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Cla97C10G190157 (gene) of Watermelon (97103) v2.5 genome

Gene IDCla97C10G190157
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. 97103 (Watermelon (97103) v2.5)
DescriptionDNA-directed RNA polymerase subunit beta
Genome locationCla97Chr10:7310368..7311975
RNA-Seq ExpressionCla97C10G190157
SyntenyCla97C10G190157
Gene Ontology termsGO:0006351 - transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0009507 - chloroplast (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003899 - DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity (molecular function)
GO:0032549 - ribonucleoside binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007642 - RNA polymerase Rpb2, domain 2
IPR015712 - DNA-directed RNA polymerase, subunit 2
IPR037034 - RNA polymerase Rpb2, domain 2 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AHM88854.1 RNA polymerase beta subunit, partial [Lagenaria siceraria]2.3e-1797.92Show/hide
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AHM89856.1 RNA polymerase beta subunit [Lagenaria siceraria]2.3e-1797.92Show/hide
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AHM90682.1 RNA polymerase beta subunit [Lagenaria siceraria]2.3e-1797.92Show/hide
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YP_009753166.1 RNA polymerase subunit beta [Trichosanthes truncata]2.3e-1797.92Show/hide
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YP_009753697.1 RNA polymerase subunit beta [Trichosanthes nervifolia]2.3e-1797.92Show/hide
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A0A1P8LDX8 DNA-directed RNA polymerase subunit beta1.1e-1797.92Show/hide
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A0A2Z2CGF9 DNA-directed RNA polymerase subunit beta1.1e-1797.92Show/hide
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A0A6H0ETN6 DNA-directed RNA polymerase subunit beta1.1e-1797.92Show/hide
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A0A6M3RVI4 DNA-directed RNA polymerase subunit beta1.1e-1797.92Show/hide
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X2F5U4 DNA-directed RNA polymerase subunit beta1.1e-1797.92Show/hide
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A7Y3B9 DNA-directed RNA polymerase subunit beta5.6e-1989.58Show/hide
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A9L988 DNA-directed RNA polymerase subunit beta4.3e-1989.58Show/hide
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P11703 DNA-directed RNA polymerase subunit beta2.5e-1991.67Show/hide
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Q49L06 DNA-directed RNA polymerase subunit beta5.6e-1989.58Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
ATCG00190.1 RNA polymerase subunit beta2.2e-1883.33Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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