; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc02G02570 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc02G02570
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionglycine-rich protein-like
Genome locationClcChr02:2329675..2330735
RNA-Seq ExpressionClc02G02570
SyntenyClc02G02570
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR010800 - Glycine rich protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6572253.1 Glycine-rich protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.9e-4485.6Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGG-----
        MSSKAF+FLGLL A VLL+SSEVAARDLAETS+KK+NEAT ETNGVEDAKYGGYD GYGGR  YG GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYG RGGYGG     
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGG-----

Query:  -GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
         GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  -GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

KAG7011884.1 Glycine-rich protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.3e-4385.48Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGG-----
        MSSKAF+FLGLL A VLL+SSEVAARDLAETS+KK+NEAT ETNGVEDAKYGGYD GYGGR  YG GGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYG RGGYGG     
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGG-----

Query:  -GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
         GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK
Subjt:  -GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAK

XP_022952570.1 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X1 [Cucurbita moschata]1.7e-4783.33Show/hide
Query:  MQNFLIPSPKINLLLKQKKMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGY
        MQ  LIPS K +L L   KMSSKAF+FLGLL A VLL+SSEVAARDLAETS+KK+NEAT ETNGVEDAKYGGYD GYGGR  YG GGYGGRGGYGGRGGY
Subjt:  MQNFLIPSPKINLLLKQKKMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGY

Query:  GGRGGYGDRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        GGRGGYG  GGYG GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GGRGGYGDRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

XP_022969295.1 glycine-rich protein-like [Cucurbita maxima]6.4e-4782.73Show/hide
Query:  MQNFLIPSPKINLLLKQKKMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGG
        MQ  LIPS K +L+L   KMSSKAF+FLGLL AF+LL+SSEVAARDLAETS+ K+ EATVETNGVEDAKYGGYD GYGGR  Y G GGYGGRGGYGGRGG
Subjt:  MQNFLIPSPKINLLLKQKKMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGG

Query:  YGGRGGYGDRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        YGGRGGYG RGGYG GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  YGGRGGYGDRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

XP_023554637.1 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-4581.29Show/hide
Query:  MQNFLIPSPKINLLLKQKKMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGG
        MQ  LIPS K +L L   KMSSKAF+FLG L A +L++SSEVAARDLAETS+KK+NEATVETNGVEDAKYGGYD GYGGR  Y G GGYGGRGGYGGRGG
Subjt:  MQNFLIPSPKINLLLKQKKMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGG

Query:  YGGRGGYGDRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        YGGRGGYG  GGYG GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  YGGRGGYGDRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K6L7 Uncharacterized protein1.1e-3979.43Show/hide
Query:  MQNFLIPSPKINLLLKQKKMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKY--GGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRG
        MQ FLIP  +   L     MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK DNEATVETNGVEDAKY  GGYDRGYGG    G+G  GGRGGY GRG
Subjt:  MQNFLIPSPKINLLLKQKKMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKY--GGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRG

Query:  GYGGRGGY-GDRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
         YGGRGGY G RGGYG GCRYGRCG++CCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GYGGRGGY-GDRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0A5D3DE59 Cold and drought-regulated protein CORA-like2.8e-4090.91Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKY-GGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY-GDRGGYGGGCR
        MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSK DNEATVETNGVEDAKY GGYDRGYGG   YG GGY GRGGY GRGGYGGRGGY G RGGYG GCR
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKY-GGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY-GDRGGYGGGCR

Query:  YGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        YGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  YGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0A6J1GKL6 glycine-rich protein-like isoform X23.0e-4278.26Show/hide
Query:  MQNFLIPSPKINLLLKQKKMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGY
        MQ  LIPS K +L L   KMSSKAF+FLGLL A VLL+SSEVAARDLAETS+KK+NEAT ETNGVEDAKYGGYD           GGYGGRGGYGGRGGY
Subjt:  MQNFLIPSPKINLLLKQKKMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGY

Query:  GGRGGYGDRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        GGRGGYG  GGYG GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GGRGGYGDRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0A6J1GM55 cold and drought-regulated protein CORA-like isoform X18.2e-4883.33Show/hide
Query:  MQNFLIPSPKINLLLKQKKMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGY
        MQ  LIPS K +L L   KMSSKAF+FLGLL A VLL+SSEVAARDLAETS+KK+NEAT ETNGVEDAKYGGYD GYGGR  YG GGYGGRGGYGGRGGY
Subjt:  MQNFLIPSPKINLLLKQKKMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGY

Query:  GGRGGYGDRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        GGRGGYG  GGYG GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  GGRGGYGDRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

A0A6J1HZJ5 glycine-rich protein-like3.1e-4782.73Show/hide
Query:  MQNFLIPSPKINLLLKQKKMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGG
        MQ  LIPS K +L+L   KMSSKAF+FLGLL AF+LL+SSEVAARDLAETS+ K+ EATVETNGVEDAKYGGYD GYGGR  Y G GGYGGRGGYGGRGG
Subjt:  MQNFLIPSPKINLLLKQKKMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGG

Query:  YGGRGGYGDRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
        YGGRGGYG RGGYG GCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP
Subjt:  YGGRGGYGDRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22612 Dormancy-associated protein 23.1e-0451.35Show/hide
Query:  SSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRG----YGGRDRYGHGGYGGRGGY-GGRGGYGGRGGYGDRGG---Y
        S KA + LG LLA VLL+SSEV+AR+L E   +K +E       V DAKYGGY RG     GG    G GGY G GGY  G GGY G GGY + GG    
Subjt:  SSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRG----YGGRDRYGHGGYGGRGGY-GGRGGYGGRGGYGDRGG---Y

Query:  GGGCRYGRCGY
        GGG   G  GY
Subjt:  GGGCRYGRCGY

P11898 Glycine-rich protein HC14.9e-0545.31Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKD---NEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRD-----RYGHGGYGGRGGY-GGRGGY-------GGR
        M SK F+ LGL +AF +L+SSEVAAR+LAET++K +   N       G      GGY  G GG +       G GGY   GGY  G GGY        G 
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKD---NEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRD-----RYGHGGYGGRGGY-GGRGGY-------GGR

Query:  GGYGDRGGY--GGGCRYGRCGYRCCSYA
        GGY + GGY  GGG  Y  C  RCCS A
Subjt:  GGYGDRGGY--GGGCRYGRCGYRCCSYA

P23137 Glycine-rich protein4.0e-0747.97Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSS--KKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCR
        M SKAF+FLGL LAF  L+SSEV A +LAETS+  K D E  V+ +G                 R G+   GG G YGG  G GG GGY  R     GCR
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSS--KKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYGHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCR

Query:  YGRC--GY----RCCSYAGEVVE
        YG C  GY    RCCSYAGE ++
Subjt:  YGRC--GY----RCCSYAGEVVE

P37703 Glycine-rich protein DC9.11.8e-0444.53Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKD---NEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRD-----RYGHGGYGGRGGY-GGRGGY-------GGR
        M SK F+ LGL +AF +L+SSEVAAR+LAET++K +   N       G      GGY  G GG +       G GGY   GGY  G GGY        G 
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKD---NEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRD-----RYGHGGYGGRGGY-GGRGGY-------GGR

Query:  GGYGDRGGY--GGGCRYGRCGYRCCSYA
        GGY + GG+  GGG  Y  C  RCCS A
Subjt:  GGYGDRGGY--GGGCRYGRCGYRCCSYA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G05530.1 Glycine-rich protein family2.9e-0545.97Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY--GDRGGYGGGC
        M+SKA V  GL    VLL+ +EVAA              TV++   E  +   Y+ G+GG   Y G GGY G GG+ G GGY G GGY  G  GG  G C
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRY-GHGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGY--GDRGGYGGGC

Query:  RYGRC--GY----RCCSYAGEVVE
        RYG C  GY    RCCSYAGE V+
Subjt:  RYGRC--GY----RCCSYAGEVVE

AT2G05540.1 Glycine-rich protein family8.8e-1049.25Show/hide
Query:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGY-DRGYGGRDRYGHGGYGGR--GGYGGR--------GGYGGR-GGYG
        M+SKA +FL L++  VLL++SEV ARDLAE S+++ N    E    E  ++GG+   GYGG   +  GGYGG   GGYG R        GGYG R GGYG
Subjt:  MSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGY-DRGYGGRDRYGHGGYGGR--GGYGGR--------GGYGGR-GGYG

Query:  DRGGYGGGCRYGRC--GY-----RCCSYAGEVVE
        +RG  GG CRYG C  GY     RCC+YAG+ V+
Subjt:  DRGGYGGGCRYGRC--GY-----RCCSYAGEVVE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTCAGTCTTTAATTGCCATTGTCTCATTTCATATCTCTCTTGCTCTTTATGCACCTATAAATACATCTACGAGAATGCAAAATTTTCTCATCCCATCTCCAAAAAT
CAATCTCTTACTTAAACAAAAAAAAATGAGTTCCAAAGCTTTTGTTTTCCTCGGTCTTCTTCTCGCCTTTGTTCTCCTCCTCTCTTCGGAGGTGGCCGCGAGAGACCTCG
CAGAGACTTCCTCCAAGAAGGATAACGAGGCTACTGTGGAGACCAATGGTGTAGAGGATGCCAAGTATGGAGGGTACGATAGAGGCTATGGTGGTCGTGATCGTTACGGC
CATGGTGGCTATGGCGGTCGTGGTGGCTACGGAGGCCGTGGTGGCTACGGAGGCCGTGGTGGTTACGGTGACCGTGGTGGCTACGGAGGAGGTTGCCGGTATGGTCGATG
CGGGTACAGGTGCTGCAGCTACGCTGGTGAAGTGGTAGAGGGCGCAAAACCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTCCTTCTCATCTCAAAATACTTCTCAATTATCAGTTCATCAACACCCAACTAAATTATGGGTCAGTCTTTAATTGCCATTGTCTCATTTCATATCTCTCTTGCTCTTT
ATGCACCTATAAATACATCTACGAGAATGCAAAATTTTCTCATCCCATCTCCAAAAATCAATCTCTTACTTAAACAAAAAAAAATGAGTTCCAAAGCTTTTGTTTTCCTC
GGTCTTCTTCTCGCCTTTGTTCTCCTCCTCTCTTCGGAGGTGGCCGCGAGAGACCTCGCAGAGACTTCCTCCAAGAAGGATAACGAGGCTACTGTGGAGACCAATGGTGT
AGAGGATGCCAAGTATGGAGGGTACGATAGAGGCTATGGTGGTCGTGATCGTTACGGCCATGGTGGCTATGGCGGTCGTGGTGGCTACGGAGGCCGTGGTGGCTACGGAG
GCCGTGGTGGTTACGGTGACCGTGGTGGCTACGGAGGAGGTTGCCGGTATGGTCGATGCGGGTACAGGTGCTGCAGCTACGCTGGTGAAGTGGTAGAGGGCGCAAAACCC
TAAGAAAACGTGTGGAATGGGCTGAAATAATAAAATAGTTTAAAGTTAAATGTTTGAACTGTGAAGCTTAAGAAATAAATGCATGGGGGAATGGAGTGGCTAGCTTCTAG
TTTTTCTTTTTCCCTATGTTTGGTTTTAGTATGTTGCTACAGATTTGCTTTTGCAAATTTTGATATTTTCACTTTTGTGTGGAATCCTACTTCCTATCTCCATAATTTGA
GTATAGTCTAGTACTTAATGTATATGCACTTTTTTTCGAAATTTGAAATTTCATCTCTATTAATCATCTTTAGTTGAAAATTCACTATTGTCACTAATATAATACTAATA
ATAATTTGGTTGTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGQSLIAIVSFHISLALYAPINTSTRMQNFLIPSPKINLLLKQKKMSSKAFVFLGLLLAFVLLLSSEVAARDLAETSSKKDNEATVETNGVEDAKYGGYDRGYGGRDRYG
HGGYGGRGGYGGRGGYGGRGGYGDRGGYGGGCRYGRCGYRCCSYAGEVVEGAKP