; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cla97C09G183170 (gene) of Watermelon (97103) v2.5 genome

Gene IDCla97C09G183170
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. 97103 (Watermelon (97103) v2.5)
DescriptionGPI-anchored protein LLG1
Genome locationCla97Chr09:36433671..36434099
RNA-Seq ExpressionCla97C09G183170
SyntenyCla97C09G183170
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6592129.1 GPI-anchored protein LLG1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.0e-1167.74Show/hide
Query:  MLSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
        M+SDRSFCN F+MLLLF LSLLF++SSSTSISGDVFESK+ IGR+LLQA+K   ++ + L +
Subjt:  MLSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
KAG7025004.1 GPI-anchored protein LLG1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.0e-1167.74Show/hide
Query:  MLSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
        M+SDRSFCN F+MLLLF LSLLF++SSSTSISGDVFESK+ IGR+LLQA+K   ++ + L +
Subjt:  MLSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
XP_022936417.1 GPI-anchored protein LLG1 [Cucurbita moschata]7.0e-1167.74Show/hide
Query:  MLSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
        M+SDRSFCN F+MLLLF LSLLF++SSSTSISGDVFESK+ IGR+LLQA+K   ++ + L +
Subjt:  MLSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
XP_023536509.1 GPI-anchored protein LLG1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-1066.13Show/hide
Query:  MLSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
        M+SDRSFCN F+ML+LF LSLLF++SSSTSISGDVFESK+ IGR+LLQA+K   ++ + L +
Subjt:  MLSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
XP_038896951.1 GPI-anchored protein LLG1-like [Benincasa hispida]7.5e-1375.81Show/hide
Query:  MLSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
        MLSDRSFCN FTMLLL  LSLLF SSSSTSISGDVFESK+SIGRNLLQAKK   ++ + L +
Subjt:  MLSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1CGJ1 GPI-anchored protein LLG1-like8.3e-1064.52Show/hide
Query:  MLSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
        M+SDR FCN F++LLLF LSLLF+ SS TSISGDVFES++SIGR+LLQAKK   ++ + L +
Subjt:  MLSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
A0A6J1F8E1 GPI-anchored protein LLG13.4e-1167.74Show/hide
Query:  MLSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
        M+SDRSFCN F+MLLLF LSLLF++SSSTSISGDVFESK+ IGR+LLQA+K   ++ + L +
Subjt:  MLSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
A0A6J1FTS4 GPI-anchored protein LLG1-like2.9e-1067.21Show/hide
Query:  LSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
        +SDRSFCN F+MLLLF +SLLF +SSSTSIS DVFESK SIGR LLQAKK   ++ + L++
Subjt:  LSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
A0A6J1IFC4 GPI-anchored protein LLG1-like2.2e-1064.52Show/hide
Query:  MLSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
        M+S+RSFCN F+MLLLF +SLLF++SSSTSISGDVFESK+ IGR+LLQA+K   ++ + L +
Subjt:  MLSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
A0A6J1J2M4 GPI-anchored protein LLG1-like3.7e-1067.21Show/hide
Query:  LSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
        +SDRSFCN F+MLLLF +SLLF +SSSTSIS DVFESK SIGR LLQAKK   ++ + L +
Subjt:  LSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G26466.1 lorelei8.8e-0443.14Show/hide
Query:  MLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSI-GRNLLQAKKGSTLSLQHLEF
        +L  F+++LL + SSS+SIS  VFES+ S+ GRNL  AKK   ++ +++++
Subjt:  MLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSI-GRNLLQAKKGSTLSLQHLEF

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTCTCCGATCGATCCTTCTGCAACTACTTCACGATGCTTCTTCTCTTCATCCTCTCACTGCTTTTCGCTTCTTCTTCCTCCACTTCCATTTCAGGCGATGTCTTTGA
ATCGAAGCTTTCAATCGGTCGGAACCTCCTACAGGCTAAAAAAGGTTCCACCCTTTCTCTTCAACATCTTGAGTTTGTTTTTGCTGAGTTCGTAATCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAATACAAAAATACAAAACATATTCTAAGGCGAAATTCAATTCAACAGCCTGTCTCTCGCCTTCTCGTCGGAGAAGAAGAAACTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCGCCG
GAATTATGCTCTCCGATCGATCCTTCTGCAACTACTTCACGATGCTTCTTCTCTTCATCCTCTCACTGCTTTTCGCTTCTTCTTCCTCCACTTCCATTTCAGGCGATGTC
TTTGAATCGAAGCTTTCAATCGGTCGGAACCTCCTACAGGCTAAAAAAGGTTCCACCCTTTCTCTTCAACATCTTGAGTTTGTTTTTGCTGAGTTCGTAATCTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLSDRSFCNYFTMLLLFILSLLFASSSSTSISGDVFESKLSIGRNLLQAKKGSTLSLQHLEFVFAEFVI