; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cla97C02G031890 (gene) of Watermelon (97103) v2.5 genome

Gene IDCla97C02G031890
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. 97103 (Watermelon (97103) v2.5)
DescriptionProtein RADIALIS-like 1
Genome locationCla97Chr02:4867330..4867569
RNA-Seq ExpressionCla97C02G031890
SyntenyCla97C02G031890
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain
IPR044636 - Transcription factor RADIALIS-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0036165.1 protein RADIALIS-like 1 [Cucumis melo var. makuwa]6.3e-3293.24Show/hide
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KAE8645640.1 hypothetical protein Csa_020521 [Cucumis sativus]5.3e-3187.34Show/hide
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XP_008447026.1 PREDICTED: protein RADIALIS-like 1 [Cucumis melo]2.1e-2779.75Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K3K0 SANT domain-containing protein7.8e-2881.01Show/hide
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A0A5A7T3V4 Protein RADIALIS-like 13.0e-3293.24Show/hide
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A0A6J1C4J2 protein RADIALIS-like 11.0e-2780.52Show/hide
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A0A6J1GKK4 protein RADIALIS-like 13.1e-2984.42Show/hide
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A0A6J1GKV1 protein RADIALIS-like 14.5e-2882.28Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
F4JVB8 Protein RADIALIS-like 12.1e-2267.57Show/hide
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Q1A173 Protein RADIALIS-like 65.2e-2169.84Show/hide
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Q58FS3 Transcription factor RADIALIS4.2e-2365.22Show/hide
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Q8GW75 Protein RADIALIS-like 54.4e-2063.01Show/hide
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Q9SIJ5 Protein RADIALIS-like 24.7e-2267.61Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G19510.1 RAD-like 53.1e-2163.01Show/hide
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AT1G75250.1 RAD-like 63.7e-2269.84Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCCATTTCTGCTTTTGGACCAAGCACTCCATGGACTACAAAGCAAAACAAAGCCTTTGAGAAAGCTTTGGCAGTTTATGATCAAGATACACCTGAAAGATGGCT
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ATGGAAGCTCTACAAGATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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