; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG09G019130 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG09G019130
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
Descriptionglutaredoxin
Genome locationCG_Chr09:36393478..36395267
RNA-Seq ExpressionClCG09G019130
SyntenyClCG09G019130
Gene Ontology termsGO:0034599 - cellular response to oxidative stress (biological process)
GO:0098869 - cellular oxidant detoxification (biological process)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0004362 - glutathione-disulfide reductase activity (molecular function)
GO:0097573 - glutathione oxidoreductase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578661.1 Isocitrate dehydrogenase [NADP], chloroplastic/mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.8e-4488.79Show/hide
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KAG7016200.1 hypothetical protein SDJN02_21305 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.8e-4488.79Show/hide
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XP_008458784.1 PREDICTED: glutaredoxin-C6 [Cucumis melo]1.3e-4387.85Show/hide
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XP_022993774.1 glutaredoxin isoform X1 [Cucurbita maxima]3.4e-4489.72Show/hide
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XP_038889541.1 glutaredoxin-like [Benincasa hispida]7.2e-4793.46Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KR45 Glutaredoxin3.1e-4385.98Show/hide
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A0A1S3C8S5 glutaredoxin-C66.2e-4487.85Show/hide
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A0A5A7T277 Glutaredoxin-C66.2e-4487.85Show/hide
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A0A6J1FDX0 glutaredoxin1.4e-4387.85Show/hide
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A0A6J1K114 glutaredoxin isoform X11.6e-4489.72Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P55142 Glutaredoxin-C61.2e-3672.82Show/hide
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P55143 Glutaredoxin1.9e-3772.55Show/hide
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Q6K953 Glutaredoxin-C4, chloroplastic2.7e-3672.64Show/hide
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Q9FNE2 Glutaredoxin-C22.1e-3671.96Show/hide
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Q9ZR41 Glutaredoxin2.0e-3975Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G20270.1 Thioredoxin superfamily protein4.3e-2155.67Show/hide
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        E  K  VA NPV V+SKT+C Y  QVK L   L      VELD   S+GS++Q  L + TGQ TVPNVFIGGKHIGGC  T+ L+ KG L  +LAEA
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AT4G28730.1 Glutaredoxin family protein6.2e-2050.52Show/hide
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        E  ++ V  N V ++SKT+C YC +VK L  +LG     VELD     G ++Q  L + TGQ TVPNVF+ GKHIGGC  TV LN KG L  +LAEA
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AT5G40370.1 Glutaredoxin family protein1.5e-3771.96Show/hide
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        MA++K KEIV S  V VFSKTYCPYCV+VK LL +LGA FKAVELDTESDGS++Q+ L ++TGQRTVPNVFIGG HIGGCDAT  L+  G LVPLL EAG
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AT5G40370.2 Glutaredoxin family protein7.0e-3272.53Show/hide
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AT5G63030.1 Thioredoxin superfamily protein4.1e-3262.62Show/hide
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        + + K KEIV++ PV VFSKTYC YC +VK+LLT+LGA+FK +ELD  SDG E+Q+AL ++TGQ TVPNVFI G HIGGCD  +  N +G LVPLL EAG
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTTGGAGAAGACTAAAGAGATAGTGGCTTCCAATCCCGTCACCGTCTTCAGCAAGACTTATTGTCCGTACTGCGTTCAGGTGAAGAGATTGTTGACTAAACTGGG
AGCCAGTTTTAAGGCTGTTGAATTGGATACTGAGAGTGATGGAAGTGAGGTACAAGCAGCACTTTTTCAGTTCACTGGACAGCGGACCGTGCCCAATGTATTCATAGGTG
GAAAGCACATCGGTGGCTGTGATGCAACGGTGGCACTGAATGGTAAAGGGGGACTGGTTCCTCTGCTGGCTGAAGCCGGAGCAATTGCCAAAGTTTCTGCTGCCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CGAATTTGAGTTTCTTTCTTGTTCTGTTTCTCATTTCTTTAAGAGCTCGCATCGTTAGGGCTACAAATCGAGGAAATTCCATCATGGCGTTGGAGAAGACTAAAGAGATA
GTGGCTTCCAATCCCGTCACCGTCTTCAGCAAGACTTATTGTCCGTACTGCGTTCAGGTGAAGAGATTGTTGACTAAACTGGGAGCCAGTTTTAAGGCTGTTGAATTGGA
TACTGAGAGTGATGGAAGTGAGGTACAAGCAGCACTTTTTCAGTTCACTGGACAGCGGACCGTGCCCAATGTATTCATAGGTGGAAAGCACATCGGTGGCTGTGATGCAA
CGGTGGCACTGAATGGTAAAGGGGGACTGGTTCCTCTGCTGGCTGAAGCCGGAGCAATTGCCAAAGTTTCTGCTGCCTAGAGTATGAGTTTATGTTATTACATAGTGCAA
TTAGATAAATAAACCTTCTATTTGTGCTTTTCTTGCTCTACTTTTGGCATTTCTACTAAAAATGCTTTCAGATTGGACCTTTTACTTGTTTGTAAAAATAACTGGAGGAA
ACTATGTGATGCTGCTTCCTTTGCATCTAATGATAAATATCTGGGCTTTCCTGTAATCTGATTTTTGTTGGCTTTCTTTAGTAATAACAAGTTGGTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MALEKTKEIVASNPVTVFSKTYCPYCVQVKRLLTKLGASFKAVELDTESDGSEVQAALFQFTGQRTVPNVFIGGKHIGGCDATVALNGKGGLVPLLAEAGAIAKVSAA