| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6579070.1 hypothetical protein SDJN03_23518, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 9.1e-98 | 81.97 | Show/hide |
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L + ++P + RRLSPFSA A+ P A AA LPV + A+MFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLRENLVSKLMKDVEGTCSGRHG
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FVVAITGIENIGKGLI DGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEILEA+VTMVNKMGFFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGD+PNYTTSDGSVKIQKDSEVR
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LKIIGTRVDATEIFCIGTIKDDFLGVINDP+AA
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| KAG7032688.1 hypothetical protein SDJN02_06738, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 2.5e-95 | 97.22 | Show/hide |
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FFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEIFCIGTIKDDFLGVINDP+AA
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| XP_004150740.1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 isoform X1 [Cucumis sativus] | 3.3e-95 | 100 | Show/hide |
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| XP_038906688.1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 [Benincasa hispida] | 7.2e-95 | 99.43 | Show/hide |
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| XP_038906991.1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7-like [Benincasa hispida] | 1.2e-94 | 98.86 | Show/hide |
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| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
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| A0A0A0KPS4 Uncharacterized protein | 1.6e-95 | 100 | Show/hide |
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| A0A2I4HHD1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 1.0e-94 | 98.3 | Show/hide |
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AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGD+PNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEIFCIGTIKDDFLGVINDP+AA
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| A0A6J1E6V3 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7-like | 7.8e-95 | 98.86 | Show/hide |
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MFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLRENLV+KLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGIENIGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEILEAVVTMVNKMGFFAE
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AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEIFCIGTIKDDFLGVINDP+AA
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|
| A0A6J1FGH6 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 isoform X1 | 6.0e-95 | 92.15 | Show/hide |
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A A+L ++ A+MFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLRENLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGIENIGKGLI DGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEIL
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EA+VTMVNKMGFFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGD+PNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEIFCIGTIKDDFLGVINDP+AA
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|
|
| A0A6J1JSG6 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7-like | 7.8e-95 | 98.86 | Show/hide |
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MFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLRENLV+KLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGIENIGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEILEAVVTMVNKMGFFAE
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AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEIFCIGTIKDDFLGVINDP+AA
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|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P38421 DNA-directed RNA polymerase II subunit 7 | 1.0e-91 | 92.61 | Show/hide |
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MFFHIVLERNMQLHPR FGRNL+ENLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGI+ IGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEILEAVVT+VNKMGFFAE
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AGPVQIFVS HLIPDDMEFQ+GD+PNYTTSDGSVKIQK+ EVRLKIIGTRVDAT IFC+GTIKDDFLGVINDP+AA
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|
|
| P46279 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 3.4e-95 | 97.13 | Show/hide |
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MFFHIVLERNMQLHPR+FGRNLR+NLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVA+TGIENIGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEILEAVVTMVNKMGFFAE
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AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGD+PNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEIFCIGTIKDDFLGVINDP+
Subjt: AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEIFCIGTIKDDFLGVINDPS
|
|
| P62487 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 7.1e-53 | 54.65 | Show/hide |
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MF+HI LE + LHPR+FG NL + KL +VEGTC+G++GFV+A+T I+NIG G+I+ G GFV +PVKY+ +VFRPFKGE+++AVVT VNK+G F E
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GP+ F+S H IP +MEF + + P Y T D + IQ+D E+RLKI+GTRVD +IF IG++ DD+LG+++
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|
|
| Q5E9B8 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 7.1e-53 | 54.65 | Show/hide |
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MF+HI LE + LHPR+FG NL + KL +VEGTC+G++GFV+A+T I+NIG G+I+ G GFV +PVKY+ +VFRPFKGE+++AVVT VNK+G F E
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GP+ F+S H IP +MEF + + P Y T D + IQ+D E+RLKI+GTRVD +IF IG++ DD+LG+++
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|
|
| Q7ZW41 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 | 7.1e-53 | 55.23 | Show/hide |
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MF+HI LE + LHPR+FG NL + KL +VEGTC+G++GFV+A+T I+NIG G+I+ G GFV +PVKY+ +VFRPFKGE+++AVVT VNK+G F E
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GP+ F+S H IP +MEF + + P Y T D V IQ+D E+RLKI+GTRVD +IF IG++ DD+LG+++
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|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G06790.1 RNA polymerase Rpb7 N-terminal domain-containing protein | 2.2e-04 | 29.89 | Show/hide |
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MF+ LE ++++ P L + + S L G V+I I+++ G + G G T+ V + VVFRPF GE++ A
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|
|
| AT1G06790.2 RNA polymerase Rpb7 N-terminal domain-containing protein | 2.2e-04 | 29.89 | Show/hide |
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MF+ LE ++++ P L + + S L G V+I I+++ G + G G T+ V + VVFRPF GE++ A
Subjt: MFFHIVLERNMQLHPRHFGRNLRENLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGIENIGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEILEA
|
|
| AT3G22900.1 RNA polymerase Rpb7-like, N-terminal domain | 5.1e-14 | 34.38 | Show/hide |
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G+++ T +ENIG+G I++ TG + FPV + + F+ FKGEI+ VV V+K G F ++GP +I +H+ EF G+ P + S +IQ + V
Subjt: GFVVAITGIENIGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEILEAVVTMVNKMGFFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEV
Query: RLKIIGT--RVDATEIFCIGTIKDDFLG
R ++ T R + + +I D LG
Subjt: RLKIIGT--RVDATEIFCIGTIKDDFLG
|
|
| AT4G14660.1 RNA polymerase Rpb7-like, N-terminal domain | 3.9e-14 | 32.58 | Show/hide |
Query: GFVVAITGIENIGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEILEAVVTMVNKMGFFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEV
G+ VA+T ++ IG+G IR+ TG V FPV + + F+ FKGEI+ VV V K G F GP++ ++ D ++ G+ P + S +IQ ++ V
Subjt: GFVVAITGIENIGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEILEAVVTMVNKMGFFAEAGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEV
Query: RLKIIGTR--VDATEIFCIGTIKDDFLGVIND
R+ +IG + E + +++ D+LG +++
Subjt: RLKIIGTR--VDATEIFCIGTIKDDFLGVIND
|
|
| AT5G59180.1 DNA-directed RNA polymerase II | 7.2e-93 | 92.61 | Show/hide |
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MFFHIVLERNMQLHPR FGRNL+ENLVSKLMKDVEGTCSGRHGFVVAITGI+ IGKGLIRDGTGFVTFPVKYQCVVFRPFKGEILEAVVT+VNKMGFFAE
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Query: AGPVQIFVSNHLIPDDMEFQSGDVPNYTTSDGSVKIQKDSEVRLKIIGTRVDATEIFCIGTIKDDFLGVINDPSAA
AGPVQIFVS HLIPDDMEFQ+GD+PNYTTSDGSVKIQK+ EVRLKIIGTRVDAT IFC+GTIKDDFLGVINDP+AA
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