; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc01G25985 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc01G25985
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionGermin-like protein
Genome locationClcChr01:36125352..36126650
RNA-Seq ExpressionClc01G25985
SyntenyClc01G25985
Gene Ontology termsGO:0048046 - apoplast (cellular component)
GO:0030145 - manganese ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006045 - Cupin 1
IPR011051 - RmlC-like cupin domain superfamily
IPR014710 - RmlC-like jelly roll fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KIB9 Germin-like protein3.5e-0681.08Show/hide
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A0A0A0KKX1 Germin-like protein3.5e-0678.38Show/hide
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A0A1S3AZN5 Germin-like protein3.5e-0678.38Show/hide
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A0A5A7UBA7 Germin-like protein3.5e-0678.38Show/hide
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A0A5A7UDA2 Germin-like protein4.6e-0681.08Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2QXJ0 Putative germin-like protein 12-43.4e-0656.86Show/hide
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Q2QXJ2 Germin-like protein 12-24.4e-0656.86Show/hide
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Q6K5P8 Putative germin-like protein 2-32.0e-0664.86Show/hide
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Q6K5P9 Putative germin-like protein 2-22.0e-0667.57Show/hide
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Q6K5Q0 Putative germin-like protein 2-11.5e-0664.86Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G04200.1 RmlC-like cupins superfamily protein4.3e-0455.26Show/hide
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AT4G14630.1 germin-like protein 98.6e-0553.06Show/hide
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AT5G38960.1 RmlC-like cupins superfamily protein2.9e-0562.16Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TAACTCTAGTGACCCTGGTGCAAATCCCAGGGCTCAACACTCTTGGCATCTCCTTGGGCACCCACTTGCCACCGAAATCTTGACAGTCCTTGAAGGAAAGCTCTTGGCTG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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