| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0036604.1 polyprotein [Cucumis melo var. makuwa] | 6.0e-99 | 75.79 | Show/hide |
Query: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
MDDFDVV GMEFLLEH+ I MPLAKCLVITG TP VV TD++QP+G+KMISA+QLKKGL+R+EPTFMAI + L
Subjt: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
Query: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
PKSLP RR IDHEIEL G K P KNAYRMAPPELAELRKQLDELL+AGFIRPAK PYGAPVLFQKKKDGSL+LCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Subjt: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Query: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
CLHG KYFSKLDL+SGYYQVRI + DEPKTTCVTRYG EFLVMPFGLTNAP
Subjt: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
|
|
| KAA0037220.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 3.3e-97 | 75 | Show/hide |
Query: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
MDDFDVV GMEFLLEH+ I MPLAKCLVITG TP VV TD++QP+G+KMISA+QLKKGL+R+EPTFMAI + L
Subjt: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
Query: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
PKSLP RR IDHEIEL G K P KNAYRMAPPELAELRKQLDELL+AGFIRPAK PYGAPVLFQ+KKDGSL+LCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Subjt: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Query: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
LHG KYFSKLDL+SGYYQVRI + DEPKTTCVTRYG EFLVMPFGLTNAP
Subjt: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
|
|
| KAA0067557.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 3.3e-97 | 75 | Show/hide |
Query: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
MDDFDVV GMEFLLEH+ I MPLAKCLVITG TP VV TD++QP+G+KMISA+QLKKGL+R+EPTFMAI + L
Subjt: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
Query: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
PKSLP RR IDHEIEL G K P KNAYRMAPPELAELRKQLDELL+AGFIRPAK PYGAPVLFQ+KKDGSL+LCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Subjt: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Query: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
LHG KYFSKLDL+SGYYQVRI + DEPKTTCVTRYG EFLVMPFGLTNAP
Subjt: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
|
|
| TYK07954.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 1.5e-97 | 75.4 | Show/hide |
Query: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
MDDFDVV GMEFLLEH+ I MPLAKCLVITG TP VV TD++QP+G+KMISA+QLKKGL+R+EPTFMAI + L
Subjt: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
Query: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
PKSLP RR IDHEIEL G K P KNAYRMAPPELAELRKQLDELL+AGFIRPAK PYGAPVLFQKKKDGSL+LCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Subjt: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Query: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
LHG KYFSKLDL+SGYYQVRI + DEPKTTCVTRYG EFLVMPFGLTNAP
Subjt: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
|
|
| TYK28653.1 reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa] | 1.5e-97 | 75.4 | Show/hide |
Query: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
MDDFDVV GMEFLLEH+ I MPLAKCLVITG TP VV TD++QP+G+KMISA+QLKKGL+R+EPTFMAI + L
Subjt: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
Query: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
PKSLP RR IDHEIEL G K P KNAYRMAPPELAELRKQLDELL+AGFIRPAK PYGAPVLFQKKKDGSL+LCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Subjt: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Query: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
LHG KYFSKLDL+SGYYQVRI + DEPKTTCVTRYG EFLVMPFGLTNAP
Subjt: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A5A7SZ91 Polyprotein | 2.9e-99 | 75.79 | Show/hide |
Query: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
MDDFDVV GMEFLLEH+ I MPLAKCLVITG TP VV TD++QP+G+KMISA+QLKKGL+R+EPTFMAI + L
Subjt: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
Query: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
PKSLP RR IDHEIEL G K P KNAYRMAPPELAELRKQLDELL+AGFIRPAK PYGAPVLFQKKKDGSL+LCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Subjt: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Query: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
CLHG KYFSKLDL+SGYYQVRI + DEPKTTCVTRYG EFLVMPFGLTNAP
Subjt: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
|
|
| A0A5D3BRZ6 Reverse transcriptase | 1.6e-97 | 75 | Show/hide |
Query: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
MDDFDVV GMEFLLEH+ I MPLAKCLVITG TP VV TD++QP+G+KMISA+QLKKGL+R+EPTFMAI + L
Subjt: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
Query: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
PKSLP RR IDHEIEL G K P KNAYRMAPPELAELRKQLDELL+AGFIRPAK PYGAPVLFQ+KKDGSL+LCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Subjt: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Query: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
LHG KYFSKLDL+SGYYQVRI + DEPKTTCVTRYG EFLVMPFGLTNAP
Subjt: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
|
|
| A0A5D3C4R1 Reverse transcriptase | 1.6e-97 | 75 | Show/hide |
Query: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
MDDFDVV GMEFLLEH+ I MPLAKCLVITG TP VV TD++QP+G+KMISA+QLKKGL+R+EPTFMAI + L
Subjt: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
Query: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
PKSLP RR IDHEIEL G K P KNAYRMAPPELAELRKQLDELL+AGFIRPAK PYGAPVLFQ+KKDGSL+LCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Subjt: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Query: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
LHG KYFSKLDL+SGYYQVRI + DEPKTTCVTRYG EFLVMPFGLTNAP
Subjt: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
|
|
| A0A5D3C9P8 Reverse transcriptase | 7.1e-98 | 75.4 | Show/hide |
Query: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
MDDFDVV GMEFLLEH+ I MPLAKCLVITG TP VV TD++QP+G+KMISA+QLKKGL+R+EPTFMAI + L
Subjt: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
Query: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
PKSLP RR IDHEIEL G K P KNAYRMAPPELAELRKQLDELL+AGFIRPAK PYGAPVLFQKKKDGSL+LCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Subjt: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Query: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
LHG KYFSKLDL+SGYYQVRI + DEPKTTCVTRYG EFLVMPFGLTNAP
Subjt: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
|
|
| A0A5D3DY42 Reverse transcriptase | 7.1e-98 | 75.4 | Show/hide |
Query: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
MDDFDVV GMEFLLEH+ I MPLAKCLVITG TP VV TD++QP+G+KMISA+QLKKGL+R+EPTFMAI + L
Subjt: MDDFDVVWGMEFLLEHKEILMPLAKCLVITGSTPIVVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTFMAIWV---------------------------VL
Query: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
PKSLP RR IDHEIEL G K P KNAYRMAPPELAELRKQLDELL+AGFIRPAK PYGAPVLFQKKKDGSL+LCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Subjt: PKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFD
Query: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
LHG KYFSKLDL+SGYYQVRI + DEPKTTCVTRYG EFLVMPFGLTNAP
Subjt: CLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P0CT34 Transposon Tf2-1 polyprotein | 3.0e-21 | 35.29 | Show/hide |
Query: LPKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLF
LPK + + ++ E+EL+ Y + P ++ + ++++ L +G IR +K PV+F KK+G+L++ +DY+ LNK N YPLP+I L
Subjt: LPKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLF
Query: DCLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
+ G F+KLDL+S Y+ +R+ K DE K G E+LVMP+G++ AP
Subjt: DCLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
|
|
| P0CT41 Transposon Tf2-12 polyprotein | 3.0e-21 | 35.29 | Show/hide |
Query: LPKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLF
LPK + + ++ E+EL+ Y + P ++ + ++++ L +G IR +K PV+F KK+G+L++ +DY+ LNK N YPLP+I L
Subjt: LPKSLPSRRRIDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSAGFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLF
Query: DCLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
+ G F+KLDL+S Y+ +R+ K DE K G E+LVMP+G++ AP
Subjt: DCLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNAP
|
|
| P31843 RNA-directed DNA polymerase homolog | 4.8e-27 | 70.37 | Show/hide |
Query: SLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDCLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNA
SL++CIDYRAL K+T++NKYP+P + DLFD L +F+KLDL+SGY+QVRI K DEPKTTCVTRYG+ EF VMPFGLTNA
Subjt: SLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDCLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGLTNA
|
|
| Q7LHG5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein | 1.3e-27 | 34.8 | Show/hide |
Query: VVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTF--MAIWV------VLPKSLPSRRR------IDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSA
++ D K N V I +++ N+ TF + +W+ ++ LP R + H+IE+ G + P Y + E+ K + +LL
Subjt: VVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTF--MAIWV------VLPKSLPSRRR------IDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSA
Query: GFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDCLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGL
FI P+K+P +PV+ KKDG+ +LC+DYR LNK T+ + +PLP I +L + + F+ LDL SGY+Q+ + +D KT VT G E+ VMPFGL
Subjt: GFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDCLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGL
Query: TNAP
NAP
Subjt: TNAP
|
|
| Q99315 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein | 1.3e-27 | 34.8 | Show/hide |
Query: VVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTF--MAIWV------VLPKSLPSRRR------IDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSA
++ D K N V I +++ N+ TF + +W+ ++ LP R + H+IE+ G + P Y + E+ K + +LL
Subjt: VVHTDIKQPNGVKMISALQLKKGLARNEPTF--MAIWV------VLPKSLPSRRR------IDHEIELSLGEKSPEKNAYRMAPPELAELRKQLDELLSA
Query: GFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDCLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGL
FI P+K+P +PV+ KKDG+ +LC+DYR LNK T+ + +PLP I +L + + F+ LDL SGY+Q+ + +D KT VT G E+ VMPFGL
Subjt: GFIRPAKTPYGAPVLFQKKKDGSLQLCIDYRALNKLTVRNKYPLPIITDLFDCLHGDKYFSKLDLQSGYYQVRIVKEDEPKTTCVTRYGT-EFLVMPFGL
Query: TNAP
NAP
Subjt: TNAP
|
|
