; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG09G019860 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG09G019860
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCG_Chr09:36947172..36948305
RNA-Seq ExpressionClCG09G019860
SyntenyClCG09G019860
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6578700.1 hypothetical protein SDJN03_23148, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-2056.88Show/hide
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        MNMV+ A+R VRP IV+ +    +F+A  +AP+ALPFHL VE ELHVFN VT FEV   WV+VQ   LAVE+EA +G S SVAP+YA  +  FWW S+E 
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        + GTR+E M
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XP_023550074.1 uncharacterized protein LOC111808373 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-3154.27Show/hide
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        MNMV+ A+R V P I +  +F A  +APHALPFHLLVE ELHVFN VT FEV   WVEVQVI LAVE+EA +G S SVAPYY   +  FWW S+E + G 
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        R+E M         T  V+  IAF A +SRAE    AA+AG+  LI+  L+FM  VAW IT+ L
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XP_023550075.1 uncharacterized protein LOC111808373 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-3154.27Show/hide
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        MNMV+ A+R V P I +  +F A  +APHALPFHLLVE ELHVFN VT FEV   WVEVQVI LAVE+EA +G S SVAPYY   +  FWW S+E + G 
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Query:  REEVMVNELGSGVSTSLVKTDIAFFALISRAEPFLFAAMAGVWLLIVFWLEFMLRVAWMITKNL
        R+E M         T  V+  IAF A +SRAE    AA+AG+  LI+  L+FM  VAW IT+ L
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KNV7 Uncharacterized protein4.8e-1450.48Show/hide
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        MNMVLPALR+V PTI     F    +APHALP   LVE E HVFN V   EV T  VE+QVI LAV ++A +     VA  +AF +   WW  +E E GT
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Query:  REEVM
         E+ M
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A0A0A0KS93 Uncharacterized protein2.0e-1540.91Show/hide
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        +E RG NH   S NNTN+  +D L+D P  +L  + +      LNFF+ HL   +         A     + + VVP FQ HFS+TSDMNMV   LR +R
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Query:  PTIVTTTIFKAFPIAPHALPFHLLVEFELHV-------FNFVTSFEVPTTWVEV
        P+I T T F A  IAP A  FH+LV+ EL         F+ V S ++ TTWV++
Subjt:  PTIVTTTIFKAFPIAPHALPFHLLVEFELHV-------FNFVTSFEVPTTWVEV

A0A0A0KU92 Uncharacterized protein2.9e-1147.71Show/hide
Query:  MNMVLPALRHVRPTIVTTTIFKAFPIAPHALPFHLLVEFELHVFNFVTSFEVPTTWVEVQV--IVLAVENEAFNGVSTSVAPYYAFWMTRFWWFSKEHEL
        MNMVLPALR+V PTI          +APHALP   LVE ELHVFNFV   +V T  VE+Q+    LAV ++A + +   VA  +A      WW  KE E 
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Query:  GTREEVMVN
        G  EE M N
Subjt:  GTREEVMVN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAACTCGATGAAGAAAGAGGCGAGAATCATTGTTGGATCTCCAATAACAATACTAACGACCGTCTTGATGATGAACTTCAAGATTCTCCAAAACTTGTTCTTCTCAA
ATCCACCACCTCCATAACCTCCAACAGCTTGAACTTCTTTCAGTTTCATCTTGAGAGCCAAAGATTCTTGTCCACCACCACCGCTACTACTGCTGCTTCCTCCACCGCCG
CTACTGTTGTTGTTGTACCATGCTTCCAAAGCCATTTCAGTAACACAAGCGACATGAACATGGTACTTCCCGCACTTAGACATGTAAGACCAACCATTGTCACGACCACC
ATCTTTAAGGCTTTTCCTATTGCACCACATGCACTTCCCTTTCACCTTCTTGTTGAGTTTGAACTTCACGTCTTCAATTTCGTAACTTCTTTTGAGGTTCCAACAACATG
GGTGGAGGTCCAAGTCATCGTCCTCGCAGTGGAAAACGAAGCCTTTAATGGTGTTTCTACAAGCGTCGCACCTTATTATGCATTCTGGATGACACGGTTTTGGTGGTTTT
CTAAGGAACATGAACTCGGAACCAGGGAAGAAGTCATGGTAAACGAACTTGGTTCCGGTGTAAGTACAAGCTTGGTGAAAACCGATATCGCATTCTTTGCATTGATATCG
AGGGCCGAACCCTTTTTGTTTGCAGCCATGGCAGGTGTATGGTTGCTCATAGTTTTCTGGCTCGAGTTCATGCTTCGGGTGGCATGGATGATTACGAAGAATCTCGTTCA
TTGCCTTTTCTTTTTTGAACAAAAATCAAATTACCAAGCAATGTGTTTGGCTTTGGGTTGCACCTTAGGGCAAAACAAAACAATTAATTGTGATGCATCAACGTATTTGA
GAAAGGTACAATCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAACTCGATGAAGAAAGAGGCGAGAATCATTGTTGGATCTCCAATAACAATACTAACGACCGTCTTGATGATGAACTTCAAGATTCTCCAAAACTTGTTCTTCTCAA
ATCCACCACCTCCATAACCTCCAACAGCTTGAACTTCTTTCAGTTTCATCTTGAGAGCCAAAGATTCTTGTCCACCACCACCGCTACTACTGCTGCTTCCTCCACCGCCG
CTACTGTTGTTGTTGTACCATGCTTCCAAAGCCATTTCAGTAACACAAGCGACATGAACATGGTACTTCCCGCACTTAGACATGTAAGACCAACCATTGTCACGACCACC
ATCTTTAAGGCTTTTCCTATTGCACCACATGCACTTCCCTTTCACCTTCTTGTTGAGTTTGAACTTCACGTCTTCAATTTCGTAACTTCTTTTGAGGTTCCAACAACATG
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GAAAGGTACAATCTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MELDEERGENHCWISNNNTNDRLDDELQDSPKLVLLKSTTSITSNSLNFFQFHLESQRFLSTTTATTAASSTAATVVVVPCFQSHFSNTSDMNMVLPALRHVRPTIVTTT
IFKAFPIAPHALPFHLLVEFELHVFNFVTSFEVPTTWVEVQVIVLAVENEAFNGVSTSVAPYYAFWMTRFWWFSKEHELGTREEVMVNELGSGVSTSLVKTDIAFFALIS
RAEPFLFAAMAGVWLLIVFWLEFMLRVAWMITKNLVHCLFFFEQKSNYQAMCLALGCTLGQNKTINCDASTYLRKVQS