CuGenDBv2

Gene ID	Cla97C04G078580
Organism	Citrullus lanatus subsp. vulgaris cv. 97103 (Watermelon (97103) v2.5)
Description	Ras GTPase-activating protein-binding protein 2-like
Genome location	Cla97Chr04:26078205..26081081
RNA-Seq Expression	Cla97C04G078580
Synteny	Cla97C04G078580
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

TYJ98943.1 uncharacterized protein E5676_scaffold248G001440 [Cucumis melo var. makuwa]

1.2e-62

94.44

Show/hide

Query:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKA+SSL+QTL+RYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRV CPAT KEKAI+PTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+NARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK

XP_008451315.2 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492624, partial [Cucumis melo]

1.2e-62

94.44

Show/hide

Query:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKA+SSL+QTL+RYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRV CPAT KEKAI+PTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+NARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK

XP_022923781.1 uncharacterized protein LOC111431390, partial [Cucurbita moschata]

5.2e-63

95.24

Show/hide

Query:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKASSS  QTLKRYIKKPWEITGPCADPEY+ AVPSA+EYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+NARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK

XP_023541320.1 uncharacterized protein LOC111801530, partial [Cucurbita pepo subsp. pepo]

8.9e-63

94.44

Show/hide

Query:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKASSSL QT+KRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTK+K IVPTSNPETVFDIKYY+RDQRRNRPPIRRTILKKPD+E+MMKETKFD
Subjt:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK

XP_038895860.1 uncharacterized protein LOC120084028 [Benincasa hispida]

1.4e-63

96.83

Show/hide

Query:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKASSSL QTLKRY KKPWEITGPCADPEYR AVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKET+FD
Subjt:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3BR63 uncharacterized protein LOC103492624

5.7e-63

94.44

Show/hide

Query:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKA+SSL+QTL+RYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRV CPAT KEKAI+PTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+NARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK

A0A5D3BI32 Uncharacterized protein

5.7e-63

94.44

Show/hide

Query:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKA+SSL+QTL+RYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRV CPAT KEKAI+PTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+NARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK

A0A6J1E7N6 uncharacterized protein LOC111431390

2.5e-63

95.24

Show/hide

Query:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKASSS  QTLKRYIKKPWEITGPCADPEY+ AVPSA+EYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+NARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK

A0A6J1GSY9 uncharacterized protein LOC111456682

6.2e-62

92.86

Show/hide

Query:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKASSSL QTLKR+IKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTK+K IVPTSNP+TVFDIKYY+RDQRRNRPPIRR ILKKPD+E+MMKETKFD
Subjt:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK

A0A6J1KK07 uncharacterized protein LOC111495303

9.6e-63

94.44

Show/hide

Query:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKASSS  QTLKRYIKKPWEITGPCADPEY+ AVPSA+EYRVFCPA+TKEKAIVPTSNPETVFDIKYY+RDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G08060.1 unknown protein

1.2e-44

65.35

Show/hide

Query:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETK-F
        ++ A+SSL+Q L+RYIKKPW+ITGPCA PEY  AVP A EYR+ CPAT  E+AIVP+S+PETV++I Y+ RDQRRNRPPIRR +L K +V +MM E K F
Subjt:  MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETK-F

Query:  DPADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK
        D +DFPKVYLT  +EED++ RGGGY+K
Subjt:  DPADFPKVYLTAAIEEDINARGGGYQK

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCCAAAGCTTCGTCCTCCTTAATCCAAACCCTAAAGCGCTACATCAAGAAGCCTTGGGAGATCACCGGCCCGTGTGCAGATCCAGAGTACAGATCAGCCGTCCCGAG
CGCCTTAGAGTACAGGGTCTTTTGCCCCGCCACTACAAAGGAGAAAGCCATTGTCCCTACCTCCAATCCCGAGACGGTCTTCGACATTAAGTATTACACCCGCGACCAGC
GTCGCAATCGCCCTCCAATTCGACGTACCATCCTCAAGAAACCTGACGTCGAGAAGATGATGAAGGAGACCAAGTTCGACCCTGCTGACTTTCCCAAAGTTTATCTCACT
GCCGCGATCGAGGAGGATATAAATGCTCGTGGAGGTGGTTATCAGAAGTTCTTTGTGCTCTGGGAAATGTTCTCTCCAGCTTGTATTCTTCAACTCTGCTTCTCTTTCAA
TGTTAACCTGAGAGTTTGGTTATTTAGGTGTATTCTTTGGCGGATGGAGCAGCTCGTTCATTTGGAACGACTTTTGACAAATGTTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAKASSSLIQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYRSAVPSALEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFDPADFPKVYLT
AAIEEDINARGGGYQKFFVLWEMFSPACILQLCFSFNVNLRVWLFRCILWRMEQLVHLERLLTNV

Cla97C04G078580 (gene) of Watermelon (97103) v2.5 genome