVIATNYVYSSPPPPYYVYKSPLPPIYQSPPPPKVKYEYKSPPPPVYYSPPPPIYHSPPPPVY