; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cla97C10G190970 (gene) of Watermelon (97103) v2.5 genome

Gene IDCla97C10G190970
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. 97103 (Watermelon (97103) v2.5)
DescriptionRas-related protein Rab-1A
Genome locationCla97Chr10:9734209..9737013
RNA-Seq ExpressionCla97C10G190970
SyntenyCla97C10G190970
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6Q4 Uncharacterized protein4.7e-10698.51Show/hide
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A0A1S3BTF1 ras-related protein RABD1 isoform X14.7e-10698.01Show/hide
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A0A6J1C4U5 ras-related protein RABD19.0e-10597.51Show/hide
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A0A6J1EMZ9 ras-related protein RABD1-like2.4e-10597.51Show/hide
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A0A6J1JCC5 ras-related protein RABD1-like2.4e-10597.51Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P16976 GTP-binding protein YPTM11.1e-8679.23Show/hide
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P40392 Ras-related protein RIC11.3e-8779.21Show/hide
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Q05737 GTP-binding protein YPTM22.8e-8779.7Show/hide
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Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c2.1e-8778.61Show/hide
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Q9ZRE2 Ras-related protein RABD11.3e-9284.16Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 54.1e-8677.23Show/hide
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AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E8.4e-6357.97Show/hide
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        +  I+++A+D+V K+LVGNK D+ E+K  V T   +A ADE GI F ETSAK + NVEQ FL++A +IK+++    T ++  G    K            
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        +KS+CCS
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AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein9.2e-9484.16Show/hide
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AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C1.5e-8878.61Show/hide
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AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A4.9e-8778.11Show/hide
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        M+ EYDYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFADDSY+DSYISTIGVDFKIRTVE DGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ YDVT++ESFNNVK
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        QWLNEIDRYA++ V KLLVGNK DL   KVV T+TAKAFADELGIPFLETSAK++ NVE+AF+ M A IK +M SQP        VQ++GQP+ Q+S CC
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Query:  S
        S
Subjt:  S


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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NDTVCKLLVGNKCDLVENKVVDTQTAKAFADELGIPFLETSAKDSINVEQAFLTMAAEIKKKMGSQPTSSKSSGNVQMKGQPIEQKSSCCS