; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cla97C09G176830 (gene) of Watermelon (97103) v2.5 genome

Gene IDCla97C09G176830
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. 97103 (Watermelon (97103) v2.5)
DescriptionNADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5
Genome locationCla97Chr09:25147825..25153906
RNA-Seq ExpressionCla97C09G176830
SyntenyCla97C09G176830
Gene Ontology termsGO:0015986 - ATP synthesis coupled proton transport (biological process)
GO:0042773 - ATP synthesis coupled electron transport (biological process)
GO:0005743 - mitochondrial inner membrane (cellular component)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0009579 - thylakoid (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0045263 - proton-transporting ATP synthase complex, coupling factor F(o) (cellular component)
GO:0008137 - NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity (molecular function)
GO:0008289 - lipid binding (molecular function)
GO:0015078 - proton transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domainsIPR001750 - NADH:quinone oxidoreductase/Mrp antiporter, membrane subunit


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAB8477461.1 hypothetical protein FH972_025327 [Carpinus fangiana]3.6e-14083.33Show/hide
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KAG7528117.1 NADH:quinone oxidoreductase/Mrp antiporter membrane subunit [Arabidopsis suecica]2.7e-14384.31Show/hide
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KJB09767.1 hypothetical protein B456_001G163400 [Gossypium raimondii]1.3e-13270.77Show/hide
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TKS02708.1 putative NADH dehydrogenase [Populus alba]1.9e-13378.87Show/hide
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YP_009526581.1 NADH dehydrogenase subunit 5 [Ammopiptanthus mongolicus]1.4e-13981.76Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0D2LZE3 Proton_antipo_M domain-containing protein6.1e-13370.77Show/hide
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A0A2N9G584 Proton_antipo_M domain-containing protein5.3e-13782.76Show/hide
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A0A385G2B9 NADH dehydrogenase subunit 56.7e-14081.76Show/hide
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A0A4U5PYK3 Putative NADH dehydrogenase9.4e-13478.87Show/hide
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A0A5N6L1B2 Uncharacterized protein1.8e-14083.33Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P10330 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 51.0e-9793.1Show/hide
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P26849 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 57.0e-8682.52Show/hide
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P29388 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 52.6e-9691.63Show/hide
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Q35639 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 5 (Fragment)8.1e-6698.46Show/hide
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Q37680 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 54.4e-9691.63Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG01010.1 NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 protein3.1e-4447.76Show/hide
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        +A  A  KA   NRVGDFGL  GI G + +  + +F  +F       N  ++  + L  +TL   LL +G + KSAQ   H W PDAMEGPTP+SA IHA
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        ATMV AG+F++AR  PLF   P+ + +I+  G  T  L AT  + Q D+KR +AYST SQLGYM+ A G+ +Y  ++FHL+ HA+ KALLFL +GS+IH+
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        M
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ATMG00060.1 NADH dehydrogenase subunit 5C9.0e-10596.55Show/hide
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ATMG00513.1 NADH dehydrogenase 5A9.0e-10596.55Show/hide
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ATMG00665.1 NADH dehydrogenase 5B9.0e-10596.55Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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IRKRVRLADKAAIKAMPVNRVGDFGLAPGISGRFTLFQTVDFSTIFARASAPRNSWISCNMRLNAITLICILLLIGAVGKSAQIGSHTWSPDAMEGPTPVSASIHAATMV
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