; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG11G009700 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG11G009700
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionProtein of unknown function, DUF538
Genome locationCG_Chr11:15834661..15837121
RNA-Seq ExpressionClCG11G009700
SyntenyClCG11G009700
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR007493 - Protein of unknown function DUF538
IPR036758 - At5g01610-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004138912.1 uncharacterized protein LOC101222871 [Cucumis sativus]3.0e-8084.13Show/hide
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XP_022949506.1 uncharacterized protein LOC111452833 [Cucurbita moschata]3.5e-8187.01Show/hide
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XP_022998326.1 uncharacterized protein LOC111492997 [Cucurbita maxima]1.3e-8086.44Show/hide
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XP_038891231.1 uncharacterized protein LOC120080586 [Benincasa hispida]2.8e-9494.12Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LN19 Uncharacterized protein1.4e-8084.13Show/hide
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A0A1S3B435 uncharacterized protein LOC1034857964.6e-8788.24Show/hide
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A0A6J1G2H3 uncharacterized protein LOC1114502291.0e-7888.76Show/hide
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A0A6J1GC72 uncharacterized protein LOC1114528331.7e-8187.01Show/hide
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A0A6J1K9Y4 uncharacterized protein LOC1114929976.4e-8186.44Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G61667.1 Protein of unknown function, DUF5387.9e-3146.97Show/hide
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         V+ P+SG++ FD+GV  KQ S SLFE PP C
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AT3G07460.1 Protein of unknown function, DUF5383.3e-3758.97Show/hide
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AT3G07460.2 Protein of unknown function, DUF5383.3e-3758.97Show/hide
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AT3G07470.1 Protein of unknown function, DUF5387.1e-4055.15Show/hide
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        + L L+L    S      +  TIY+ L  +GLP G+ PK +  F+ D  TGRF V+L+Q C AK+E E+HYD N++G +   QI++L+GIS+QELFLWFP
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        VKGIRVD+P+SG+I+FDVGVV KQ+SLSLFE+P DC
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AT5G16380.1 Protein of unknown function, DUF5385.8e-4250Show/hide
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        + S   L  LI+  F+S   P + S PDPS  YD+L    LP G++PK +T FSID  TGRF V L  PC+AKFEN+ H+D+N+SG LS G+I  L+G++
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         +ELFLWF VKGI VD  +SG+IHFDVGV DKQ SLSLFESP DCTAA+   +       +VDL  P      ++L+ +  E+++T
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACCCTGTCTCTCTCTTCCCCTTTCTCACTCCTCCCTTTAATCCTCTTCTTCTTCGCCTCCCCTCTCATCGGCTCTCCTGACCCATCCACAATCTACGACCAT
CTCCACCTTCACGGTCTCCCCATCGGCCTCCTTCCCAAGAACATCACCAGATTCTCAATCGATTCTTCCACCGGCCGTTTCCAGGTCTTCCTCGACCAACCCTGC
AATGCCAAGTTCGAGAATGAGGTTCACTATGATTTCAATGTCTCCGGCAGGCTCTCCTACGGCCAGATCGCTGAATTGGCCGGAATTTCCTCCCAGGAGCTCTTT
CTTTGGTTTCCTGTTAAGGGAATTCGTGTCGATTTGCCCACTTCTGGTGTAATTCATTTCGACGTTGGTGTTGTTGACAAGCAATTCTCTCTTTCCCTCTTTGAG
TCCCCGCCTGATTGCACTGCCGCTGATCCGGTTGATCAATCCTTCGCCTTCAATGGAGCCTCTGTTGATTTGGATGGGCCTTTTTCGATGAAGGAAACACAGAAT
CTCCAGCTTGAAGACAGTGAACTAAGGGCAACATCGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCTTCTTCTTCTTCTTCGTCTCTGCTATCGCGCCGTTCTTCGCTATTTCCTTCTTCAATTCCCTTCTTTCTTCTCCTCCATTTTCCATTTCCGCCATGACCCTGT
CTCTCTCTTCCCCTTTCTCACTCCTCCCTTTAATCCTCTTCTTCTTCGCCTCCCCTCTCATCGGCTCTCCTGACCCATCCACAATCTACGACCATCTCCACCTTC
ACGGTCTCCCCATCGGCCTCCTTCCCAAGAACATCACCAGATTCTCAATCGATTCTTCCACCGGCCGTTTCCAGGTCTTCCTCGACCAACCCTGCAATGCCAAGT
TCGAGAATGAGGTTCACTATGATTTCAATGTCTCCGGCAGGCTCTCCTACGGCCAGATCGCTGAATTGGCCGGAATTTCCTCCCAGGAGCTCTTTCTTTGGTTTC
CTGTTAAGGGAATTCGTGTCGATTTGCCCACTTCTGGTGTAATTCATTTCGACGTTGGTGTTGTTGACAAGCAATTCTCTCTTTCCCTCTTTGAGTCCCCGCCTG
ATTGCACTGCCGCTGATCCGGTTGATCAATCCTTCGCCTTCAATGGAGCCTCTGTTGATTTGGATGGGCCTTTTTCGATGAAGGAAACACAGAATCTCCAGCTTG
AAGACAGTGAACTAAGGGCAACATCGTAGATTAGCGGCAAAGAAATATTGTGGATTTTCCGATGATTTCGTTTCGAGAAGTCTGGCTTTGCTGCTGTGGTAAATC
GTAGATTTTCCTTTACTATTTGCGGATTGCTTTGTTTTGTACAGTCTTTGTTTCCTGATAGTCCCGTCTGATGGGGAAAAGAGGCCTATTTGTCTTCATATAAAG
AGGTCAAAGAAATATTTAGCCTCCAATCCTTCAAGTCTATACTATTAGCTGAATTTAAAGCAAGGAGATTGTCGCTTGGGTCGGCTTATAAGAATCCTAGAAGTT
TGGTATAATTTGGCAATGGTCTCGTCTGTTGTAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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LWFPVKGIRVDLPTSGVIHFDVGVVDKQFSLSLFESPPDCTAADPVDQSFAFNGASVDLDGPFSMKETQNLQLEDSELRATS