CuGenDBv2

Gene ID	Clc01G10830
Organism	Citrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Description	pentatricopeptide repeat-containing protein At5g64320, mitochondrial
Genome location	ClcChr01:15485205..15485543
RNA-Seq Expression	Clc01G10830
Synteny	Clc01G10830
Gene Ontology terms	GO:0044237 - cellular metabolic process (biological process) GO:0005488 - binding (molecular function) GO:0016740 - transferase activity (molecular function)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6573536.1 Pentatricopeptide repeat-containing protein, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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XP_038894135.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At5g64320, mitochondrial [Benincasa hispida]

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A0A1S3CJN8 LOW QUALITY PROTEIN: pentatricopeptide repeat-containing protein At5g64320, mitochondrial-like

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A0A5A7SWK3 Pentatricopeptide repeat-containing protein

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A0A6J1CMC3 pentatricopeptide repeat-containing protein At5g64320, mitochondrial

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A0A6J1EBE2 pentatricopeptide repeat-containing protein At5g64320, mitochondrial

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A0A6J1HNL7 pentatricopeptide repeat-containing protein At5g64320, mitochondrial

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SwissProt top hits

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Q9FMF6 Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g64320, mitochondrial

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Arabidopsis top hits

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AT5G64320.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein

1.6e-10

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Sequences

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CDS sequence

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ATGTTTAGTTCTTTGGGAAACATTGTTAAACGGACCAAAAATCTTAGTTCATTGGAGCCTAAGATTGTTATTCATATTGAGAACTCTTGCAAAGCAAGCTTTTTAGCTGG
GAATATTGGAGATGGTAGTGGTCCAACCAAGATGAATGTTGAATCAGAGCTTGAAACTGAATGGGAGAGTTTACTTGAACCTTTTGATCTCACAAAACTTAGGAAGTCTC
GCATTTTAATTACCCCTGTTCAACTTTGTAAACTGCTTGAGCTTCCACTTGATGTTCCCACGTTGTTGGAAATATTTGAACGGGGTGGGTGGCCAGAAGGGCTATTGCCA
TACATTTGA

mRNA sequence

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Protein sequence

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MFSSLGNIVKRTKNLSSLEPKIVIHIENSCKASFLAGNIGDGSGPTKMNVESELETEWESLLEPFDLTKLRKSRILITPVQLCKLLELPLDVPTLLEIFERGGWPEGLLP
YI

Clc01G10830 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome