; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc01G03040 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc01G03040
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionProtein LURP-one-related 4
Genome locationClcChr01:2784759..2790251
RNA-Seq ExpressionClc01G03040
SyntenyClc01G03040
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007612 - LURP-one-related
IPR025659 - Tubby-like, C-terminal
IPR038595 - LURP-one-related superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0042775.1 protein LURP-one-related 4 [Cucumis melo var. makuwa]3.0e-9793.6Show/hide
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A0A0A0KNY3 Uncharacterized protein1.1e-10093.72Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q67XV7 Protein LURP-one-related 31.8e-2838.21Show/hide
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Q8LG32 Protein LURP-one-related 21.8e-2838.21Show/hide
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Q9SH27 Protein LURP-one-related 42.0e-4047.22Show/hide
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          S +      ++ RS  R  +  V  E N   E F +++ D K AF+II+I+G ++A+ K K S NGI LG+DVL+L    +++ SL++ LVTVYGLI+
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Q9ZVI6 Protein LURP-one-related 86.6e-1531.84Show/hide
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        +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G53870.1 Protein of unknown function (DUF567)1.3e-2938.21Show/hide
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AT1G53880.1 Eukaryotic translation initiation factor 2B (eIF-2B) family protein1.5e-2535.5Show/hide
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AT1G53890.1 Protein of unknown function (DUF567)1.3e-2938.21Show/hide
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AT1G63410.1 Protein of unknown function (DUF567)7.9e-4046.67Show/hide
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Query:  ERSKKPSFGVKKLYRSGSRKRNQSV-CEINVGFERFSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIERSLIMALVTVYGLIR
          S +      ++ RS  R  +  V  E N   E F +++ D K AF+II+I+G ++A+ K K S NGI LG+DVL+L    +++ SL++ LVT+ G + 
Subjt:  ERSKKPSFGVKKLYRSGSRKRNQSV-CEINVGFERFSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIERSLIMALVTVYGLIR

Query:  RQIKKKEKKE
        +Q++  E++E
Subjt:  RQIKKKEKKE

AT3G14260.1 Protein of unknown function (DUF567)1.1e-3644.71Show/hide
Query:  MAKVYPQTAPSPSSSPSSSSLCSETEIETFTIWMKSLIYHTNGCTVFDSNGDIVYRVDNYDRKCSREVFLMDLRGKVLFTIRKKKFSILGGWEGYR----
        M K++P    S +   +SS   + TE E+FTIWMKSL+++TNGCTVFDS G+I+YRVDNY+ K  REV+LMDL G VLFT+R++KF +   WEGYR    
Subjt:  MAKVYPQTAPSPSSSPSSSSLCSETEIETFTIWMKSLIYHTNGCTVFDSNGDIVYRVDNYDRKCSREVFLMDLRGKVLFTIRKKKFSILGGWEGYR----

Query:  WIESERSKKPSFGVKKLYRSGSRKRNQSVCEINVGFER------FSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIERSLIMA
         +ES  +K   F VK        K + S   +N G  R      + +V     LA  I +  G+++AE KRK S NG+ LGDDVL++   SQ++ S I+ 
Subjt:  WIESERSKKPSFGVKKLYRSGSRKRNQSVCEINVGFER------FSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIERSLIMA

Query:  LVTVYGLI
        LV  + LI
Subjt:  LVTVYGLI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCAAAGTGTACCCTCAAACAGCGCCGTCGCCGTCGTCATCTCCGTCGTCTTCATCGCTCTGTTCCGAAACCGAAATCGAAACCTTCACCATTTGGATGAAATCTCT
GATTTACCACACAAATGGCTGCACCGTCTTCGATTCCAATGGCGACATCGTCTACAGAGTCGATAACTACGACAGAAAATGCAGTCGCGAAGTATTTCTCATGGATCTCA
GAGGCAAAGTTCTCTTCACCATCAGGAAAAAGAAATTCTCGATTCTTGGAGGATGGGAAGGATACCGATGGATCGAATCGGAGAGAAGTAAGAAGCCTAGTTTTGGAGTG
AAGAAATTGTACAGATCAGGATCGAGGAAGAGAAATCAATCGGTATGTGAAATAAATGTGGGATTTGAGAGATTTTCATTGGTGAAAATGGATGGGAAACTGGCTTTCAG
AATAATCAACATCAATGGAGAAGTAGTTGCAGAGGCGAAGAGAAAAGTTTCATGGAACGGGATTTTGTTGGGAGATGATGTGTTGAGTTTAAATGCAAATTCTCAGATTG
AAAGATCTTTAATTATGGCTTTGGTCACTGTTTATGGCTTAATCCGTCGCCAAATTAAAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAGCTCTTCCCCCTCTTTCTCCCTCTCCGCCGC
CTCTCTCTCCTCCCTTCCTCCCGGTTTTTTTGTCGCCGCCGCCGCCCTCCGCTCCTTTCCATTCTCCCTTTGCCCCCGCCATCTCTCTCTCTCAATTGTCAATCGTTTCC
CGGAGGTTTCACGCCCAGAAACACAGGGTTTCTTGCTGTTTCTCGCGGTCTCCGACGGACTCTCGCTGCCTCTCGCTCTCTCGCTGCTTCTCACTCTCCCACGCTCACGC
TTTCCCGCTCTCACACTCAGAAACACGCTCTCCCTCGCCCAGGATTGCCCTCAAGCTCTCGGCCTCTCGCCCTCTCGCTGACTCTCGCTGCCTGTCGCTCTCCCGCGCTT
TCGCTTGACTCACGCTCTCCCTCGCCCGAAACCGCTGTCTCACTCGCTCGACTCTTGCTCTCGCTCAGAAGCGTGTTCTCGGCTGCGATTAACTGCTCGCCTGACCATCA
GTCGCCAGACCAGTGGTCGGCGATTGCTTTAGTCCGTAGGGTCGGAGGAAACTGCGAGTTTGGTCACGTTTGGGAATTTTGCAAGAGTTGTAGTGTGGTTAGCTTTATGG
ATCACTCCTCAGGAGGTTGTGTTCCTTCGAGATCACTAGAGGATGTGTTCTTTCGGGTTCACCAGAGGTTGTGTTCCTTCGGGTTCACCAGAGGTTGTGCTCCTTCGAGT
ACATTAGAGGTTTGTGTTCCTTCGGGATCACCAAAGGTAAGAGTTTCCTTCGGAGCTCTGGAGGTTTGTGGGCATCCATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAAAAATCCCTATAAATTCCCCTCTTTCTCATTTCTACCTTCTTCATCAAACTTTCAATTTTCAAACCTTATTTTCTCTCTTCCATCTCAATGGCCAAAGTGTACCC
TCAAACAGCGCCGTCGCCGTCGTCATCTCCGTCGTCTTCATCGCTCTGTTCCGAAACCGAAATCGAAACCTTCACCATTTGGATGAAATCTCTGATTTACCACACAAATG
GCTGCACCGTCTTCGATTCCAATGGCGACATCGTCTACAGAGTCGATAACTACGACAGAAAATGCAGTCGCGAAGTATTTCTCATGGATCTCAGAGGCAAAGTTCTCTTC
ACCATCAGGAAAAAGAAATTCTCGATTCTTGGAGGATGGGAAGGATACCGATGGATCGAATCGGAGAGAAGTAAGAAGCCTAGTTTTGGAGTGAAGAAATTGTACAGATC
AGGATCGAGGAAGAGAAATCAATCGGTATGTGAAATAAATGTGGGATTTGAGAGATTTTCATTGGTGAAAATGGATGGGAAACTGGCTTTCAGAATAATCAACATCAATG
GAGAAGTAGTTGCAGAGGCGAAGAGAAAAGTTTCATGGAACGGGATTTTGTTGGGAGATGATGTGTTGAGTTTAAATGCAAATTCTCAGATTGAAAGATCTTTAATTATG
GCTTTGGTCACTGTTTATGGCTTAATCCGTCGCCAAATTAAAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAGCTCTTCCCCCTCTTTCTCCCTCTCCGCCGCCTCTCTCTCCTCCCTTC
CTCCCGGTTTTTTTGTCGCCGCCGCCGCCCTCCGCTCCTTTCCATTCTCCCTTTGCCCCCGCCATCTCTCTCTCTCAATTGTCAATCGTTTCCCGGAGGTTTCACGCCCA
GAAACACAGGGTTTCTTGCTGTTTCTCGCGGTCTCCGACGGACTCTCGCTGCCTCTCGCTCTCTCGCTGCTTCTCACTCTCCCACGCTCACGCTTTCCCGCTCTCACACT
CAGAAACACGCTCTCCCTCGCCCAGGATTGCCCTCAAGCTCTCGGCCTCTCGCCCTCTCGCTGACTCTCGCTGCCTGTCGCTCTCCCGCGCTTTCGCTTGACTCACGCTC
TCCCTCGCCCGAAACCGCTGTCTCACTCGCTCGACTCTTGCTCTCGCTCAGAAGCGTGTTCTCGGCTGCGATTAACTGCTCGCCTGACCATCAGTCGCCAGACCAGTGGT
CGGCGATTGCTTTAGTCCGTAGGGTCGGAGGAAACTGCGAGTTTGGTCACGTTTGGGAATTTTGCAAGAGTTGTAGTGTGGTTAGCTTTATGGATCACTCCTCAGGAGGT
TGTGTTCCTTCGAGATCACTAGAGGATGTGTTCTTTCGGGTTCACCAGAGGTTGTGTTCCTTCGGGTTCACCAGAGGTTGTGCTCCTTCGAGTACATTAGAGGTTTGTGT
TCCTTCGGGATCACCAAAGGTAAGAGTTTCCTTCGGAGCTCTGGAGGTTTGTGGGCATCCATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKVYPQTAPSPSSSPSSSSLCSETEIETFTIWMKSLIYHTNGCTVFDSNGDIVYRVDNYDRKCSREVFLMDLRGKVLFTIRKKKFSILGGWEGYRWIESERSKKPSFGV
KKLYRSGSRKRNQSVCEINVGFERFSLVKMDGKLAFRIININGEVVAEAKRKVSWNGILLGDDVLSLNANSQIERSLIMALVTVYGLIRRQIKKKEKKEKLFPLFLPLRR
LSLLPSSRFFCRRRRPPLLSILPLPPPSLSLNCQSFPGGFTPRNTGFLAVSRGLRRTLAASRSLAASHSPTLTLSRSHTQKHALPRPGLPSSSRPLALSLTLAACRSPAL
SLDSRSPSPETAVSLARLLLSLRSVFSAAINCSPDHQSPDQWSAIALVRRVGGNCEFGHVWEFCKSCSVVSFMDHSSGGCVPSRSLEDVFFRVHQRLCSFGFTRGCAPSS
TLEVCVPSGSPKVRVSFGALEVCGHP