; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG11G009640 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG11G009640
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCG_Chr11:15564234..15564687
RNA-Seq ExpressionClCG11G009640
SyntenyClCG11G009640
Gene Ontology termsGO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR022546 - Uncharacterised protein family Ycf68


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0050839.1 putative chloroplast RF68 [Cucumis melo var. makuwa]7.1e-3577.36Show/hide
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KAF4348549.1 hypothetical protein F8388_000228 [Cannabis sativa]2.1e-2660.66Show/hide
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KAG9438629.1 hypothetical protein H6P81_021434 [Aristolochia fimbriata]2.1e-2363.37Show/hide
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RDY14309.1 putative protein ycf68, partial [Mucuna pruriens]9.9e-2159.43Show/hide
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TYK08512.1 putative chloroplast RF68 [Cucumis melo var. makuwa]6.4e-3678.3Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A371IGX7 Uncharacterized protein ycf68 (Fragment)4.8e-2159.43Show/hide
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A0A3Q7GS21 Uncharacterized protein ycf686.3e-2176.81Show/hide
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A0A5A7UBD6 Uncharacterized protein ycf683.4e-3577.36Show/hide
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A0A5D3CB41 Uncharacterized protein ycf683.1e-3678.3Show/hide
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A0A7J6DSE9 Uncharacterized protein ycf681.0e-2660.66Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P03938 Uncharacterized protein ycf689.3e-1476.6Show/hide
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P0C304 Uncharacterized protein ycf681.6e-0549.06Show/hide
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Q6ENB7 Uncharacterized protein ycf681.6e-0549.06Show/hide
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Q6ENQ5 Uncharacterized protein ycf689.3e-1476.6Show/hide
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Q6L3C9 Uncharacterized protein ycf689.3e-1476.6Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
CCCGGAAATGCGACTCTAACAGCTAGGTTTCGAGAGGGCTATATCGATCTCGGAAACAGGCCTCAATGGGAAAATAAAACGGAGCACCTAACAACGTATCTTCACAGACC
AAGAACTACGAGATCGCCCCTTTCATTCTGGGGTGACGGAGGGATCGTACCATTCGAGCCTTTTTTTTTCATGCTTTTCCCGGAGGGACCAGGAGATTTGAAAAAGGATC
TTAGAGTGTCTAGGGTTGGGCCAGGAGGGTTTCTTAACGCCTTCTTTTTTCTTCTCATCGGAGTTATTTCACAAAGACTTGCCATGGTAAGGAAGAAGGGGGGAACAAGC
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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