; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG10G010660 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG10G010660
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionProtein RALF-like 33
Genome locationCG_Chr10:23546297..23548949
RNA-Seq ExpressionClCG10G010660
SyntenyClCG10G010660
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044366.1 protein RALF-like 33 [Cucumis melo var. makuwa]6.0e-5290Show/hide
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KGN52797.1 hypothetical protein Csa_014956 [Cucumis sativus]2.3e-5189.34Show/hide
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XP_022934551.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita moschata]3.9e-5188.43Show/hide
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XP_022983404.1 protein RALF-like 1 [Cucurbita maxima]6.7e-5188.43Show/hide
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XP_023529110.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.9e-5289.26Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KWI2 Uncharacterized protein1.1e-5189.34Show/hide
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A0A103YNT3 Rapid ALkalinization Factor2.0e-3743.78Show/hide
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        R                        G S          F I+  + S+ IM  A +   +    +W+S +     C G SI+ECM   E EM+SE  RRI
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        LAT++YISY +L+ NNIPCS+RG+SYYNCQ G +ANPYQRGC+ ITRC+
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A0A5A7TQI0 Protein RALF-like 332.9e-5290Show/hide
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A0A6J1F244 protein RALF-like 11.9e-5188.43Show/hide
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A0A6J1J798 protein RALF-like 13.2e-5188.43Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 331.0e-2552.07Show/hide
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        G S+ P  + + I T+ F       +  A++S  S  ++  E++C+G +I+EC ++    EFEMDSEINRRILAT+ YISY +LR N +PCSRRG+SYYN
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        C+ GA+ANPY RGC+AITRCR
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Q945T0 Rapid alkalinization factor1.0e-2251.69Show/hide
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        P  L + +   AFF+S     + A     +  W+        C G SI EC+    EFE+DSE NRRILAT  YISY +L+ N++PCSRRG+SYYNC+PG
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Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 232.3e-2246.67Show/hide
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        G S +     +    +   V + S+ V++ S++ +  +   ET C G +I+EC                  M  EFEMDSEINRRILAT  YISY +LR 
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        N IPCSRRG+SYYNC+ GA+ANPY RGC+AITRCR
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Q9MA62 Protein RALF-like 228.2e-2064Show/hide
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        C G SI+EC+    E E DS+I+RRILA   YISY ++R N++PCSRRG+SYYNCQ GA+ANPY RGC+ ITRCR
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Q9SRY3 Protein RALF-like 11.9e-2454.05Show/hide
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        L   + F +SS  +     +    ++W +T    + CHG SI+EC+   E EMDSEINRRILAT+ YISY+SL+ N++PCSRRG+SYYNCQ GA+ANPY 
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        RGC+ I RCRS
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 11.3e-2554.05Show/hide
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        L   + F +SS  +     +    ++W +T    + CHG SI+EC+   E EMDSEINRRILAT+ YISY+SL+ N++PCSRRG+SYYNCQ GA+ANPY 
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AT2G33775.1 ralf-like 191.6e-1543.62Show/hide
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        + +  ++   + +W  T++  +G+        +++ MDSE NRR LA   SYISY +LR NN+PCSRRG SYY+C+    ANPY+RGC+ IT C
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AT3G05490.1 ralf-like 225.9e-2164Show/hide
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AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.6e-2346.67Show/hide
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        G S +     +    +   V + S+ V++ S++ +  +   ET C G +I+EC                  M  EFEMDSEINRRILAT  YISY +LR 
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        N IPCSRRG+SYYNC+ GA+ANPY RGC+AITRCR
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AT4G15800.1 ralf-like 337.1e-2752.07Show/hide
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        G S+ P  + + I T+ F       +  A++S  S  ++  E++C+G +I+EC ++    EFEMDSEINRRILAT+ YISY +LR N +PCSRRG+SYYN
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        C+ GA+ANPY RGC+AITRCR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTAACTCTTCTTCTCCACCTACCTTATGTATGCTCATTTTCACCATAGCCTTCTTCGTCTCCTCGTCCTCTATAATGGTCACGGCAATGAGTAGCGACCATAGTCT
TAGTTGGCTCTCGACCGAAACTCGATGCCATGGACGTTCGATAAGTGAATGCATGATGAACATTGAGTTTGAAATGGATTCTGAGATCAATCGTCGCATCTTAGCCACTT
CAAGTTACATAAGTTACAAGTCGTTGAGGGCCAACAACATTCCATGCTCTCGGAGAGGTTCGTCCTACTACAATTGCCAACCTGGGGCCGAAGCTAACCCGTATCAGCGA
GAAGAAGCTCTTTTCCCTTGGCAAACTTGGAATTCATTCAAGTGGGAAAGAATGAAGCTAAAGGCAACTATGGGTAACTCTTCTTCTCCACCTACCTTATGTATGCTCAT
TTTCACCATAGCCTTCTTCGTCTCCTCGTCCTCTATAATGGTCACGGCAATGAGTAGCGACCATAGTCTTAGTTGGCTCTCGACCGAAACTCGATGCCATGGACGTTCGA
TAAGTGAATGCATGATGAACATTGAGTTTGAAATGGATTCTGAGATCAATCGTCGCATCTTAGCCACTTCAAGTTACATAAGTTACAAGTCGTTGAGGGCCAACAACATT
CCATGCTCTCGGAGAGGTTCGTCCTACTACAATTGCCAACCTGGGGCCGAAGCTAACCCGTATCAGCGAGGTTGTACTGCCATTACTCGTTGTAGAAGCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGTAACTCTTCTTCTCCACCTACCTTATGTATGCTCATTTTCACCATAGCCTTCTTCGTCTCCTCGTCCTCTATAATGGTCACGGCAATGAGTAGCGACCATAGTCT
TAGTTGGCTCTCGACCGAAACTCGATGCCATGGACGTTCGATAAGTGAATGCATGATGAACATTGAGTTTGAAATGGATTCTGAGATCAATCGTCGCATCTTAGCCACTT
CAAGTTACATAAGTTACAAGTCGTTGAGGGCCAACAACATTCCATGCTCTCGGAGAGGTTCGTCCTACTACAATTGCCAACCTGGGGCCGAAGCTAACCCGTATCAGCGA
GAAGAAGCTCTTTTCCCTTGGCAAACTTGGAATTCATTCAAGTGGGAAAGAATGAAGCTAAAGGCAACTATGGGTAACTCTTCTTCTCCACCTACCTTATGTATGCTCAT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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PCSRRGSSYYNCQPGAEANPYQRGCTAITRCRS