| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AHM88912.1 RNA polymerase beta [Lagenaria siceraria] | 2.4e-77 | 97.96 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
Query: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
MQG+P+LLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
Subjt: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| AHM88970.1 RNA polymerase beta [Lagenaria siceraria] | 2.4e-77 | 97.96 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
Query: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
MQG+P+LLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
Subjt: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| ASY96794.1 RNA polymerase beta' subunit [Cucumis melo var. momordica] | 2.4e-77 | 97.96 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
Query: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
MQG+P+LLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
Subjt: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| YP_009560826.1 RpoC1 [Trichosanthes kirilowii] | 2.4e-77 | 97.96 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
Query: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
MQG+P+LLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
Subjt: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| YP_247590.2 RNA polymerase beta' subunit [Cucumis sativus] | 2.4e-77 | 97.96 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
Query: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
MQG+P+LLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
Subjt: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A1P8LE65 DNA-directed RNA polymerase subunit gamma | 1.2e-77 | 97.96 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
Query: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
MQG+P+LLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
Subjt: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| A0A1X9Q1T5 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 1.2e-77 | 97.96 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
Query: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
MQG+P+LLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
Subjt: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| A0A218KG20 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 1.2e-77 | 97.96 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
Query: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
MQG+P+LLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
Subjt: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| A0A249RZJ2 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 1.2e-77 | 97.96 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
Query: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
MQG+P+LLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
Subjt: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| A0A6M3S6B8 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 1.2e-77 | 97.96 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
Query: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
MQG+P+LLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
Subjt: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A6MM27 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 4.6e-79 | 96.6 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTF+IRGLIRQH ASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
Query: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
MQG+P+LLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
Subjt: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| Q3C1G8 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 4.6e-79 | 95.92 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTF+IRGLIRQH ASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
Query: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
MQG+P+LLNRAPTLHRLGIQAFQP+LVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
Subjt: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| Q4VZP2 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 3.2e-80 | 97.96 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
Query: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
MQG+P+LLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
Subjt: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| Q8HVY4 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 1.6e-79 | 95.92 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSD+IEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIR+HFASNIG+AKSKIR+KEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
Query: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
MQG+P+LLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
Subjt: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| Q8S8Y0 DNA-directed RNA polymerase subunit beta' | 4.6e-79 | 95.92 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTF+IRGLIRQH ASNIGVAKSKIR+KEPIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
Query: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
MQG+P+LLNRAPTLHRLGIQAFQP+LVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
Subjt: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G63020.1 nuclear RNA polymerase D1A | 1.8e-09 | 27.14 | Show/hide |
Query: RETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASN-----IGVAKSKIRKKEPIVW----------EILQEVMQGYPILL
++ LLGKR D++ R+V+V PSL L+ G+P IA L + + ++ ++ + + +R+ + +V +I + +M G +L+
Subjt: RETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASN-----IGVAKSKIRKKEPIVW----------EILQEVMQGYPILL
Query: NRAPTLHRLGIQAFQ-PILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
NR P++H+ + A IL + L+P+ C F DFD
Subjt: NRAPTLHRLGIQAFQ-PILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| AT4G35800.1 RNA polymerase II large subunit | 6.0e-10 | 28.05 | Show/hide |
Query: KSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIEL--------FQTFLIRGLI--RQHFASNIGVAKSKIR-----------K
KS ++ KEGR R L+GKRVD+S R+VI P++++ G+P IA+ L + ++ L+ H AK IR K
Subjt: KSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIEL--------FQTFLIRGLI--RQHFASNIGVAKSKIR-----------K
Query: KE-----PIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
K + +++ + + G +L NR P+LH++ I + ++ L+ V +NADFD
Subjt: KE-----PIVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| AT5G60040.1 nuclear RNA polymerase C1 | 2.2e-12 | 28.85 | Show/hide |
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIA-------------IELFQTFLIRGLIRQHFASN-----------IGVAKSKIRKKEP
++GK GRFR L GKRV+++GR+VI P+L + G+P +A IE + + G + A N +G + +I +
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIA-------------IELFQTFLIRGLIRQHFASN-----------IGVAKSKIRKKEP
Query: IVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
I + + + +G +L NR P+LHR+ I + ++ R + + VC +NADFD
Subjt: IVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| AT5G60040.2 nuclear RNA polymerase C1 | 2.2e-12 | 28.85 | Show/hide |
Query: IEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIA-------------IELFQTFLIRGLIRQHFASN-----------IGVAKSKIRKKEP
++GK GRFR L GKRV+++GR+VI P+L + G+P +A IE + + G + A N +G + +I +
Subjt: IEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIA-------------IELFQTFLIRGLIRQHFASN-----------IGVAKSKIRKKEP
Query: IVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
I + + + +G +L NR P+LHR+ I + ++ R + + VC +NADFD
Subjt: IVWEILQEVMQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
| ATCG00180.1 DNA-directed RNA polymerase family protein | 1.4e-78 | 93.88 | Show/hide |
Query: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTF+IRGLIRQH ASNIGVAKS+IR+K+PIVWEILQEV
Subjt: MRDGHNKVYKSFSDVIEGKEGRFRETLLGKRVDYSGRSVIVVGPSLSLHRCGLPREIAIELFQTFLIRGLIRQHFASNIGVAKSKIRKKEPIVWEILQEV
Query: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
MQG+P+LLNRAPTLHRLGIQ+FQPILVEGR ICLHPLVCKGFNADFD
Subjt: MQGYPILLNRAPTLHRLGIQAFQPILVEGRAICLHPLVCKGFNADFD
|
|
