; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

ClCG11G012130 (gene) of Watermelon (Charleston Gray) v2.5 genome

Gene IDClCG11G012130
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. Charleston Gray (Watermelon (Charleston Gray) v2.5)
DescriptionOSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B, putative
Genome locationCG_Chr11:24730290..24730868
RNA-Seq ExpressionClCG11G012130
SyntenyClCG11G012130
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7029810.1 hypothetical protein SDJN02_08153, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-7378.35Show/hide
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XP_022929606.1 uncharacterized protein LOC111436141 [Cucurbita moschata]2.8e-7378.12Show/hide
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XP_022997465.1 uncharacterized protein LOC111492375 [Cucurbita maxima]8.5e-7578.12Show/hide
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XP_023546389.1 uncharacterized protein LOC111805512 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.8e-7277.08Show/hide
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XP_031737371.1 uncharacterized protein LOC116402243 [Cucumis sativus]1.7e-7079.29Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7UK88 Putative OSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B3.1e-7077.78Show/hide
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A0A5D3BQA0 Putative OSBP(Oxysterol binding protein)-related protein 4B8.1e-7178.28Show/hide
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A0A6J1DGF8 uncharacterized protein LOC1110208301.0e-6571.73Show/hide
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A0A6J1ENL5 uncharacterized protein LOC1114361411.3e-7378.12Show/hide
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A0A6J1K9Q8 uncharacterized protein LOC1114923754.1e-7578.12Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G40475.1 unknown protein2.9e-0434.48Show/hide
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        + SK+I + SS   SS  IYY G A  VPF WET+PGTPK     +   LPPL+PPP+  S             + R   + RF K ++     R     
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Query:  -RAAEATTIEYSNGDP
          A+ +++  YS+  P
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AT4G25845.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B (TAIR:AT4G25850.2)9.0e-1450Show/hide
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        ISR SS+G      Y     EGVPF+WE QPGTP +  P++++PPLSPPPA+LSLG+PKP I+  +P+  +   +L+LR WK +
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AT4G25850.2 OSBP(oxysterol binding protein)-related protein 4B9.0e-1450Show/hide
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AT5G01790.1 unknown protein9.0e-0652.94Show/hide
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        S  C S  I YY G A  VPF+WE+ PGTPK P  +   LPPL+PPP+  S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAGGGAAATTTCATTGGGATATGAAGAGCAAAGTGATATCAAGAACATCTTCAATTGGTTGTTCTTCTCATAGCATTTATTACTCTGGTACAGCTGAAGGAGTCCC
TTTCAAATGGGAAACACAACCAGGAACTCCCAAAGATCCTCCCCCTCAAGACTTGCTTCCACCCCTCAGCCCTCCGCCGGCGGTTCTCAGCCTCGGGGTACCGAAACCGT
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GACATCGTCATCTTCTTCATCGCCATCGTCTTTTCTAGATTCGTTAACCGTGCGAAATATGGGGAGGGTGTCGTTTGGAAGGCCTTCAAGTTGTAGTGCTGGGCAAATTA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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YSNGDPFCHNDKLETFSFLSSDCEFMASPRDSMSSSTTSSSSSSPSSFLDSLTVRNMGRVSFGRPSSCSAGQINKILACYHS