; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG09G018240 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG09G018240
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
Descriptionmini zinc finger protein 2
Genome locationCG_Chr09:35237504..35238233
RNA-Seq ExpressionClCG09G018240
SyntenyClCG09G018240
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006456 - ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8648921.1 hypothetical protein Csa_008227 [Cucumis sativus]6.0e-3795.18Show/hide
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XP_004148693.1 mini zinc finger protein 2 [Cucumis sativus]2.1e-3795.24Show/hide
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XP_016902406.1 PREDICTED: mini zinc finger protein 2 [Cucumis melo]8.3e-3997.62Show/hide
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XP_022939280.1 mini zinc finger protein 2-like [Cucurbita moschata]6.0e-3794.05Show/hide
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XP_038890678.1 mini zinc finger protein 2-like [Benincasa hispida]6.4e-3996.43Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KVJ7 Transcription factor9.9e-3895.24Show/hide
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A0A1S4E2E9 mini zinc finger protein 24.0e-3997.62Show/hide
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A0A5D3CUT9 Mini zinc finger protein 24.0e-3997.62Show/hide
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A0A6J1FM92 mini zinc finger protein 2-like2.9e-3794.05Show/hide
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A0A6J1K0U7 mini zinc finger protein 21.1e-3692.86Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BIU8 Mini zinc finger protein 14.0e-2081.13Show/hide
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Q0J5F8 Mini zinc finger protein 43.7e-2158.82Show/hide
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        M KR V+LRR E P  +  A+           VRYGEC++NHAA +GG+AVDGCREF+A G+EGT  AL CAACGCHR+FHRR V
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Q2Q493 Mini zinc finger protein 31.5e-2265.48Show/hide
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        M+KRQVV+++ +     T +SS    +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGCREFMASG +    ALTCAACGCHRNFHRR+V TEV
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Q9CA51 Mini zinc finger protein 11.3e-2358.7Show/hide
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        M+KRQ+V+++    S          + +SS  + +VRY ECQKNHAA +GGYAVDGCREFMA+G EGT  AL CAACGCHRNFHR++V TEV
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Q9LJW5 Mini zinc finger protein 21.3e-3180.68Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18835.1 mini zinc finger1.1e-2365.48Show/hide
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AT1G74660.1 mini zinc finger 19.5e-2558.7Show/hide
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AT3G28917.1 mini zinc finger 29.5e-3380.68Show/hide
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AT3G50890.1 homeobox protein 281.5e-1765.45Show/hide
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        +  +Y ECQKNHAA  GG+ VDGC EFMA G+EGT  AL CAAC CHR+FHR++V
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AT4G24660.1 homeobox protein 225.1e-1862.3Show/hide
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        +RY EC KNHA  +GG+AVDGC EFM SG++GT  AL CAACGCHRNFHR++   +G   H
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATTTCCATAGAAGGCAAGTTGGAACTGAGGTTCATTTGTGGATTAAAAAGTTATGTAAATTTCTTTTCCACTATATCTCTTATGAACTATATGTATTTGATTTGAGTGTA
TCAATTATCTTTATTGCACTATCTTTTAGCTTTCAGTATTTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGGAAGCGTCAAGTTGTGCTTAGAAGATCAGAAGAACCCTCAAGGGAGACTGTGGCTTCCTCTTTCACAGTAAGGAGTGTAAGATATGGGGAGTGCCAAAAGAACCA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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SIIFIALSFSFQYL