; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Cla97C10G201690 (gene) of Watermelon (97103) v2.5 genome

Gene IDCla97C10G201690
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. 97103 (Watermelon (97103) v2.5)
DescriptionTF-B3 domain-containing protein
Genome locationCla97Chr10:31730254..31732143
RNA-Seq ExpressionCla97C10G201690
SyntenyCla97C10G201690
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR003340 - B3 DNA binding domain
IPR015300 - DNA-binding pseudobarrel domain superfamily
IPR044800 - B3 domain-containing transcription factor LEC2-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_038905859.1 B3 domain-containing protein At2g36080-like isoform X2 [Benincasa hispida]3.2e-13790.14Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LBH2 TF-B3 domain-containing protein8.3e-13186.06Show/hide
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A0A1S3B6T3 B3 domain-containing protein At2g36080-like isoform X13.5e-13789.08Show/hide
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A0A1S3B7G9 B3 domain-containing protein At2g36080-like isoform X23.5e-13789.08Show/hide
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A0A6J1F8D4 B3 domain-containing protein At2g36080-like7.8e-11379.15Show/hide
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A0A6J1IY80 B3 domain-containing protein At2g36080-like4.2e-11480.57Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q53QI0 B3 domain-containing protein Os11g01560002.1e-4652.99Show/hide
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Query:  D---GDRLFIGWKRRS--------APSPADTAVATASGGG---GWTRMFCSTN---PYPSS------------HHHHHHHHLPSPPYQSSSDSPHAESSV
            GDRLFIG +RR         AP PA      A   G    W+ M  ST+    YP+S            H H   HH    P  + S S  A S+ 
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Query:  QSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPST
                 S+ LRLFGV+L+C     EPE  +T
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Q8GYJ2 B3 domain-containing protein At2g360801.8e-5048.03Show/hide
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Query:  FRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPSPADTAVATASGGGGWTRMFCSTNPYPSSHHHHHHHHLPSPPYQS
        FRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW+RR   S                          SS  + H     S  Y  
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Query:  SSDSPHA-ESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQ--TDMSEPEPPSTLSVGSSLSLSGRDPTRHSFYTHYSSPLPHHM
            PHA   +V+SQ    GNSK LRLFGV++ECQ  +D SEP  P     GS+   +  D   H +      P P++M
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Q8RYD3 B3 domain-containing protein At3g115802.6e-4952.91Show/hide
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        A A    +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL+ +     +GD   + +KG+LLSFEDESGK W+FRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VK+K LDAG
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Query:  DVVVFERHRRDGDRLFIGWKRR--SAPSPADTAVA-------TASGGGGWT--RMFCSTNPYPSSHHHHHHHHLPSPPYQSSSDSPHAESSVQSQTVSVG
        DVV F+RHR D  RLFIGW+RR  ++ SPA + V+       TA   G  T  R   ++  YP+ H  + H+          +   HA+S      V  G
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Query:  NSKILRLFGVDLECQTDMSEPEP
        +S+ +RLFGV+LEC  D  EP P
Subjt:  NSKILRLFGVDLECQTDMSEPEP

Q9FNI3 B3 domain-containing protein At5g062508.8e-5346.9Show/hide
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Query:  SGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRR-----SAPSPADTAVATASGGGGWTRMFCSTNPY--PSSHHH
        SGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVK+K+LD GDVV F+RHR D  RLFIGW+RR     S+ +  ++AV T+S G        +T+ Y  P SH  
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Query:  HHHHHLPSPPYQSSSDSPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSTLSVGSSLSLSGRDPTRHSFYTHYSSPLPHHML
        + H+         ++ +  AE+     +  VG+S+ +RLFGV+LECQ  M E +   +++V +++  S       + Y +YS   PH+M+
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Q9M268 B3 domain-containing transcription factor NGA23.2e-3947.2Show/hide
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        MF+K +TPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL  S       + ++KGLLL+FED SG  WRFRYSYWNSSQSYV+TKGWSRFVK+K+LDAGD+V F+R   
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Query:  DGDRLFIGWKRR-SAPSPADTAVATASGGGGWTRMFCSTNPYP---------SSHHHHHHHHLPSPPYQSSSDSPHAESSVQS---------QTVSVGN-
        + D+L+I W+RR   P       A    G  + R +  T P+P         + +H  H   L    Y  S +  H  + ++S         Q  S+ + 
Subjt:  DGDRLFIGWKRR-SAPSPADTAVATASGGGGWTRMFCSTNPYP---------SSHHHHHHHHLPSPPYQSSSDSPHAESSVQS---------QTVSVGN-

Query:  -SKILRLFGVDLEC
          K LRLFGVD+EC
Subjt:  -SKILRLFGVDLEC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G36080.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein1.3e-5148.03Show/hide
Query:  MSINHFSPGFHRPLFSTPQLPIMLNPKSSLSVAAAADLLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVAAAGDSADKGLLLSFEDESGKIWR
        MSIN +S  FH       Q       ++ +     A    +FEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL+     AAA D+ +KGLLL FEDE GK WR
Subjt:  MSINHFSPGFHRPLFSTPQLPIMLNPKSSLSVAAAADLLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVAAAGDSADKGLLLSFEDESGKIWR

Query:  FRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPSPADTAVATASGGGGWTRMFCSTNPYPSSHHHHHHHHLPSPPYQS
        FRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW+RR   S                          SS  + H     S  Y  
Subjt:  FRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPSPADTAVATASGGGGWTRMFCSTNPYPSSHHHHHHHHLPSPPYQS

Query:  SSDSPHA-ESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQ--TDMSEPEPPSTLSVGSSLSLSGRDPTRHSFYTHYSSPLPHHM
            PHA   +V+SQ    GNSK LRLFGV++ECQ  +D SEP  P     GS+   +  D   H +      P P++M
Subjt:  SSDSPHA-ESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQ--TDMSEPEPPSTLSVGSSLSLSGRDPTRHSFYTHYSSPLPHHM

AT2G36080.2 AP2/B3-like transcriptional factor family protein5.1e-4862.82Show/hide
Query:  MSINHFSPGFHRPLFSTPQLPIMLNPKSSLSVAAAADLLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVAAAGDSADKGLLLSFEDESGKIWR
        MSIN +S  FH       Q       ++ +     A    +FEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQ+AE+YFPL+     AAA D+ +KGLLL FEDE GK WR
Subjt:  MSINHFSPGFHRPLFSTPQLPIMLNPKSSLSVAAAADLLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVAAAGDSADKGLLLSFEDESGKIWR

Query:  FRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPS
        FRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VKEK LDAGDVV+F RHR DG R FIGW+RR   S
Subjt:  FRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPS

AT3G11580.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein1.9e-5052.91Show/hide
Query:  AAADLLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVAAAGD---SADKGLLLSFEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAG
        A A    +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL+ +     +GD   + +KG+LLSFEDESGK W+FRYSYWNSSQSYVLTKGWSR+VK+K LDAG
Subjt:  AAADLLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVAAAGD---SADKGLLLSFEDESGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAG

Query:  DVVVFERHRRDGDRLFIGWKRR--SAPSPADTAVA-------TASGGGGWT--RMFCSTNPYPSSHHHHHHHHLPSPPYQSSSDSPHAESSVQSQTVSVG
        DVV F+RHR D  RLFIGW+RR  ++ SPA + V+       TA   G  T  R   ++  YP+ H  + H+          +   HA+S      V  G
Subjt:  DVVVFERHRRDGDRLFIGWKRR--SAPSPADTAVA-------TASGGGGWT--RMFCSTNPYPSSHHHHHHHHLPSPPYQSSSDSPHAESSVQSQTVSVG

Query:  NSKILRLFGVDLECQTDMSEPEP
        +S+ +RLFGV+LEC  D  EP P
Subjt:  NSKILRLFGVDLECQTDMSEPEP

AT5G06250.1 AP2/B3-like transcriptional factor family protein1.3e-5145.94Show/hide
Query:  MSINHFSPGFHRPLFSTPQLPIMLNPKSSLSVAAA---ADLL-PMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVAAAGD--SADKGLLLSFEDE
        MS+NH+S   H  L    Q        S  +  A     DL   +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL+     +AA D  S++KG+LLSFEDE
Subjt:  MSINHFSPGFHRPLFSTPQLPIMLNPKSSLSVAAA---ADLL-PMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVAAAGD--SADKGLLLSFEDE

Query:  SGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPSPADTAVATASGGGGWTRMFCSTNPYPSSHHHHHHHHLP
        SGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVK+K+LD GDVV F+RHR D  RLFIGW+RR   S +  A          T    +T+   +  +H  H    
Subjt:  SGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPSPADTAVATASGGGGWTRMFCSTNPYPSSHHHHHHHHLP

Query:  SPPYQSSSDSPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSTLSVGSSLSLSGRDPTRHSFYTHYSSPLPHHML
              ++ +  AE+     +  VG+S+ +RLFGV+LECQ  M E +   +++V +++  S       + Y +YS   PH+M+
Subjt:  SPPYQSSSDSPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSTLSVGSSLSLSGRDPTRHSFYTHYSSPLPHHML

AT5G06250.2 AP2/B3-like transcriptional factor family protein6.2e-5446.9Show/hide
Query:  MSINHFSPGFHRPLFSTPQLPIMLNPKSSLSVAAA---ADLL-PMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVAAAGD--SADKGLLLSFEDE
        MS+NH+S   H  L    Q        S  +  A     DL   +FEK LTPSDVGKLNRLVIPKQ+AEKYFPL+     +AA D  S++KG+LLSFEDE
Subjt:  MSINHFSPGFHRPLFSTPQLPIMLNPKSSLSVAAA---ADLL-PMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVAAAGD--SADKGLLLSFEDE

Query:  SGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRR-----SAPSPADTAVATASGGGGWTRMFCSTNPY--PSSHHH
        SGK WRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVK+K+LD GDVV F+RHR D  RLFIGW+RR     S+ +  ++AV T+S G        +T+ Y  P SH  
Subjt:  SGKIWRFRYSYWNSSQSYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRR-----SAPSPADTAVATASGGGGWTRMFCSTNPY--PSSHHH

Query:  HHHHHLPSPPYQSSSDSPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSTLSVGSSLSLSGRDPTRHSFYTHYSSPLPHHML
        + H+         ++ +  AE+     +  VG+S+ +RLFGV+LECQ  M E +   +++V +++  S       + Y +YS   PH+M+
Subjt:  HHHHHLPSPPYQSSSDSPHAESSVQSQTVSVGNSKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSTLSVGSSLSLSGRDPTRHSFYTHYSSPLPHHML


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCATAAACCACTTCTCTCCTGGCTTCCATCGACCACTCTTCTCTACTCCCCAACTCCCCATCATGCTTAACCCCAAATCATCCCTCTCCGTCGCCGCCGCCGCCGA
CCTCCTCCCCATGTTCGAAAAACCCTTAACCCCCAGCGACGTTGGCAAGCTCAACCGTCTCGTCATCCCCAAGCAATACGCCGAAAAATACTTCCCCCTCTCCCCCTCCG
CCGCGGTTGCCGCCGCCGGCGACTCTGCCGACAAGGGGTTACTCCTCAGCTTCGAAGATGAGTCCGGCAAGATATGGCGGTTCCGTTACTCTTATTGGAATAGTAGTCAG
AGCTATGTGCTAACGAAGGGGTGGAGCCGGTTTGTGAAAGAGAAGCGCCTTGACGCCGGTGATGTCGTCGTTTTTGAACGCCACCGGCGTGATGGTGATAGGTTGTTCAT
TGGGTGGAAGAGGAGGTCGGCGCCGTCTCCGGCGGACACTGCCGTGGCTACCGCGAGTGGCGGTGGAGGTTGGACTAGAATGTTCTGTTCTACAAACCCATATCCTTCTT
CTCATCATCATCATCATCACCATCATCTTCCTTCACCGCCATACCAATCTTCTTCTGATTCTCCTCATGCAGAGTCCTCTGTTCAGAGTCAAACAGTGTCGGTTGGGAAT
TCAAAGATACTGCGGTTGTTCGGAGTGGACTTGGAGTGCCAAACCGACATGTCGGAACCCGAACCACCGTCGACACTCAGTGTCGGGTCAAGCTTAAGTTTATCGGGTCG
AGATCCAACCCGCCACAGCTTCTACACACATTATTCTTCTCCTCTTCCTCATCACATGCTAGAGGATGATCAAACTACCTTTATCATGAGTAGCATTATAAAAAACATCA
CACTTAATCTATACATTTCTCTTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCCATAAACCACTTCTCTCCTGGCTTCCATCGACCACTCTTCTCTACTCCCCAACTCCCCATCATGCTTAACCCCAAATCATCCCTCTCCGTCGCCGCCGCCGCCGA
CCTCCTCCCCATGTTCGAAAAACCCTTAACCCCCAGCGACGTTGGCAAGCTCAACCGTCTCGTCATCCCCAAGCAATACGCCGAAAAATACTTCCCCCTCTCCCCCTCCG
CCGCGGTTGCCGCCGCCGGCGACTCTGCCGACAAGGGGTTACTCCTCAGCTTCGAAGATGAGTCCGGCAAGATATGGCGGTTCCGTTACTCTTATTGGAATAGTAGTCAG
AGCTATGTGCTAACGAAGGGGTGGAGCCGGTTTGTGAAAGAGAAGCGCCTTGACGCCGGTGATGTCGTCGTTTTTGAACGCCACCGGCGTGATGGTGATAGGTTGTTCAT
TGGGTGGAAGAGGAGGTCGGCGCCGTCTCCGGCGGACACTGCCGTGGCTACCGCGAGTGGCGGTGGAGGTTGGACTAGAATGTTCTGTTCTACAAACCCATATCCTTCTT
CTCATCATCATCATCATCACCATCATCTTCCTTCACCGCCATACCAATCTTCTTCTGATTCTCCTCATGCAGAGTCCTCTGTTCAGAGTCAAACAGTGTCGGTTGGGAAT
TCAAAGATACTGCGGTTGTTCGGAGTGGACTTGGAGTGCCAAACCGACATGTCGGAACCCGAACCACCGTCGACACTCAGTGTCGGGTCAAGCTTAAGTTTATCGGGTCG
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CACTTAATCTATACATTTCTCTTTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSINHFSPGFHRPLFSTPQLPIMLNPKSSLSVAAAADLLPMFEKPLTPSDVGKLNRLVIPKQYAEKYFPLSPSAAVAAAGDSADKGLLLSFEDESGKIWRFRYSYWNSSQ
SYVLTKGWSRFVKEKRLDAGDVVVFERHRRDGDRLFIGWKRRSAPSPADTAVATASGGGGWTRMFCSTNPYPSSHHHHHHHHLPSPPYQSSSDSPHAESSVQSQTVSVGN
SKILRLFGVDLECQTDMSEPEPPSTLSVGSSLSLSGRDPTRHSFYTHYSSPLPHHMLEDDQTTFIMSSIIKNITLNLYISL