; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc00G01060 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc00G01060
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionrapid alkalinization factor-like
Genome locationClcCtg005:9822..10178
RNA-Seq ExpressionClc00G01060
SyntenyClc00G01060
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
GO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7014377.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.7e-4478.81Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAK+S LLPF FIAA L V ST V AT+TK PSWVLD A A CHGSMA+CMMD+IEF+M+SEINRRIL D+NYISYDAL+ N VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGCSAI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

XP_011659776.1 rapid alkalinization factor [Cucumis sativus]1.5e-4277.97Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MA  VS LLP F + AIL VSSTA      KTPSWVLD A A CHGSMAECMM++IEF+M+SEINRRIL DLNYISYDALK N+VPCSRKGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGC+AISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

XP_022153599.1 protein RALF-like 33 [Momordica charantia]1.3e-4683.05Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAKVS LLPF  I AIL VSSTAVFA ST++PSWVLD ARA CHGSMAECMMD IE+EMNSEINRRIL   NYISY+ALK NTVPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGCSAI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

XP_022953165.1 rapid alkalinization factor-like [Cucurbita moschata]2.2e-4479.66Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAK+S LLPF FIAA L V STAV AT+TK PSWVLD A A CHGSMA+CMMD+IEF+M+SEINRRIL D+NYISYDAL+ N VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGCSAI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

XP_038896330.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]1.3e-4986.44Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAKVS LLPFF +AAIL VSSTAV  TSTKTPSWVLD ARA CHGSMAECMM +IEFEMNS+INRRIL DLNYISYDALK NTVPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGC+AISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K607 Uncharacterized protein7.5e-4377.97Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MA  VS LLP F + AIL VSSTA      KTPSWVLD A A CHGSMAECMM++IEF+M+SEINRRIL DLNYISYDALK N+VPCSRKGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGC+AISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

A0A1S3BRF1 rapid alkalinization factor-like1.1e-4177.12Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAKVS LLP F + AIL VSSTA       TPSWVL  A A CHGSMAECM ++IEFEM+SEINRRIL DLNYISYDAL+ N+VPCSRKGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGC+AISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

A0A5A7VLB3 Rapid alkalinization factor-like1.1e-4177.12Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAKVS LLP F + AIL VSSTA       TPSWVL  A A CHGSMAECM ++IEFEM+SEINRRIL DLNYISYDAL+ N+VPCSRKGASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGC+AISRCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

A0A6J1DJJ4 protein RALF-like 336.5e-4783.05Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAKVS LLPF  I AIL VSSTAVFA ST++PSWVLD ARA CHGSMAECMMD IE+EMNSEINRRIL   NYISY+ALK NTVPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGCSAI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

A0A6J1GNW5 rapid alkalinization factor-like1.0e-4479.66Show/hide
Query:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG
        MAAK+S LLPF FIAA L V STAV AT+TK PSWVLD A A CHGSMA+CMMD+IEF+M+SEINRRIL D+NYISYDAL+ N VPCSR+GASYYNCQPG
Subjt:  MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPG

Query:  AEANPYNRGCSAISRCRS
        AEANPY+RGCSAI+RCRS
Subjt:  AEANPYNRGCSAISRCRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 333.4e-2455.75Show/hide
Query:  SLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNI--EFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN
        S  P   I AIL V    +FA  T   S       + C+G++AEC +     EFEM+SEINRRIL    YISY AL+ NTVPCSR+GASYYNC+ GA+AN
Subjt:  SLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNI--EFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN

Query:  PYNRGCSAISRCR
        PY+RGCSAI+RCR
Subjt:  PYNRGCSAISRCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor2.3e-2563.53Show/hide
Query:  WVLDA-ARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCRS
        WV+ A +   C GS+ EC+ +  EFE++SE NRRIL    YISY AL+ N+VPCSR+GASYYNC+PGA+ANPY+RGCSAI+RCRS
Subjt:  WVLDA-ARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCRS

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 234.5e-2146.51Show/hide
Query:  SSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTP-SWVLDAARAHCHGSMAECMMD----------------NIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCS
        S     F I  IL V + +V  +S  T  +         C G++AEC +                   EFEM+SEINRRIL    YISY AL+ NT+PCS
Subjt:  SSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTP-SWVLDAARAHCHGSMAECMMD----------------NIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCS

Query:  RKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCR
        R+GASYYNC+ GA+ANPY+RGCSAI+RCR
Subjt:  RKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCR

Q9MA62 Protein RALF-like 225.4e-2251.33Show/hide
Query:  FFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARA-------HCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN
        + + AIL +  +AV +T     S  LD  RA        C GS+AEC+ +  E E +S+I+RRIL    YISY A++ N+VPCSR+GASYYNCQ GA+AN
Subjt:  FFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARA-------HCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN

Query:  PYNRGCSAISRCR
        PY+RGCS I+RCR
Subjt:  PYNRGCSAISRCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 13.7e-2355.05Show/hide
Query:  IAAILMVSSTAV---FATSTKTPSWVLDAAR-AHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRG
        I  + ++SS  V   FA      +W       + CHGS+AEC+    E EM+SEINRRIL    YISY +LK N+VPCSR+GASYYNCQ GA+ANPY+RG
Subjt:  IAAILMVSSTAV---FATSTKTPSWVLDAAR-AHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRG

Query:  CSAISRCRS
        CS I+RCRS
Subjt:  CSAISRCRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 12.6e-2455.05Show/hide
Query:  IAAILMVSSTAV---FATSTKTPSWVLDAAR-AHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRG
        I  + ++SS  V   FA      +W       + CHGS+AEC+    E EM+SEINRRIL    YISY +LK N+VPCSR+GASYYNCQ GA+ANPY+RG
Subjt:  IAAILMVSSTAV---FATSTKTPSWVLDAAR-AHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRG

Query:  CSAISRCRS
        CS I+RCRS
Subjt:  CSAISRCRS

AT2G33775.1 ralf-like 191.2e-1342.31Show/hide
Query:  IAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRR-ILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSA
        I  IL + + AV A S    +W L  +  +  G + E     +++ M+SE NRR +    +YISY AL+ N VPCSR+G SYY+C+    ANPY RGCS 
Subjt:  IAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRR-ILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSA

Query:  ISRC
        I+ C
Subjt:  ISRC

AT3G05490.1 ralf-like 223.8e-2351.33Show/hide
Query:  FFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARA-------HCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN
        + + AIL +  +AV +T     S  LD  RA        C GS+AEC+ +  E E +S+I+RRIL    YISY A++ N+VPCSR+GASYYNCQ GA+AN
Subjt:  FFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARA-------HCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN

Query:  PYNRGCSAISRCR
        PY+RGCS I+RCR
Subjt:  PYNRGCSAISRCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 233.2e-2246.51Show/hide
Query:  SSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTP-SWVLDAARAHCHGSMAECMMD----------------NIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCS
        S     F I  IL V + +V  +S  T  +         C G++AEC +                   EFEM+SEINRRIL    YISY AL+ NT+PCS
Subjt:  SSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTP-SWVLDAARAHCHGSMAECMMD----------------NIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCS

Query:  RKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCR
        R+GASYYNC+ GA+ANPY+RGCSAI+RCR
Subjt:  RKGASYYNCQPGAEANPYNRGCSAISRCR

AT4G15800.1 ralf-like 332.4e-2555.75Show/hide
Query:  SLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNI--EFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN
        S  P   I AIL V    +FA  T   S       + C+G++AEC +     EFEM+SEINRRIL    YISY AL+ NTVPCSR+GASYYNC+ GA+AN
Subjt:  SLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNI--EFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEAN

Query:  PYNRGCSAISRCR
        PY+RGCSAI+RCR
Subjt:  PYNRGCSAISRCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
atggcagccaaggtttcttctctcctaccatttttctttatcgctgcaatcctgatggtctcctccactgcggtatttgccaccagcaccaagaccccaagctgggtcct
cgatgcagctcgagctcactgtcacggctccatggcagagtgcatgatggacaatattgaatttgagatgaactctgagatcaatagacgcatattgacagatttaaact
acataagctacgacgcgctcaaggtcaacacagtgccatgctcacgcaaaggagcatcttactacaattgtcagccaggtgccgaagccaacccctacaaccgtggctgc
agtgctatttctcgttgccgaagctaa
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
atggcagccaaggtttcttctctcctaccatttttctttatcgctgcaatcctgatggtctcctccactgcggtatttgccaccagcaccaagaccccaagctgggtcct
cgatgcagctcgagctcactgtcacggctccatggcagagtgcatgatggacaatattgaatttgagatgaactctgagatcaatagacgcatattgacagatttaaact
acataagctacgacgcgctcaaggtcaacacagtgccatgctcacgcaaaggagcatcttactacaattgtcagccaggtgccgaagccaacccctacaaccgtggctgc
agtgctatttctcgttgccgaagctaa
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAKVSSLLPFFFIAAILMVSSTAVFATSTKTPSWVLDAARAHCHGSMAECMMDNIEFEMNSEINRRILTDLNYISYDALKVNTVPCSRKGASYYNCQPGAEANPYNRGC
SAISRCRS