; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc01G12150 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc01G12150
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionProtein of unknown function, DUF584
Genome locationClcChr01:20816429..20821752
RNA-Seq ExpressionClc01G12150
SyntenyClc01G12150
Gene Ontology termsGO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007608 - Senescence regulator S40
IPR012337 - Ribonuclease H-like superfamily
IPR036397 - Ribonuclease H superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KGN64943.1 hypothetical protein Csa_022813 [Cucumis sativus]7.0e-11593.25Show/hide
Query:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDNELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFGIL
        MDLNLPSSRFRHR SPSSERFLASFPSPP R++NPSST ALDDD+ELNEDDVFWTGDFA+DS HHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHK FPLPETFGIL
Subjt:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDNELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFGIL

Query:  AALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKA-VQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEIVA
        AALPENEASS+LRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPIS+SLKYQSAPVNVPIMSKA VQR  E+DVDDVDE+DGEMLPPHEIVA
Subjt:  AALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKA-VQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEIVA

Query:  RSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
        RSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
Subjt:  RSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT

XP_008461249.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103499884 [Cucumis melo]2.9e-11392.83Show/hide
Query:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDNELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFGIL
        MDLNL SSRFRHR SPSSERFLASFPSPP RT+NPSST ALDDD+ELNEDDVFWTGDFA+DS HHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHK FPLPETFGIL
Subjt:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDNELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFGIL

Query:  AALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKA-VQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEIVA
        AALPENEASS+LRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPIS+SLKYQSAPVNVPIMSKA VQR  E+DVD VDE+DGEMLPPHEIVA
Subjt:  AALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKA-VQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEIVA

Query:  RSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
        RSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
Subjt:  RSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT

XP_022967102.1 uncharacterized protein LOC111466606 [Cucurbita maxima]8.2e-10889.54Show/hide
Query:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDN--ELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFG
        M+L+ PSSRFRHRKSP SERFL SF SP  R +NP+S NALDDDN  ELNEDDVFWTGDFAADSAHH+HSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHK FP  ETFG
Subjt:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDN--ELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFG

Query:  ILAALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSK-AVQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEI
        ILAALPENEASS+LRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPL+RLPL ISSSLKYQSAPVNVP+MSK AVQRHQEIDVDDVDE DGEMLPPHEI
Subjt:  ILAALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSK-AVQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEI

Query:  VARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
        VARSLAQSP+LSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
Subjt:  VARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT

XP_023522766.1 uncharacterized protein LOC111786770 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.3e-10890.38Show/hide
Query:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDN--ELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFG
        MDL  PSSRFRHRKSPSSERFL SF SP  R +NP+S NALDDDN  ELNEDDVFWTGDFAADS HH+HSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFP  ETFG
Subjt:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDN--ELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFG

Query:  ILAALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSK-AVQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEI
        ILAALPENEASS+LRNSS+FYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPL+RLPLPISSSLKYQSAPVNVP+MSK AVQRHQEIDVDDVDE DGEMLPPHEI
Subjt:  ILAALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSK-AVQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEI

Query:  VARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
        VARSLAQSP+LSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
Subjt:  VARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT

XP_038894579.1 uncharacterized protein LOC120083099 [Benincasa hispida]1.4e-11594.51Show/hide
Query:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDNELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFGIL
        MDLNLPS RFRHRKSPSSERFLASF SPP RTANPSSTN +DDD ELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHK FPLPETFGIL
Subjt:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDNELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFGIL

Query:  AALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKA-VQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEIVA
        AALPENEASS+LRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPL+RLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKA VQR QEIDVDDVDE+DGEMLPPHEIVA
Subjt:  AALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKA-VQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEIVA

Query:  RSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
        RSLAQSP+LSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
Subjt:  RSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LT40 Uncharacterized protein3.4e-11593.25Show/hide
Query:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDNELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFGIL
        MDLNLPSSRFRHR SPSSERFLASFPSPP R++NPSST ALDDD+ELNEDDVFWTGDFA+DS HHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHK FPLPETFGIL
Subjt:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDNELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFGIL

Query:  AALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKA-VQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEIVA
        AALPENEASS+LRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPIS+SLKYQSAPVNVPIMSKA VQR  E+DVDDVDE+DGEMLPPHEIVA
Subjt:  AALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKA-VQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEIVA

Query:  RSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
        RSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
Subjt:  RSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT

A0A1S4E4F1 uncharacterized protein LOC1034998841.4e-11392.83Show/hide
Query:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDNELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFGIL
        MDLNL SSRFRHR SPSSERFLASFPSPP RT+NPSST ALDDD+ELNEDDVFWTGDFA+DS HHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHK FPLPETFGIL
Subjt:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDNELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFGIL

Query:  AALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKA-VQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEIVA
        AALPENEASS+LRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPIS+SLKYQSAPVNVPIMSKA VQR  E+DVD VDE+DGEMLPPHEIVA
Subjt:  AALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKA-VQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEIVA

Query:  RSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
        RSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
Subjt:  RSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT

A0A5A7SY45 Senescence regulator1.4e-11392.83Show/hide
Query:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDNELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFGIL
        MDLNL SSRFRHR SPSSERFLASFPSPP RT+NPSST ALDDD+ELNEDDVFWTGDFA+DS HHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHK FPLPETFGIL
Subjt:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDNELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFGIL

Query:  AALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKA-VQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEIVA
        AALPENEASS+LRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPIS+SLKYQSAPVNVPIMSKA VQR  E+DVD VDE+DGEMLPPHEIVA
Subjt:  AALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKA-VQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEIVA

Query:  RSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
        RSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
Subjt:  RSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT

A0A6J1G2B0 uncharacterized protein LOC1114500335.2e-10889.17Show/hide
Query:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDD---NELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETF
        MDL  PSSRFRHRKSPSSERFL SF SP  R +NP+S NALD+D   +ELNEDDVFWTGDFAADSAHH+HSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHK FP  ETF
Subjt:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDD---NELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETF

Query:  GILAALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSK-AVQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHE
        GILAALPENEASS+LRNSS+FYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPL+RLPLPISSSLKYQSAPVNVP+MSK AVQRHQEIDVDDVDE DGEMLPPHE
Subjt:  GILAALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSK-AVQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHE

Query:  IVARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
        IVARSLAQSP+LSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
Subjt:  IVARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT

A0A6J1HPU4 uncharacterized protein LOC1114666064.0e-10889.54Show/hide
Query:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDN--ELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFG
        M+L+ PSSRFRHRKSP SERFL SF SP  R +NP+S NALDDDN  ELNEDDVFWTGDFAADSAHH+HSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHK FP  ETFG
Subjt:  MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDN--ELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFG

Query:  ILAALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSK-AVQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEI
        ILAALPENEASS+LRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPL+RLPL ISSSLKYQSAPVNVP+MSK AVQRHQEIDVDDVDE DGEMLPPHEI
Subjt:  ILAALPENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSK-AVQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEI

Query:  VARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
        VARSLAQSP+LSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
Subjt:  VARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q7LHG5 Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein9.1e-0930.89Show/hide
Query:  KFGTHLKYSSSSHPQTDGQTKVTSRTLGNLLRCLSGNQTCKWDIQLAQAEFVYNNMQNRSTKKCPFEVVYTHSPRLTFDLNDVPSNVDFSEEDELMIDRI
        + G     SS++HPQTDGQ++ T +TL  LLR         W + L Q EFVYN+   R+  K PFE+          DL  +P+      +DE+     
Subjt:  KFGTHLKYSSSSHPQTDGQTKVTSRTLGNLLRCLSGNQTCKWDIQLAQAEFVYNNMQNRSTKKCPFEVVYTHSPRLTFDLNDVPSNVDFSEEDELMIDRI

Query:  QRLHGEVLQYLESANAFYKKQVD
          +  E+ ++L++     K+Q++
Subjt:  QRLHGEVLQYLESANAFYKKQVD

Q99315 Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein4.1e-0930.89Show/hide
Query:  KFGTHLKYSSSSHPQTDGQTKVTSRTLGNLLRCLSGNQTCKWDIQLAQAEFVYNNMQNRSTKKCPFEVVYTHSPRLTFDLNDVPSNVDFSEEDELMIDRI
        + G     SS++HPQTDGQ++ T +TL  LLR  +      W + L Q EFVYN+   R+  K PFE+          DL  +P+      +DE+     
Subjt:  KFGTHLKYSSSSHPQTDGQTKVTSRTLGNLLRCLSGNQTCKWDIQLAQAEFVYNNMQNRSTKKCPFEVVYTHSPRLTFDLNDVPSNVDFSEEDELMIDRI

Query:  QRLHGEVLQYLESANAFYKKQVD
          +  E+ ++L++     K+Q++
Subjt:  QRLHGEVLQYLESANAFYKKQVD

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G11700.1 Protein of unknown function, DUF5845.9e-1146.99Show/hide
Query:  SAPVNVPIMSKAVQRHQEIDVDDVDEED----GEMLPPHEIVARSLAQSPMLS---CSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
        SAPVNVP  SK  + +    + + DEE+    G M+PPHE +A+S  +    S    SV EG GRTLKGR+LR+VR+A+W +T
Subjt:  SAPVNVPIMSKAVQRHQEIDVDDVDEED----GEMLPPHEIVARSLAQSPMLS---CSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT

AT3G15040.1 Protein of unknown function, DUF5843.4e-3549.17Show/hide
Query:  SPPARTANPSSTNALDD--DNELNEDDVFWTG-DFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFGILAALPENEASSTLRNSSHFYHK--
        +P    ++PSS   + D  D ELNEDD+F      A   A HS    S +   TP   +   +        E  GILAALPE+  SS+   S  F+HK  
Subjt:  SPPARTANPSSTNALDD--DNELNEDDVFWTG-DFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFGILAALPENEASSTLRNSSHFYHK--

Query:  --------ASVSSSSSS-------SPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPIS--SSLKY-QSAPVNVPIMSKA-VQRHQ------EIDVDDVDEEDGEMLPPHE
                ++ SSSSSS       S SS+R IPT PKPP +RLP   S     KY QSAPV VP++S A + RH+      ++  DD +EE+GEMLPPHE
Subjt:  --------ASVSSSSSS-------SPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPIS--SSLKY-QSAPVNVPIMSKA-VQRHQ------EIDVDDVDEEDGEMLPPHE

Query:  IVARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
        IVARSLAQS +LSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAV+RRT
Subjt:  IVARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT

AT4G04630.1 Protein of unknown function, DUF5845.7e-1441.33Show/hide
Query:  ILAALPENEASSTLRN--SSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSK----------AVQRHQEIDVDDVDE
        + + L E E SS       SHF    S SSSSSSSP + R    +             S +K  SAP+NVP  SK          +   H     DD ++
Subjt:  ILAALPENEASSTLRN--SSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSK----------AVQRHQEIDVDDVDE

Query:  EDGEMLPPHEIVARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
        +DG M+PPHE VAR LA++ + S S+ EG GRTLKGRDL +VRNAV  +T
Subjt:  EDGEMLPPHEIVARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT

AT4G21970.1 Protein of unknown function, DUF5843.1e-1238.73Show/hide
Query:  ENEASSTLRNSSHFYHKASVSSS----SSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKAVQRHQEIDVDDV------DEEDGEMLPP
        E E  S LR S     +  +S S    S+SS SS+R IP   +         +S   K  SAP+N+P  SK     ++     +      D+++G M+PP
Subjt:  ENEASSTLRNSSHFYHKASVSSS----SSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKAVQRHQEIDVDDV------DEEDGEMLPP

Query:  HEIVARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT
        HE+VA+ LA++ + S S+ EG GRTLKGRDL + RNAV  RT
Subjt:  HEIVARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRRT

AT5G60680.1 Protein of unknown function, DUF5847.2e-0936.88Show/hide
Query:  ENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKAVQ------RHQEI----DVDDVDEEDGEMLPP
        E++  + + + S  + +   SS  S   SS+R             P   SS+    S PVNVP  SK ++      R + I    D DD +E+ G+ LPP
Subjt:  ENEASSTLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKAVQ------RHQEI----DVDDVDEEDGEMLPP

Query:  HEIVARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRR
        HE     LA++ M S SV EG GRTLKGRDL +VRNA++ +
Subjt:  HEIVARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTLKGRDLRQVRNAVWRR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACCTCAACCTTCCTTCTTCCCGCTTCCGCCACCGCAAATCTCCTTCCTCCGAACGCTTTCTCGCTTCCTTCCCTTCTCCCCCTGCTCGCACTGCAAACCCTAGCTC
CACCAACGCCCTCGACGACGATAACGAGCTCAACGAAGACGACGTCTTCTGGACCGGCGATTTTGCTGCCGATTCCGCCCACCATAGCCACTCCACTCCCTCCTCCTCCT
CCTCTTCGACTCCTCGTCACCATATTCATCACCTCCAGCATCACAAGGCTTTTCCCTTGCCGGAGACCTTCGGAATCCTCGCTGCTCTCCCCGAGAACGAGGCCTCCTCC
ACCCTTCGCAACTCTTCACACTTCTATCACAAGGCCTCCGTTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCCTCTTCTCGGATGATTCCGACCATCCCTAAACCTCCTCTCGA
CCGATTGCCTCTTCCCATTTCCTCCTCCTTGAAGTACCAGTCCGCCCCTGTGAATGTGCCTATAATGTCGAAGGCAGTTCAGAGACACCAGGAGATTGACGTGGATGATG
TTGATGAAGAAGATGGGGAGATGTTGCCGCCGCATGAGATTGTCGCAAGAAGTCTGGCTCAGTCGCCGATGTTGTCTTGCTCGGTGCTCGAGGGTGCAGGAAGGACGTTA
AAGGGGAGGGATCTTCGACAAGTTCGCAACGCGGTTTGGAGACGAACAGACATAGACAACTTTCATTCTCCATCGAACAGTTACTTCAGTGTTTCAGATATTACTTCACA
TATTTTCAATCTTCTCCACAGCATTCAAAAGGAGGAGAATCATTTTGCATCTTCCCCAAGTCTCAGGTGCTTTTCTTTAACTATTAATGCCCTATCCATCCCAAATCTTA
GAGAGAAACAAGGCTGTGGTTATACATCCATTTTTTTTTTCATTGGAGAAATTTTGGCTGCACACATTCTTCCAGACAGAAAAGTGTATGGAAAATTTGGTACTCATTTG
AAGTATAGCTCTAGTAGCCATCCTCAAACAGATGGCCAGACCAAGGTCACTAGTAGGACCCTTGGGAACCTTCTTCGCTGCTTAAGTGGGAATCAAACATGCAAATGGGA
TATCCAACTTGCTCAAGCAGAATTTGTATACAATAATATGCAAAATAGATCTACAAAGAAGTGTCCCTTTGAGGTTGTGTATACTCATTCTCCTAGATTAACGTTTGATC
TCAATGATGTCCCTTCTAATGTTGATTTCAGTGAAGAGGATGAGCTGATGATTGATCGGATTCAGAGGCTGCACGGTGAAGTTTTACAATATCTGGAATCTGCCAATGCT
TTTTACAAGAAGCAAGTTGATGTCGATGTTGAGTGGCCATTTTTCAATTGGGAGTTCTTGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACCTCAACCTTCCTTCTTCCCGCTTCCGCCACCGCAAATCTCCTTCCTCCGAACGCTTTCTCGCTTCCTTCCCTTCTCCCCCTGCTCGCACTGCAAACCCTAGCTC
CACCAACGCCCTCGACGACGATAACGAGCTCAACGAAGACGACGTCTTCTGGACCGGCGATTTTGCTGCCGATTCCGCCCACCATAGCCACTCCACTCCCTCCTCCTCCT
CCTCTTCGACTCCTCGTCACCATATTCATCACCTCCAGCATCACAAGGCTTTTCCCTTGCCGGAGACCTTCGGAATCCTCGCTGCTCTCCCCGAGAACGAGGCCTCCTCC
ACCCTTCGCAACTCTTCACACTTCTATCACAAGGCCTCCGTTTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCCCCTCCTCTTCTCGGATGATTCCGACCATCCCTAAACCTCCTCTCGA
CCGATTGCCTCTTCCCATTTCCTCCTCCTTGAAGTACCAGTCCGCCCCTGTGAATGTGCCTATAATGTCGAAGGCAGTTCAGAGACACCAGGAGATTGACGTGGATGATG
TTGATGAAGAAGATGGGGAGATGTTGCCGCCGCATGAGATTGTCGCAAGAAGTCTGGCTCAGTCGCCGATGTTGTCTTGCTCGGTGCTCGAGGGTGCAGGAAGGACGTTA
AAGGGGAGGGATCTTCGACAAGTTCGCAACGCGGTTTGGAGACGAACAGACATAGACAACTTTCATTCTCCATCGAACAGTTACTTCAGTGTTTCAGATATTACTTCACA
TATTTTCAATCTTCTCCACAGCATTCAAAAGGAGGAGAATCATTTTGCATCTTCCCCAAGTCTCAGGTGCTTTTCTTTAACTATTAATGCCCTATCCATCCCAAATCTTA
GAGAGAAACAAGGCTGTGGTTATACATCCATTTTTTTTTTCATTGGAGAAATTTTGGCTGCACACATTCTTCCAGACAGAAAAGTGTATGGAAAATTTGGTACTCATTTG
AAGTATAGCTCTAGTAGCCATCCTCAAACAGATGGCCAGACCAAGGTCACTAGTAGGACCCTTGGGAACCTTCTTCGCTGCTTAAGTGGGAATCAAACATGCAAATGGGA
TATCCAACTTGCTCAAGCAGAATTTGTATACAATAATATGCAAAATAGATCTACAAAGAAGTGTCCCTTTGAGGTTGTGTATACTCATTCTCCTAGATTAACGTTTGATC
TCAATGATGTCCCTTCTAATGTTGATTTCAGTGAAGAGGATGAGCTGATGATTGATCGGATTCAGAGGCTGCACGGTGAAGTTTTACAATATCTGGAATCTGCCAATGCT
TTTTACAAGAAGCAAGTTGATGTCGATGTTGAGTGGCCATTTTTCAATTGGGAGTTCTTGTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDLNLPSSRFRHRKSPSSERFLASFPSPPARTANPSSTNALDDDNELNEDDVFWTGDFAADSAHHSHSTPSSSSSSTPRHHIHHLQHHKAFPLPETFGILAALPENEASS
TLRNSSHFYHKASVSSSSSSSPSSSRMIPTIPKPPLDRLPLPISSSLKYQSAPVNVPIMSKAVQRHQEIDVDDVDEEDGEMLPPHEIVARSLAQSPMLSCSVLEGAGRTL
KGRDLRQVRNAVWRRTDIDNFHSPSNSYFSVSDITSHIFNLLHSIQKEENHFASSPSLRCFSLTINALSIPNLREKQGCGYTSIFFFIGEILAAHILPDRKVYGKFGTHL
KYSSSSHPQTDGQTKVTSRTLGNLLRCLSGNQTCKWDIQLAQAEFVYNNMQNRSTKKCPFEVVYTHSPRLTFDLNDVPSNVDFSEEDELMIDRIQRLHGEVLQYLESANA
FYKKQVDVDVEWPFFNWEFL