; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc00G01510 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc00G01510
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptioncyclin-dependent kinase F-1
Genome locationClcCtg008:115859..117392
RNA-Seq ExpressionClc00G01510
SyntenyClc00G01510
Gene Ontology termsGO:0010078 - maintenance of root meristem identity (biological process)
GO:1904031 - positive regulation of cyclin-dependent protein kinase activity (biological process)
GO:0016592 - mediator complex (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0008353 - RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity (molecular function)
GO:0019912 - cyclin-dependent protein kinase activating kinase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000719 - Protein kinase domain
IPR008271 - Serine/threonine-protein kinase, active site
IPR011009 - Protein kinase-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7030435.1 Cyclin-dependent kinase F-1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-18192.65Show/hide
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XP_008458494.1 PREDICTED: cyclin-dependent kinase F-1 [Cucumis melo]8.9e-18492.94Show/hide
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XP_022999480.1 cyclin-dependent kinase F-1 [Cucurbita maxima]6.4e-18292.65Show/hide
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XP_038890675.1 cyclin-dependent kinase F-1 [Benincasa hispida]3.0e-18794.41Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LIT0 Protein kinase domain-containing protein2.9e-18091.47Show/hide
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A0A1S3C833 cyclin-dependent kinase F-14.3e-18492.94Show/hide
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A0A5D3CJX8 Cyclin-dependent kinase F-14.3e-18492.94Show/hide
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A0A6J1G4E9 cyclin-dependent kinase F-11.3e-18392.94Show/hide
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A0A6J1KFI2 cyclin-dependent kinase F-13.1e-18292.65Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2YCH5 Cyclin-dependent kinase F-11.0e-9753.2Show/hide
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        ++  + DK +   DG+ SCLATC+T+D++DDPF+ +SYSY+ E G+  ++  G+ TSCVGTRWFRAPELLYGST+YG E+DLW+LGCI AELF LEP+FP
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        GT+DIDQ+ +I + LGN+TE+++PGCS LPD+  I FN +EKPIGLEACLP+ S  E+SI+KRLLCY+P  RA+A +LL D YF EEPLPVP+  L VP 
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        +K  +D+DS   W ++   + DSD DEFG M+VT T  G+SI+F
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A8WIP6 Cyclin-dependent kinase 203.1e-3042.11Show/hide
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        +++G    +  V TRW+RAPELLYG+  Y   +DLWA+GCIF EL    PLFPG  DI+Q+  +   LG   +  WP  +ELPD+  I+F     PI LE
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          +P+ SP  + ++K+ L Y    R +A + L   YF  +PLP   SEL +P
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A8WIP6 Cyclin-dependent kinase 201.1e-0368.97Show/hide
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        I+HRD+KP+NLLIS  G LK+ADFG AR+
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O80345 Cyclin-dependent kinase F-12.2e-11358.48Show/hide
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        +IVHRD+KP N+LISDDGVLKLADFGQARILME + V S+E  Q  ++   D    S+P  + P  E+S R+G+  +E+E +SK+EYFR ++ELKAK   
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         ++ DK++  +DGD SCLATCT S+++DD    +S+SY+ +  V  DD QG +TSCVGTRWFR PELLYGST YGLE+DLW+LGC+FAEL +LEPLFPG 
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Query:  ADIDQMSKIFTTLGNLTEDSWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLPNCSPDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTEEPLPVPLSELHVPTTK
        +DIDQ+S++   LGNL E+ WPGC +LPD++ ISF  +E P+G+E CLPN S D IS++K+L+CY+PA+RAT ME+L DKY +EEPLPVP+SEL+VP T 
Subjt:  ADIDQMSKIFTTLGNLTEDSWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLPNCSPDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTEEPLPVPLSELHVPTTK

Query:  TGQDEDSPAGWYDYNEL--DSDMDEFGPMNVTTTATGYSIQF
        +G DEDSP  W DY E+  DSD D FGPMNV  T++G++I+F
Subjt:  TGQDEDSPAGWYDYNEL--DSDMDEFGPMNVTTTATGYSIQF

Q5R7I7 Cyclin-dependent kinase 201.8e-3044Show/hide
Query:  DGQGSLTSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWALGCIFAELFTLEPLFPGTADIDQMSKIFTTLGNLTEDSWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEAC
        DG    T  V TRW+RAPELLYG+  Y   +DLWA+GCI  EL    PLFPG  DI+Q+  +   LG      WP  +ELPD+  ISF   + P+ LE  
Subjt:  DGQGSLTSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWALGCIFAELFTLEPLFPGTADIDQMSKIFTTLGNLTEDSWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEAC

Query:  LPNCSPDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTEEPLPVPLSELHVP
        LP+ SP  + ++ + L Y P  R  A + L  +YF   PLP   SEL +P
Subjt:  LPNCSPDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTEEPLPVPLSELHVP

Q5R7I7 Cyclin-dependent kinase 203.8e-0472.41Show/hide
Query:  IVHRDMKPSNLLISDDGVLKLADFGQARI
        IVHRD+KP+NLLIS  G LK+ADFG AR+
Subjt:  IVHRDMKPSNLLISDDGVLKLADFGQARI

Q5Z754 Cyclin-dependent kinase F-11.0e-9753.2Show/hide
Query:  IVHRDMKPSNLLISDDGVLKLADFGQARILMEPEYVESNEISQPCEMNSSDQVPASQPSTIFPGTE----SSVREGNRTEEQEPISKEEYFRVLDELKAK
        +VHRD+KP+NLLIS+DGVLK+AD GQARIL E    +      P E +S  +   SQ   +  G +    S   E    +E E ++  +Y   +D+L+AK
Subjt:  IVHRDMKPSNLLISDDGVLKLADFGQARILMEPEYVESNEISQPCEMNSSDQVPASQPSTIFPGTE----SSVREGNRTEEQEPISKEEYFRVLDELKAK

Query:  NSANEFDKETYTYDGDTSCLATCTTSDLEDDPFKGSSYSYEMEGGVPADDGQGSLTSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWALGCIFAELFTLEPLFP
        ++  + DK +   DG+ SCLATC+T+D++DDPF+ +SYSY+ E G+  ++  G+ TSCVGTRWFRAPELLYGST+YG E+DLW+LGCI AELF LEP+FP
Subjt:  NSANEFDKETYTYDGDTSCLATCTTSDLEDDPFKGSSYSYEMEGGVPADDGQGSLTSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWALGCIFAELFTLEPLFP

Query:  GTADIDQMSKIFTTLGNLTEDSWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLPNCSPDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTEEPLPVPLSELHVPT
        GT+DIDQ+ +I + LGN+TE+++PGCS LPD+  I FN +EKPIGLEACLP+ S  E+SI+KRLLCY+P  RA+A +LL D YF EEPLPVP+  L VP 
Subjt:  GTADIDQMSKIFTTLGNLTEDSWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLPNCSPDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTEEPLPVPLSELHVPT

Query:  TKTGQDEDSPAGWYDY--NELDSDMDEFGPMNVTTTATGYSIQF
        +K  +D+DS   W ++   + DSD DEFG M+VT T  G+SI+F
Subjt:  TKTGQDEDSPAGWYDY--NELDSDMDEFGPMNVTTTATGYSIQF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G18040.1 cyclin-dependent kinase D1;33.0e-2837.5Show/hide
Query:  TSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWALGCIFAELFTLEPLFPGTADIDQMSKIFTTLGNLTEDSWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLPNCSP
        T  V  RW+RAPELL+G+  YG  +D+WA+ CIFAEL    P   G +DIDQ+SKIF   G    D WP  ++LPD+  + +  +  P  L +  P  S 
Subjt:  TSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWALGCIFAELFTLEPLFPGTADIDQMSKIFTTLGNLTEDSWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLPNCSP

Query:  DEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTEEPLPVPLSELHVPTTKTGQDEDSPAGWYD
        D + ++ ++  Y+P  R +  + L+ +YFT  P P   ++L  P  K  QD  S  G ++
Subjt:  DEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTEEPLPVPLSELHVPTTKTGQDEDSPAGWYD

AT1G18040.1 cyclin-dependent kinase D1;34.2e-0669.7Show/hide
Query:  IVHRDMKPSNLLISDDGVLKLADFGQARILMEP
        ++HRDMKP+NLLI  DG LKLADFG ARI   P
Subjt:  IVHRDMKPSNLLISDDGVLKLADFGQARILMEP

AT1G73690.1 cyclin-dependent kinase D1;13.3e-2738.78Show/hide
Query:  TSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWALGCIFAELFTLEPLFPGTADIDQMSKIFTTLGNLTEDSWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLPNCSP
        T  V  RW+RAPELL+G+  Y   +D+WA GCIFAEL    P   G +DIDQ+SKIF   G    D WP    LPD+  + +  +  P  L + LP  S 
Subjt:  TSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWALGCIFAELFTLEPLFPGTADIDQMSKIFTTLGNLTEDSWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLPNCSP

Query:  DEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTEEPLPVPLSELHVPTTK
        D + ++ ++  Y+P +R +  + L+ +YFT  P P    +L  P +K
Subjt:  DEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTEEPLPVPLSELHVPTTK

AT1G73690.1 cyclin-dependent kinase D1;19.3e-0666.67Show/hide
Query:  IVHRDMKPSNLLISDDGVLKLADFGQARILMEP
        ++HRDMKP+NLLI  +G LKLADFG ARI   P
Subjt:  IVHRDMKPSNLLISDDGVLKLADFGQARILMEP

AT3G48750.1 cell division control 28.7e-2841.35Show/hide
Query:  SLTSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWALGCIFAELFTLEPLFPGTADIDQMSKIFTTLGNLTEDSWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLPNC
        + T  V T W+RAPE+L GS  Y   +D+W++GCIFAE+ + +PLFPG ++IDQ+ KIF  +G   ED+W G + LPD++  S     KP  LE  +PN 
Subjt:  SLTSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWALGCIFAELFTLEPLFPGTADIDQMSKIFTTLGNLTEDSWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLPNC

Query:  SPDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTE
         PD + ++ ++L  +P  R  A   L+ +YF +
Subjt:  SPDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTE

AT4G28980.1 CDK-activating kinase 1AT1.6e-11458.48Show/hide
Query:  MIVHRDMKPSNLLISDDGVLKLADFGQARILMEPEYVESNEISQPCEMNSSDQVPASQPSTIFPGTESSVREGNRTEEQEPISKEEYFRVLDELKAKNSA
        +IVHRD+KP N+LISDDGVLKLADFGQARILME + V S+E  Q  ++   D    S+P  + P  E+S R+G+  +E+E +SK+EYFR ++ELKAK   
Subjt:  MIVHRDMKPSNLLISDDGVLKLADFGQARILMEPEYVESNEISQPCEMNSSDQVPASQPSTIFPGTESSVREGNRTEEQEPISKEEYFRVLDELKAKNSA

Query:  -NEFDKETYTYDGDTSCLATCTTSDLEDDPFKGSSYSYEMEGGVPADDGQGSLTSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWALGCIFAELFTLEPLFPGT
         ++ DK++  +DGD SCLATCT S+++DD    +S+SY+ +  V  DD QG +TSCVGTRWFR PELLYGST YGLE+DLW+LGC+FAEL +LEPLFPG 
Subjt:  -NEFDKETYTYDGDTSCLATCTTSDLEDDPFKGSSYSYEMEGGVPADDGQGSLTSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWALGCIFAELFTLEPLFPGT

Query:  ADIDQMSKIFTTLGNLTEDSWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLPNCSPDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTEEPLPVPLSELHVPTTK
        +DIDQ+S++   LGNL E+ WPGC +LPD++ ISF  +E P+G+E CLPN S D IS++K+L+CY+PA+RAT ME+L DKY +EEPLPVP+SEL+VP T 
Subjt:  ADIDQMSKIFTTLGNLTEDSWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLPNCSPDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTEEPLPVPLSELHVPTTK

Query:  TGQDEDSPAGWYDYNEL--DSDMDEFGPMNVTTTATGYSIQF
        +G DEDSP  W DY E+  DSD D FGPMNV  T++G++I+F
Subjt:  TGQDEDSPAGWYDYNEL--DSDMDEFGPMNVTTTATGYSIQF

AT4G28980.2 CDK-activating kinase 1AT1.6e-11458.48Show/hide
Query:  MIVHRDMKPSNLLISDDGVLKLADFGQARILMEPEYVESNEISQPCEMNSSDQVPASQPSTIFPGTESSVREGNRTEEQEPISKEEYFRVLDELKAKNSA
        +IVHRD+KP N+LISDDGVLKLADFGQARILME + V S+E  Q  ++   D    S+P  + P  E+S R+G+  +E+E +SK+EYFR ++ELKAK   
Subjt:  MIVHRDMKPSNLLISDDGVLKLADFGQARILMEPEYVESNEISQPCEMNSSDQVPASQPSTIFPGTESSVREGNRTEEQEPISKEEYFRVLDELKAKNSA

Query:  -NEFDKETYTYDGDTSCLATCTTSDLEDDPFKGSSYSYEMEGGVPADDGQGSLTSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWALGCIFAELFTLEPLFPGT
         ++ DK++  +DGD SCLATCT S+++DD    +S+SY+ +  V  DD QG +TSCVGTRWFR PELLYGST YGLE+DLW+LGC+FAEL +LEPLFPG 
Subjt:  -NEFDKETYTYDGDTSCLATCTTSDLEDDPFKGSSYSYEMEGGVPADDGQGSLTSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWALGCIFAELFTLEPLFPGT

Query:  ADIDQMSKIFTTLGNLTEDSWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLPNCSPDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTEEPLPVPLSELHVPTTK
        +DIDQ+S++   LGNL E+ WPGC +LPD++ ISF  +E P+G+E CLPN S D IS++K+L+CY+PA+RAT ME+L DKY +EEPLPVP+SEL+VP T 
Subjt:  ADIDQMSKIFTTLGNLTEDSWPGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLPNCSPDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTEEPLPVPLSELHVPTTK

Query:  TGQDEDSPAGWYDYNEL--DSDMDEFGPMNVTTTATGYSIQF
        +G DEDSP  W DY E+  DSD D FGPMNV  T++G++I+F
Subjt:  TGQDEDSPAGWYDYNEL--DSDMDEFGPMNVTTTATGYSIQF


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATCGTGCATAGGGATATGAAACCTAGCAATTTGTTGATCTCCGATGATGGCGTGCTCAAGCTTGCCGATTTTGGACAGGCAAGGATACTCATGGAGCCTGAATATGT
TGAATCGAATGAGATCTCTCAACCATGTGAGATGAACTCTTCAGATCAGGTGCCTGCTTCTCAGCCATCTACAATTTTTCCAGGAACAGAAAGCTCGGTTCGAGAAGGTA
ACAGAACTGAGGAACAAGAACCAATTAGCAAAGAAGAATATTTTAGAGTTTTAGACGAGTTGAAAGCAAAAAATTCAGCAAATGAATTTGACAAGGAAACATATACTTAT
GATGGAGATACATCTTGCTTAGCAACATGTACCACAAGTGACCTTGAAGATGATCCATTCAAAGGTTCATCATATTCTTACGAAATGGAAGGGGGAGTTCCAGCAGATGA
TGGACAAGGTTCTCTCACCTCATGTGTTGGTACTCGCTGGTTCAGGGCCCCTGAATTACTCTATGGCTCTACGAGCTACGGTTTGGAGATCGACTTATGGGCATTGGGCT
GCATTTTTGCTGAACTTTTTACATTGGAACCCCTTTTTCCAGGAACTGCTGACATTGATCAAATGAGCAAAATCTTCACTACTCTAGGCAACTTGACTGAAGATTCGTGG
CCAGGTTGTTCCGAACTTCCTGATTTTCAAATTATATCATTCAACACAATAGAAAAGCCGATCGGTCTAGAAGCATGTCTTCCCAACTGTTCTCCTGATGAAATTTCTAT
TGTTAAAAGACTTCTTTGTTACAACCCGGCTAATCGAGCGACTGCTATGGAATTGTTACAAGATAAGTATTTCACTGAGGAGCCACTTCCCGTTCCCTTGTCTGAGCTAC
ATGTTCCTACGACAAAAACTGGACAGGATGAGGATTCTCCTGCAGGATGGTACGACTACAATGAGTTGGATTCTGATATGGATGAATTCGGCCCCATGAATGTTACCACC
ACTGCCACTGGTTACTCCATTCAATTTGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATCGTGCATAGGGATATGAAACCTAGCAATTTGTTGATCTCCGATGATGGCGTGCTCAAGCTTGCCGATTTTGGACAGGCAAGGATACTCATGGAGCCTGAATATGT
TGAATCGAATGAGATCTCTCAACCATGTGAGATGAACTCTTCAGATCAGGTGCCTGCTTCTCAGCCATCTACAATTTTTCCAGGAACAGAAAGCTCGGTTCGAGAAGGTA
ACAGAACTGAGGAACAAGAACCAATTAGCAAAGAAGAATATTTTAGAGTTTTAGACGAGTTGAAAGCAAAAAATTCAGCAAATGAATTTGACAAGGAAACATATACTTAT
GATGGAGATACATCTTGCTTAGCAACATGTACCACAAGTGACCTTGAAGATGATCCATTCAAAGGTTCATCATATTCTTACGAAATGGAAGGGGGAGTTCCAGCAGATGA
TGGACAAGGTTCTCTCACCTCATGTGTTGGTACTCGCTGGTTCAGGGCCCCTGAATTACTCTATGGCTCTACGAGCTACGGTTTGGAGATCGACTTATGGGCATTGGGCT
GCATTTTTGCTGAACTTTTTACATTGGAACCCCTTTTTCCAGGAACTGCTGACATTGATCAAATGAGCAAAATCTTCACTACTCTAGGCAACTTGACTGAAGATTCGTGG
CCAGGTTGTTCCGAACTTCCTGATTTTCAAATTATATCATTCAACACAATAGAAAAGCCGATCGGTCTAGAAGCATGTCTTCCCAACTGTTCTCCTGATGAAATTTCTAT
TGTTAAAAGACTTCTTTGTTACAACCCGGCTAATCGAGCGACTGCTATGGAATTGTTACAAGATAAGTATTTCACTGAGGAGCCACTTCCCGTTCCCTTGTCTGAGCTAC
ATGTTCCTACGACAAAAACTGGACAGGATGAGGATTCTCCTGCAGGATGGTACGACTACAATGAGTTGGATTCTGATATGGATGAATTCGGCCCCATGAATGTTACCACC
ACTGCCACTGGTTACTCCATTCAATTTGATTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MIVHRDMKPSNLLISDDGVLKLADFGQARILMEPEYVESNEISQPCEMNSSDQVPASQPSTIFPGTESSVREGNRTEEQEPISKEEYFRVLDELKAKNSANEFDKETYTY
DGDTSCLATCTTSDLEDDPFKGSSYSYEMEGGVPADDGQGSLTSCVGTRWFRAPELLYGSTSYGLEIDLWALGCIFAELFTLEPLFPGTADIDQMSKIFTTLGNLTEDSW
PGCSELPDFQIISFNTIEKPIGLEACLPNCSPDEISIVKRLLCYNPANRATAMELLQDKYFTEEPLPVPLSELHVPTTKTGQDEDSPAGWYDYNELDSDMDEFGPMNVTT
TATGYSIQFD