; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cla97C10G196680 (gene) of Watermelon (97103) v2.5 genome

Gene IDCla97C10G196680
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. 97103 (Watermelon (97103) v2.5)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationCla97Chr10:26484643..26487714
RNA-Seq ExpressionCla97C10G196680
SyntenyCla97C10G196680
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_011652293.1 LOB domain-containing protein 25 isoform X2 [Cucumis sativus]3.1e-9098.83Show/hide
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XP_022152200.1 LOB domain-containing protein 25-like [Momordica charantia]8.8e-9395.21Show/hide
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XP_038905774.1 LOB domain-containing protein 25-like [Benincasa hispida]1.4e-9898.39Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI15 LOB domain-containing protein5.8e-9897.35Show/hide
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A0A1S3B938 LOB domain-containing protein 25-like3.4e-9098.25Show/hide
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A0A5D3BPW0 LOB domain-containing protein 25-like3.4e-9098.25Show/hide
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A0A6J1DD95 LOB domain-containing protein 25-like4.3e-9395.21Show/hide
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A0A6J1FAW3 LOB domain-containing protein 25-like1.1e-8594.15Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2WXT0 LOB domain-containing protein 61.5e-3962.81Show/hide
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          +L +Y  +     + S+S+
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O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 28.7e-4370.27Show/hide
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        L    ++L +Y
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Q8L8Q3 LOB domain-containing protein 251.3e-5184.68Show/hide
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        S Y+NSPCAACKFLRRKC  DCVFAPYFPPEEP KFANVH+IFGASNVSK+L+EV PHQREDAVNSLAYEAEAR+KDPVYGCVGAIS+LQRQV++LQ+EL
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        + TNADL+RYA
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Q8LQH4 LOB domain-containing protein 61.5e-3962.81Show/hide
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Q9FML4 Protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES3.3e-5077.42Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27650.1 LOB domain-containing protein 259.5e-5384.68Show/hide
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        + TNADL+RYA
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AT5G63090.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein2.3e-5177.42Show/hide
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        ELDA NADL  Y  S     +P +
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AT5G63090.2 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein2.3e-5177.42Show/hide
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AT5G63090.3 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein2.3e-5177.42Show/hide
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        ELDA NADL  Y  S     +P +
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AT5G63090.4 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein2.3e-5177.42Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFPPEEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQK
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        ELDA NADL  Y  S     +P +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGAAACAACAGCTTACAGAAAGGAGAAAAAATTATTGGAAGATGTCTTCTTCCACCTACTCCAATTCTCCCTGTGCAGCCTGCAAGTTCCTACGTCGAAAATGCCT
ACCGGATTGTGTTTTCGCACCATATTTCCCGCCCGAAGAGCCCCAAAAGTTCGCCAATGTCCACAAGATCTTCGGCGCCAGCAATGTTAGTAAACTGCTGAATGAAGTCC
AGCCGCATCAGCGGGAGGACGCTGTGAACTCGCTCGCCTACGAGGCCGAGGCAAGGATGAAAGACCCTGTCTATGGCTGCGTTGGTGCCATCTCTATACTCCAAAGGCAA
GTCATCAAGCTCCAAAAAGAGCTTGACGCTACCAACGCCGACCTCATTCGCTATGCCTGCAGCGAAATCCCCACTCCATCTCCGTCCTCGTCATCGCAATACGCTCGAAG
GTCGTCGTCGACGAGCCACGAAGGAAGCTCATCTACCTCTAGCTATGGTCATTACTATTCTGGTCTCTACTTTTCTCCATGGAGTAACAACAATAATGGCCCTTGTGGAG
ATGGCCATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATTCCCTTTGCCTTCTCTCTCTCTTACCCTTTTGTGATGATCACTGTTTCAGCAGGTTTTCTCTCTCCTTTATATCACCCATTAGGGTTTTCTTTCTCTCTCTCTCACAT
GTAAACATTATATAGGGATATCCCATAAATGTTCCTCTTTTTCTCTCTTTCTATGGCTTCAACTTCATTTTGCTTAAGCTTTTCATACAAGAGATGTTGAAACAACAGCT
TACAGAAAGGAGAAAAAATTATTGGAAGATGTCTTCTTCCACCTACTCCAATTCTCCCTGTGCAGCCTGCAAGTTCCTACGTCGAAAATGCCTACCGGATTGTGTTTTCG
CACCATATTTCCCGCCCGAAGAGCCCCAAAAGTTCGCCAATGTCCACAAGATCTTCGGCGCCAGCAATGTTAGTAAACTGCTGAATGAAGTCCAGCCGCATCAGCGGGAG
GACGCTGTGAACTCGCTCGCCTACGAGGCCGAGGCAAGGATGAAAGACCCTGTCTATGGCTGCGTTGGTGCCATCTCTATACTCCAAAGGCAAGTCATCAAGCTCCAAAA
AGAGCTTGACGCTACCAACGCCGACCTCATTCGCTATGCCTGCAGCGAAATCCCCACTCCATCTCCGTCCTCGTCATCGCAATACGCTCGAAGGTCGTCGTCGACGAGCC
ACGAAGGAAGCTCATCTACCTCTAGCTATGGTCATTACTATTCTGGTCTCTACTTTTCTCCATGGAGTAACAACAATAATGGCCCTTGTGGAGATGGCCATTGATATATA
TCAAATCTTTATAATTTGATCATCACAAGTGGGATAATATATATTCTCATATGTTGATATGGGTGTGTGAAAATTTTATGCATTTTGATTTATAAATATAAATGGTAATT
ACAAATCACACCTTTTTAATTAGTCTAATTCGTAAATTATATCTCTATGTTTAAAAAACTTGGTTTCAAACATTCTTGTAATTTGCAAAATCTAAAGATCAGAAGTACCC
TTTTGTTGGATATTAAATATATATCTGTGTGACATATATAGAATAAGTTTGGTATATCAATATTTTTTTTTTTTGGTTAAAGTTGACCAATAAAAGGGGGGGTATGATTT
GCAAATCATAAGAATCTTTGGAGTCATTTTTAAAATTTAGAGATATGACTTTTGAAATAGACTAAAGTATGAAGGTGCAATTTGCAATTATCTTGGTATATATAAATAAA
TATGTGTTGTATATTTTTTAAGGTTTGTCCATGCCCTTGTAGGGTTTGATCTCTATCTTAAATACCTCTTTGGAATGATGAGGGGATTTTAATTAATGTAACCATTTCTA
TTATTAGTGGTTTTATCTAATTGTCATCTTTTGTGTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLKQQLTERRKNYWKMSSSTYSNSPCAACKFLRRKCLPDCVFAPYFPPEEPQKFANVHKIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARMKDPVYGCVGAISILQRQ
VIKLQKELDATNADLIRYACSEIPTPSPSSSSQYARRSSSTSHEGSSSTSSYGHYYSGLYFSPWSNNNNGPCGDGH