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Cla97C11G214065 (gene) of Watermelon (97103) v2.5 genome

Gene IDCla97C11G214065
OrganismCitrullus lanatus subsp. vulgaris cv. 97103 (Watermelon (97103) v2.5)
DescriptionATP synthase subunit beta, chloroplastic
Genome locationCla97Chr11:7643652..7644713
RNA-Seq ExpressionCla97C11G214065
SyntenyCla97C11G214065
Gene Ontology termsGO:0015986 - ATP synthesis coupled proton transport (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0045261 - proton-transporting ATP synthase complex, catalytic core F(1) (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0046933 - proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism (molecular function)
GO:0046961 - proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism (molecular function)
InterPro domainsIPR000194 - ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, nucleotide-binding domain
IPR003593 - AAA+ ATPase domain
IPR004100 - ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, N-terminal domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase
IPR036121 - ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, N-terminal domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
QIT04057.1 CF1 subunit beta [Luffa aegyptiaca]8.7e-15899.31Show/hide
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A0A6H0ETN9 ATP synthase subunit beta, chloroplastic8.5e-15999.66Show/hide
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A6MM43 ATP synthase subunit beta, chloroplastic5.9e-15796.21Show/hide
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Q9MRR1 ATP synthase subunit beta, chloroplastic6.5e-15695.86Show/hide
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Q9MU41 ATP synthase subunit beta, chloroplastic3.8e-15696.21Show/hide
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Query:  PVGGATLGRIFNVLGEPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAFIQLDTKLSIFETGIKVVDLLAPYRRGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNIAKAHGGVSVFG
        PVGGATLGRIFNVLGEP+DNLGPVDTRTTSPIHRSAPAFIQLDTKLSIFETGIKVVDLLAPYRRGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNIAKAHGGVSVFG
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        GVGERTREGNDLYMEMKESGVINE+NIAESKVALVYGQMNEPPGARMRVGLTALTMAEYFRDVNEQDVLLFIDNIFRFVQAGSEVSALLG
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G08670.1 ATP synthase alpha/beta family protein1.4e-9265.94Show/hide
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        K   GR+ Q+IG ++DV F   + +P I  +L V+   T      +  EV   LG N VR +AM  T+GL+RG +V++T AP++VPVG ATLGRI NVLG
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        EPID  G + T    PIHR APA + L T   I  TGIKVVDLLAPY+RGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINN+AKAHGG SVF GVGERTREGNDLY E
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Query:  MKESGVIN-EENIAESKVALVYGQMNEPPGARMRVGLTALTMAEYFRDVNEQDVLLFIDNIFRFVQAGSEVSALLG
        M ESGVI   E  +ESK ALVYGQMNEPPGAR RVGLT LT+AEYFRD   QDVLLFIDNIFRF QA SEVSALLG
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AT5G08680.1 ATP synthase alpha/beta family protein1.4e-9265.94Show/hide
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        K   GR+ Q+IG ++DV F   + +P I  +L V+   T      +  EV   LG N VR +AM  T+GL+RG +V++T AP++VPVG ATLGRI NVLG
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        EPID  G + T    PIHR APA + L T   I  TGIKVVDLLAPY+RGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINN+AKAHGG SVF GVGERTREGNDLY E
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        M ESGVI   E  +ESK ALVYGQMNEPPGAR RVGLT LT+AEYFRD   QDVLLFIDNIFRF QA SEVSALLG
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AT5G08690.1 ATP synthase alpha/beta family protein1.4e-9265.94Show/hide
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        EPID  G + T    PIHR APA + L T   I  TGIKVVDLLAPY+RGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINN+AKAHGG SVF GVGERTREGNDLY E
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        M ESGVI   E  +ESK ALVYGQMNEPPGAR RVGLT LT+AEYFRD   QDVLLFIDNIFRF QA SEVSALLG
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ATCG00480.1 ATP synthase subunit beta2.6e-15293.1Show/hide
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        MR NPTTS PEVS  EK N GRIAQIIGPVLDVAFPPGKMPNIYNAL+VKG+DT GQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSAT+GL RGM+VVD   PLSV
Subjt:  MRINPTTSGPEVSTLEKNNSGRIAQIIGPVLDVAFPPGKMPNIYNALIVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGMEVVDTRAPLSV

Query:  PVGGATLGRIFNVLGEPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAFIQLDTKLSIFETGIKVVDLLAPYRRGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNIAKAHGGVSVFG
        PVGGATLGRIFNVLGEP+DNLGPVDTRTTSPIH+SAPAFI+LDTKLSIFETGIKVVDLLAPYRRGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNIAKAHGGVSVFG
Subjt:  PVGGATLGRIFNVLGEPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAFIQLDTKLSIFETGIKVVDLLAPYRRGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNIAKAHGGVSVFG

Query:  GVGERTREGNDLYMEMKESGVINEENIAESKVALVYGQMNEPPGARMRVGLTALTMAEYFRDVNEQDVLLFIDNIFRFVQAGSEVSALLG
        GVGERTREGNDLYMEMKESGVINE+N+AESKVALVYGQMNEPPGARMRVGLTALTMAEYFRDVNEQDVLLFIDNIFRFVQAGSEVSALLG
Subjt:  GVGERTREGNDLYMEMKESGVINEENIAESKVALVYGQMNEPPGARMRVGLTALTMAEYFRDVNEQDVLLFIDNIFRFVQAGSEVSALLG

ATCG01010.1 NADH-Ubiquinone oxidoreductase (complex I), chain 5 protein1.9e-2279.69Show/hide
Query:  VSALLGFWSKDEILNDSWLYSPIFAIIACSTAGLTAFYMFRIYLLTFDGHLNLYCKNYSGKTYG
        +  L  FWSKDEILNDS L+SPIFAIIACSTAGLTAFYMFRIYLLTF+GHLN Y  NYSGK  G
Subjt:  VSALLGFWSKDEILNDSWLYSPIFAIIACSTAGLTAFYMFRIYLLTFDGHLNLYCKNYSGKTYG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGAATAAATCCTACGACGTCTGGTCCTGAAGTTTCCACGCTTGAAAAAAACAACTCGGGACGTATCGCTCAAATCATTGGTCCGGTACTAGATGTAGCTTTTCCCCC
GGGCAAAATGCCTAATATTTACAACGCTTTGATAGTTAAAGGTCAAGATACTGCCGGTCAAGAAATTAATGTGACTTGTGAAGTACAGCAATTATTAGGAAATAATCGAG
TTAGAGCTGTAGCTATGAGTGCTACAGATGGTCTAATGAGAGGAATGGAAGTGGTTGACACGAGAGCTCCTCTAAGTGTTCCAGTCGGCGGAGCGACTCTCGGCCGAATT
TTCAACGTGCTTGGAGAGCCTATTGATAATTTGGGTCCTGTAGATACTCGCACAACATCTCCTATTCATAGATCCGCCCCGGCTTTTATACAGTTAGATACAAAATTATC
TATTTTTGAAACAGGAATTAAAGTAGTGGATCTTTTAGCCCCTTATCGACGTGGAGGAAAAATAGGACTATTCGGAGGGGCTGGAGTGGGTAAAACAGTACTCATTATGG
AATTGATCAACAACATTGCCAAAGCTCATGGAGGTGTATCCGTATTTGGAGGAGTAGGTGAACGTACTCGTGAAGGAAATGATCTTTACATGGAAATGAAAGAATCCGGA
GTAATTAATGAAGAAAATATTGCAGAATCAAAAGTGGCTCTAGTCTACGGTCAGATGAATGAACCGCCGGGAGCTCGTATGAGAGTTGGTTTAACTGCCCTAACTATGGC
GGAATATTTTCGAGATGTTAATGAACAAGACGTGCTTCTATTTATTGACAATATCTTCCGTTTCGTTCAAGCGGGATCCGAAGTATCCGCGTTACTGGGCTTTTGGTCCA
AAGATGAAATTCTTAATGATAGTTGGTTGTATTCACCGATTTTCGCAATAATAGCCTGTTCCACAGCTGGATTAACAGCATTTTATATGTTTCGCATCTACTTACTTACT
TTTGATGGACATTTAAACCTTTATTGTAAAAATTACAGTGGAAAAACCTACGGTAGAGCGGTTTATGTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGAATAAATCCTACGACGTCTGGTCCTGAAGTTTCCACGCTTGAAAAAAACAACTCGGGACGTATCGCTCAAATCATTGGTCCGGTACTAGATGTAGCTTTTCCCCC
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TTCAACGTGCTTGGAGAGCCTATTGATAATTTGGGTCCTGTAGATACTCGCACAACATCTCCTATTCATAGATCCGCCCCGGCTTTTATACAGTTAGATACAAAATTATC
TATTTTTGAAACAGGAATTAAAGTAGTGGATCTTTTAGCCCCTTATCGACGTGGAGGAAAAATAGGACTATTCGGAGGGGCTGGAGTGGGTAAAACAGTACTCATTATGG
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TTTGATGGACATTTAAACCTTTATTGTAAAAATTACAGTGGAAAAACCTACGGTAGAGCGGTTTATGTATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRINPTTSGPEVSTLEKNNSGRIAQIIGPVLDVAFPPGKMPNIYNALIVKGQDTAGQEINVTCEVQQLLGNNRVRAVAMSATDGLMRGMEVVDTRAPLSVPVGGATLGRI
FNVLGEPIDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAFIQLDTKLSIFETGIKVVDLLAPYRRGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNIAKAHGGVSVFGGVGERTREGNDLYMEMKESG
VINEENIAESKVALVYGQMNEPPGARMRVGLTALTMAEYFRDVNEQDVLLFIDNIFRFVQAGSEVSALLGFWSKDEILNDSWLYSPIFAIIACSTAGLTAFYMFRIYLLT
FDGHLNLYCKNYSGKTYGRAVYV