; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG11G012110 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG11G012110
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
Description40S ribosomal protein S8
Genome locationCG_Chr11:24721543..24724360
RNA-Seq ExpressionClCG11G012110
SyntenyClCG11G012110
Gene Ontology termsGO:0000462 - maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022627 - cytosolic small ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR001047 - Ribosomal protein S8e
IPR018283 - Ribosomal protein S8e, conserved site
IPR022309 - Ribosomal protein S8e/ribosomal biogenesis NSA2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6598870.1 40S ribosomal protein S8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.2e-11498.17Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_004148331.1 40S ribosomal protein S8 [Cucumis sativus]4.8e-11498.17Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSAS KKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_008451649.1 PREDICTED: 40S ribosomal protein S8-like [Cucumis melo]9.6e-11599.09Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_022929761.1 40S ribosomal protein S8-like [Cucurbita moschata]8.2e-11498.17Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

XP_038891236.1 40S ribosomal protein S8 [Benincasa hispida]2.8e-11498.63Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKK+EEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQF SGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJA0 40S ribosomal protein S82.3e-11498.17Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSAS KKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A1S3BRZ4 40S ribosomal protein S84.7e-11599.09Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A5D3BT12 40S ribosomal protein S84.7e-11599.09Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRR TGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A6J1EP23 40S ribosomal protein S84.0e-11498.17Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

A0A6J1K537 40S ribosomal protein S84.0e-11498.17Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTK+SSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRK+RILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKT ASAKKEEEGDA TEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O81361 40S ribosomal protein S86.7e-10387.27Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRKTR+LDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAK-KEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGK
        AIVQVDAAPFKQWYLQHYGV+IGRKKKT+A+ K   EEG+A TEE KKSNHV  K+EKRQQ R LD HIEEQF  G+L+ACISSRPGQCG+ADG ILEGK
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAK-KEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGK

Query:  ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA
Subjt:  ELEFYMKKLQRKKGKGAGAA

P49199 40S ribosomal protein S83.9e-10388.24Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGK+KAWRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RR+RVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEG---DAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGVDIGRKKK  A AKK+ EG   +A TEE KKSNHV RK+EKRQQ R LD HIEEQF SGRL+ACISSRPGQCGRADGYILE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEG---DAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE

Query:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA
        GKELEFYMKKLQRKKGKGA A
Subjt:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA

Q08069 40S ribosomal protein S88.8e-10386.88Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDSMHKRRATGGK+KAWRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RR+RVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEG---DAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGVDIGRKKKT A+ K   EG   +AA EE KKSNHV RK+EKR++ R LDPHIEEQF SGRL+ACISSRPGQCGRADGYILE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEG---DAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILE

Query:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA
        GKELEFYMKKLQRKKGK A A
Subjt:  GKELEFYMKKLQRKKGKGAGA

Q93VG5 40S ribosomal protein S8-12.2e-9882.35Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYE+GRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEA TRKTR+LDVVYNASNNELVRT+TLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKE-EEGD----AATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGV++GRKKK+++S KK+ EEG+    AA EEVKKSNH+ RKI  RQ+ R LD HIE+QF+SGRL+ACISSRPGQCGRADGYI
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKE-EEGD----AATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI

Query:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA
        LEGKELEFYMKK+Q+KKGKGA
Subjt:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA

Q9FIF3 40S ribosomal protein S8-22.9e-9884.47Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRKTRILDV YNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQ YLQHYGVDIGRKKK  A           TEEVKKSNHVQRK+E RQ+ R LD H+EEQFSSGRL+ACI+SRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQ+KKGK AGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G20290.1 Ribosomal protein S8e family protein1.6e-9982.35Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYE+GRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGNYSWGSEA TRKTR+LDVVYNASNNELVRT+TLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKE-EEGD----AATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI
        AIVQVDAAPFKQWYL HYGV++GRKKK+++S KK+ EEG+    AA EEVKKSNH+ RKI  RQ+ R LD HIE+QF+SGRL+ACISSRPGQCGRADGYI
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKE-EEGD----AATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYI

Query:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA
        LEGKELEFYMKK+Q+KKGKGA
Subjt:  LEGKELEFYMKKLQRKKGKGA

AT5G59240.1 Ribosomal protein S8e family protein2.1e-9984.47Show/hide
Query:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS
        MGISRDS+HKRRATGGK+K WRKKRKYELGRQPANTKLSS+K++RRIRVRGGNVKWRA RLDTGN+SWGSEAVTRKTRILDV YNASNNELVRTQTLVKS
Subjt:  MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKS

Query:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE
        AIVQVDAAPFKQ YLQHYGVDIGRKKK  A           TEEVKKSNHVQRK+E RQ+ R LD H+EEQFSSGRL+ACI+SRPGQCGRADGYILEGKE
Subjt:  AIVQVDAAPFKQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKE

Query:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA
        LEFYMKKLQ+KKGK AGAA
Subjt:  LEFYMKKLQRKKGKGAGAA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAATCTCTCGTGATTCTATGCACAAGAGGCGTGCCACTGGTGGCAAGAAGAAGGCTTGGAGGAAGAAGCGAAAGTATGAGCTTGGAAGGCAACCTGCCAACACCAA
GTTATCCAGTGACAAGTCAATCAGGAGGATTCGAGTTCGTGGTGGTAATGTGAAGTGGCGTGCTTTTAGGCTGGATACTGGAAATTACTCTTGGGGTAGTGAGGCTGTGA
CTAGAAAGACCCGTATTCTTGATGTGGTCTACAATGCATCTAACAATGAGCTTGTTCGTACTCAAACTTTGGTGAAGAGTGCCATAGTTCAAGTTGATGCAGCGCCATTT
AAACAGTGGTATCTTCAACATTATGGAGTGGATATTGGAAGGAAGAAGAAGACCTCAGCATCTGCTAAGAAGGAAGAGGAAGGTGATGCTGCCACTGAGGAGGTAAAGAA
AAGTAACCACGTCCAGCGCAAAATTGAGAAACGTCAGCAGGACCGCAAGCTTGACCCGCATATTGAAGAACAATTCAGCAGCGGTCGTTTGATGGCTTGTATCTCATCAA
GGCCGGGTCAATGTGGCCGAGCAGATGGGTATATCTTGGAGGGCAAAGAGCTTGAATTCTATATGAAGAAACTCCAAAGAAAGAAGGGAAAAGGAGCGGGCGCTGCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCCGCATCAAAACCCCTCTCAGTCCCCTTGCAATCTCTCTCCCGACTTCCCTCGATCGTTCAAGGTTTTTTCCCAGTTTAAAGGTTTGAGGGCTGTTTGATATATTTTCA
GGAACCCTAGACTTGACTACACGCCAAGAGCTCTTGTCTCACCAAGATGGGAATCTCTCGTGATTCTATGCACAAGAGGCGTGCCACTGGTGGCAAGAAGAAGGCTTGGA
GGAAGAAGCGAAAGTATGAGCTTGGAAGGCAACCTGCCAACACCAAGTTATCCAGTGACAAGTCAATCAGGAGGATTCGAGTTCGTGGTGGTAATGTGAAGTGGCGTGCT
TTTAGGCTGGATACTGGAAATTACTCTTGGGGTAGTGAGGCTGTGACTAGAAAGACCCGTATTCTTGATGTGGTCTACAATGCATCTAACAATGAGCTTGTTCGTACTCA
AACTTTGGTGAAGAGTGCCATAGTTCAAGTTGATGCAGCGCCATTTAAACAGTGGTATCTTCAACATTATGGAGTGGATATTGGAAGGAAGAAGAAGACCTCAGCATCTG
CTAAGAAGGAAGAGGAAGGTGATGCTGCCACTGAGGAGGTAAAGAAAAGTAACCACGTCCAGCGCAAAATTGAGAAACGTCAGCAGGACCGCAAGCTTGACCCGCATATT
GAAGAACAATTCAGCAGCGGTCGTTTGATGGCTTGTATCTCATCAAGGCCGGGTCAATGTGGCCGAGCAGATGGGTATATCTTGGAGGGCAAAGAGCTTGAATTCTATAT
GAAGAAACTCCAAAGAAAGAAGGGAAAAGGAGCGGGCGCTGCATAAATTTTGTTATCGAGATGTTTTCGGCCATTGTTTCTTGTTCACTTTTCTTCTTATGAAGACGACG
AGCTCTGTTGCAGCTATTTTGGAATTTCGATTTTGCTGGTAATAGTTGTTTAATTATAGTACGTTTGACCTTTTAATGATAACATTTTGTTTATTAGCTCGAGTTCAAGT
TCAATTTTTTCTTAGTTTATTTATGTAAGCGGGTTGGTTTGGTGTTTGATGTTGAATTTACAGAAGTAAAAGTGGATTAGAGGCCTAAGCTCTCACTTAACATTTCCG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGISRDSMHKRRATGGKKKAWRKKRKYELGRQPANTKLSSDKSIRRIRVRGGNVKWRAFRLDTGNYSWGSEAVTRKTRILDVVYNASNNELVRTQTLVKSAIVQVDAAPF
KQWYLQHYGVDIGRKKKTSASAKKEEEGDAATEEVKKSNHVQRKIEKRQQDRKLDPHIEEQFSSGRLMACISSRPGQCGRADGYILEGKELEFYMKKLQRKKGKGAGAA