; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG09G022460 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG09G022460
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionX8 domain-containing protein
Genome locationCG_Chr09:39486907..39488328
RNA-Seq ExpressionClCG09G022460
SyntenyClCG09G022460
Gene Ontology termsGO:0005975 - carbohydrate metabolic process (biological process)
GO:0046658 - anchored component of plasma membrane (cellular component)
GO:0004553 - hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds (molecular function)
InterPro domainsIPR012946 - X8 domain
IPR044788 - Carbohydrate-binding X8 domain-containing protein, plant


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572453.1 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.8e-8971.65Show/hide
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XP_031744909.1 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12 isoform X1 [Cucumis sativus]2.9e-8972.18Show/hide
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XP_038887351.1 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like isoform X1 [Benincasa hispida]2.5e-9375Show/hide
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XP_038887352.1 major pollen allergen Ole e 10-like isoform X2 [Benincasa hispida]2.5e-9375Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K3M5 X8 domain-containing protein1.3e-8770.41Show/hide
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A0A0A0K8Y4 X8 domain-containing protein9.1e-8971.43Show/hide
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A0A1S4DWJ2 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like1.8e-8972.83Show/hide
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A0A5A7SSE1 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 3-like5.4e-8172.43Show/hide
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        T       STSSSVLNTTNSKGSTVFGAVPSSPSPSAATCQEI
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A0A6J1D2V3 glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12-like3.7e-8268.92Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65399 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 12.6e-1639.42Show/hide
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         +  HAS+AFNSYYQK      SC+F G A+IT+TDP
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Q8VYE5 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 122.6e-1641.41Show/hide
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        TTP++   +   ++P+  S+P IN  ST        G  K+         WCIAS  AS   LQ ALD+ACG G  DCSA+Q  Q C+ P+T+  HASYA
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        FN+YYQ++   +  C+F G +V    DP
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Q9FJU9 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 132.6e-1650.56Show/hide
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        S   SSG+  SWCIAS  AS++ L+ ALD+ACG G  DC+AIQ  Q C+ P+T+  HAS+ FNSY+Q+N   + +C+FGG  V  + DP
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Q9FNQ2 PLASMODESMATA CALLOSE-BINDING PROTEIN 11.3e-1546.74Show/hide
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        S ASWC+     S   LQ  LDYACG+ G DC+  +  QSC+NP+ +  H +YA NS++Q K   P SCNF GTA  T++DP     +FPT+
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Q9ZU91 Glucan endo-1,3-beta-glucosidase 32.0e-1648.19Show/hide
Query:  SSGASWCIASQSASQKALQIALDYACGHGGTDCSAIQAGQSCYNPNTIHDHASYAFNSYYQK-NPVPNSCNFGGTAVITSTDP
        ++  ++CIA +   +K LQ ALD+ACG G  DCSA+  G+SCY P+ +  H++YAFN+YYQK      SC+F G A +T+TDP
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09460.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein2.8e-2134.68Show/hide
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        +T P+T   T    NP    P   P+ T     P +  P  S+ PS SG SWC+A   ASQ +LQ ALDYACG    DCS +Q G +CY+P ++  HAS+
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        AFNSYYQKNP P SC+FGG A + +T+P           S  T +      P  +      P      ++     II V T     F  ++ +S+ LN  
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        +S G         SP+ +  T  +   L+  F   MV+  +LH    H
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AT1G29380.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.5e-2758.25Show/hide
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        WCIA  +AS  +LQ+ALDYACG+GG DC  IQ G +CY PNTI DHAS+AFNSYYQK+P  +SCNFGG A +TSTDP    S  +  F      VST P 
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         +M
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AT2G30933.1 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein1.9e-3038.56Show/hide
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        ++DITTP+ T       NP  +   + P S SD  + A       S P   A     SWC+A ++ ++ ALQ ALDYACG GG DCS IQ G +CYNPN+
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        +  HAS+AFNSYYQKNP+P+SCNF GTA+  S DP L                S H               FP+T               STS S+LN T
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        +  G  +FG +PS  +P P A+T     ++  L+ L
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AT2G30933.2 Carbohydrate-binding X8 domain superfamily protein4.0e-2849.63Show/hide
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        ++DITTP+ T       NP  +   + P S SD  + A       S P   A     SWC+A ++ ++ ALQ ALDYACG GG DCS IQ G +CYNPN+
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Query:  IHDHASYAFNSYYQKNPVPNSCNFGGTAVITSTDP
        +  HAS+AFNSYYQKNP+P+SCNF GTA+  S DP
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AT5G55180.1 O-Glycosyl hydrolases family 17 protein4.0e-2052.94Show/hide
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        P   G +WC+A+   +++ LQ  LDYACG GG DC  IQ G +CYNP ++  HASYAFNSYYQKN     +CNFGG A + S  P
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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ATTATTACACACCAACAATCTTCATGGCTGA
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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GSTVFGAVPSSPSPSAATCQEINVLQQLFLLTMVSLRLLHTNNLHG