; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG10G022700 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG10G022700
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
Description50S ribosomal protein L35
Genome locationCG_Chr10:37081912..37086498
RNA-Seq ExpressionClCG10G022700
SyntenyClCG10G022700
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044224.1 RING-H2 finger protein ATL74-like [Cucumis melo var. makuwa]5.6e-3266.92Show/hide
Query:  MALGHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRSEMPQYSYLLVESENQSWH
        MA+GHRRSFKI+V+AKICNLYIKLKATLK PSGKFQRLLKLDK+LI VDSKSESR+LVQRRRTLKSRMLSFV KK+LGR RS++P       ES+ Q WH
Subjt:  MALGHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRSEMPQYSYLLVESENQSWH

Query:  VGRLELRCVAAFVVGLGCLLVLALNTHIGLVIA
        VG           +G+G   ++AL T IGL  A
Subjt:  VGRLELRCVAAFVVGLGCLLVLALNTHIGLVIA

KAE8650972.1 hypothetical protein Csa_002588 [Cucumis sativus]1.8e-4370.62Show/hide
Query:  MALGHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRSEMPQYSYLLVESENQSWH
        MA+GHRRSFKI+V AKICNLYIKLKATLK PSGKFQRLLKLDK+LI VDSKS SRIL+QRRRTLKSRMLSFV KK+LG RRS+ P       ES  +SWH
Subjt:  MALGHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRSEMPQYSYLLVESENQSWH

Query:  VGRLELRCVAAFVVGLGCLLVLALNTHIGLVIANANDIRPTFTSFIIWVCLLLLVLWLHK
        VG LE RCVAAF VGLG  +V+AL T I L    AN I P+F+S IIWV L + VLWL K
Subjt:  VGRLELRCVAAFVVGLGCLLVLALNTHIGLVIANANDIRPTFTSFIIWVCLLLLVLWLHK

XP_008442323.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103486229 [Cucumis melo]1.2e-3763.75Show/hide
Query:  MALGHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRSEMPQYSYLLVESENQSWH
        MA+GHRRSFKI+V+AKICNLYIKLKATLK PSGKFQRLLKLDK+LI VDSKSESR+LVQRRRTLKSRMLSFV KK+LGR RS++P       ES+ QSWH
Subjt:  MALGHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRSEMPQYSYLLVESENQSWH

Query:  VGRLELRCVAAFVVGLGCLLVLALNTHIGLVIANANDIRPTFTSFIIWVCLLLLVLWLHK
        VG           +G+G   ++AL T IGL    AN +  +F+S IIWV L + V+WL K
Subjt:  VGRLELRCVAAFVVGLGCLLVLALNTHIGLVIANANDIRPTFTSFIIWVCLLLLVLWLHK

XP_023540743.1 uncharacterized protein LOC111801019 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.3e-3253.49Show/hide
Query:  MALGHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRS-----EMPQYSYLLVESE
        MALGHRRS+KITV+AK+ +LYIK KAT+K PSGKF+ LL LDK+L+G+DSKSESRILVQ+ RTLKSR++SFVKK +  RR       +MP   YL+ E+E
Subjt:  MALGHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRS-----EMPQYSYLLVESE

Query:  NQSWHVGRLELRCVAAFVVGLGCLL----VLALNTHIGLVIANANDIRPTFTSFIIWVCLLLLVLWLHKYHF
         QSW +GR E  C A F VGLG LL      A    +G++        P+ +SF++ VC++L VL  HK  F
Subjt:  NQSWHVGRLELRCVAAFVVGLGCLL----VLALNTHIGLVIANANDIRPTFTSFIIWVCLLLLVLWLHKYHF

XP_038906422.1 uncharacterized protein LOC120092221 [Benincasa hispida]1.1e-4873.1Show/hide
Query:  MALGHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRSEMPQYSYLLVESENQSWH
        MALG RRSFKITV+AKICNLYIKLKATLKPPSGK QRLLKLDK+LIG DSKSES ILVQRRRTLKSRMLSFV KK+LG  RS+MP       ESENQSW 
Subjt:  MALGHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRSEMPQYSYLLVESENQSWH

Query:  VGRLELRCVAAFVVGLGCLLVLALNTHIGLVIANANDIRPTFTSFIIWV--CLLLLVLWLHKYHFKCGYFH
        VGR+ELRCVA F VGLG L  LALNTHIGL     N I P+F+S  IWV  CLLL VLWLH    KC Y +
Subjt:  VGRLELRCVAAFVVGLGCLLVLALNTHIGLVIANANDIRPTFTSFIIWV--CLLLLVLWLHKYHFKCGYFH

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LCL9 50S ribosomal protein L359.3e-4171.52Show/hide
Query:  MALGHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRSEMPQYSYLLVESENQSWH
        MA+GHRRSFKI+V AKICNLYIKLKATLK PSGKFQRLLKLDK+LI VDSKS SRIL+QRRRTLKSRMLSFV KK+LG RRS+ P       ES  +SWH
Subjt:  MALGHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRSEMPQYSYLLVESENQSWH

Query:  VGRLELRCVAAFVVGLGCLLVLALNTHIGLVIANANDIRPTFTSFIIWVCL
        VG LE RCVAAF VGLG  +V+AL T I L    AN I P+F+S IIWV L
Subjt:  VGRLELRCVAAFVVGLGCLLVLALNTHIGLVIANANDIRPTFTSFIIWVCL

A0A1S3B4Y8 uncharacterized protein LOC1034862295.6e-3863.75Show/hide
Query:  MALGHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRSEMPQYSYLLVESENQSWH
        MA+GHRRSFKI+V+AKICNLYIKLKATLK PSGKFQRLLKLDK+LI VDSKSESR+LVQRRRTLKSRMLSFV KK+LGR RS++P       ES+ QSWH
Subjt:  MALGHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRSEMPQYSYLLVESENQSWH

Query:  VGRLELRCVAAFVVGLGCLLVLALNTHIGLVIANANDIRPTFTSFIIWVCLLLLVLWLHK
        VG           +G+G   ++AL T IGL    AN +  +F+S IIWV L + V+WL K
Subjt:  VGRLELRCVAAFVVGLGCLLVLALNTHIGLVIANANDIRPTFTSFIIWVCLLLLVLWLHK

A0A5A7TM08 RING-H2 finger protein ATL74-like2.7e-3266.92Show/hide
Query:  MALGHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRSEMPQYSYLLVESENQSWH
        MA+GHRRSFKI+V+AKICNLYIKLKATLK PSGKFQRLLKLDK+LI VDSKSESR+LVQRRRTLKSRMLSFV KK+LGR RS++P       ES+ Q WH
Subjt:  MALGHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRSEMPQYSYLLVESENQSWH

Query:  VGRLELRCVAAFVVGLGCLLVLALNTHIGLVIA
        VG           +G+G   ++AL T IGL  A
Subjt:  VGRLELRCVAAFVVGLGCLLVLALNTHIGLVIA

A0A5D3DNQ2 50S ribosomal protein L357.9e-3267.69Show/hide
Query:  GHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRSEMPQYSYLLVESENQSWHVGR
        GHRRSFKI+V+AKICNLYIKLKATLK PSGKFQRLLKLDK+LI VDSKSESR+LVQRRRTLKSRMLSFV KK+LGR RS++P       ES+ QSWHVG 
Subjt:  GHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRSEMPQYSYLLVESENQSWHVGR

Query:  LELRCVAAFVVGLGCLLVLALNTHIGLVIA
                  +G+G   ++AL T IGL  A
Subjt:  LELRCVAAFVVGLGCLLVLALNTHIGLVIA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGTTAGGTCATCGGCGGTCATTCAAAATCACTGTCAATGCCAAGATCTGTAACCTTTATATCAAGCTCAAGGCCACTCTGAAGCCCCCTTCCGGGAAATTCCAACG
CCTCCTAAAGCTTGATAAAATACTCATCGGAGTGGATTCCAAATCCGAATCACGGATCCTCGTTCAACGCCGACGGACTTTGAAATCTCGAATGCTCAGCTTCGTGAAGA
AGAAGTATTTGGGGCGTCGCCGATCTGAAATGCCCCAATATTCATACCTACTTGTTGAATCTGAAAATCAATCTTGGCATGTTGGCCGACTGGAACTAAGGTGTGTGGCT
GCTTTTGTTGTTGGATTGGGTTGTCTGCTTGTCCTTGCACTCAACACACACATTGGCCTTGTTATTGCTAATGCCAATGACATCCGTCCCACCTTCACTTCCTTTATTAT
TTGGGTTTGCCTGCTTTTACTTGTTTTATGGCTCCACAAATACCATTTCAAGTGTGGATATTTCCATAGAAGAGAAGCTCGATGTGCATGTTTTGTTATGTTCGTTCATC
GTTGGAGTGCTGCTGTATCGAAATGCTCACACACGTTTAGCCAATTTGAGATTATTGGCGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGTTAGGTCATCGGCGGTCATTCAAAATCACTGTCAATGCCAAGATCTGTAACCTTTATATCAAGCTCAAGGCCACTCTGAAGCCCCCTTCCGGGAAATTCCAACG
CCTCCTAAAGCTTGATAAAATACTCATCGGAGTGGATTCCAAATCCGAATCACGGATCCTCGTTCAACGCCGACGGACTTTGAAATCTCGAATGCTCAGCTTCGTGAAGA
AGAAGTATTTGGGGCGTCGCCGATCTGAAATGCCCCAATATTCATACCTACTTGTTGAATCTGAAAATCAATCTTGGCATGTTGGCCGACTGGAACTAAGGTGTGTGGCT
GCTTTTGTTGTTGGATTGGGTTGTCTGCTTGTCCTTGCACTCAACACACACATTGGCCTTGTTATTGCTAATGCCAATGACATCCGTCCCACCTTCACTTCCTTTATTAT
TTGGGTTTGCCTGCTTTTACTTGTTTTATGGCTCCACAAATACCATTTCAAGTGTGGATATTTCCATAGAAGAGAAGCTCGATGTGCATGTTTTGTTATGTTCGTTCATC
GTTGGAGTGCTGCTGTATCGAAATGCTCACACACGTTTAGCCAATTTGAGATTATTGGCGATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MALGHRRSFKITVNAKICNLYIKLKATLKPPSGKFQRLLKLDKILIGVDSKSESRILVQRRRTLKSRMLSFVKKKYLGRRRSEMPQYSYLLVESENQSWHVGRLELRCVA
AFVVGLGCLLVLALNTHIGLVIANANDIRPTFTSFIIWVCLLLLVLWLHKYHFKCGYFHRREARCACFVMFVHRWSAAVSKCSHTFSQFEIIGD