; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc02G02610 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc02G02610
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptionfasciclin-like arabinogalactan protein 7
Genome locationClcChr02:2359425..2361659
RNA-Seq ExpressionClc02G02610
SyntenyClc02G02610
Gene Ontology termsGO:0009834 - plant-type secondary cell wall biogenesis (biological process)
GO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR000782 - FAS1 domain
IPR036378 - FAS1 domain superfamily
IPR045003 - Fasciclin-like arabinogalactan protein, group A


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0059150.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-12794.12Show/hide
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KAG6589121.1 Fasciclin-like arabinogalactan protein 7, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.1e-12790.91Show/hide
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XP_008455511.1 PREDICTED: fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Cucumis melo]1.7e-12894.9Show/hide
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XP_038888065.1 fasciclin-like arabinogalactan protein 7 [Benincasa hispida]3.8e-12894.51Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0K597 FAS1 domain-containing protein8.2e-12994.9Show/hide
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A0A1S3C2C3 fasciclin-like arabinogalactan protein 78.2e-12994.9Show/hide
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A0A5D3BU74 Fasciclin-like arabinogalactan protein 75.3e-12894.12Show/hide
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A0A6J1C1K1 fasciclin-like arabinogalactan protein 71.9e-12592.16Show/hide
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A0A6J1I0D1 fasciclin-like arabinogalactan protein 71.9e-12592.55Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8LEE9 Fasciclin-like arabinogalactan protein 123.6e-3343.46Show/hide
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Q8LEJ6 Fasciclin-like arabinogalactan protein 112.4e-2434.84Show/hide
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        NP+ T AG    G++ LN T     ++I +G  +  V++SV+S   +AVYQVD++LLP A+FG+ V P PAP     ++  +      S G     S   
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          +      +GI I  V AI+
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Q9SIL7 Fasciclin-like arabinogalactan protein 68.1e-2537.09Show/hide
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        + K+A SS  + S
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Q9SJ81 Fasciclin-like arabinogalactan protein 71.0e-8064.71Show/hide
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         PAPAPAP ++  +D+PSV  S+G ++P S  K S         +L  I + ISG
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Q9ZWA8 Fasciclin-like arabinogalactan protein 95.3e-2435.97Show/hide
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        T+   LL+ +   A   TA P      PAP PA   +NLT +L   G F TF+  L  T+V      Q N++ EG+T+F P D AF   K  +L+ L+ D
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G04780.1 FASCICLIN-like arabinoogalactan 77.4e-8264.71Show/hide
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AT2G04780.2 FASCICLIN-like arabinoogalactan 77.4e-8264.71Show/hide
Query:  KMEFSMIFTVCSALLLLSSSSANARTASP--PLLSPTPAPAPAPDFVNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIDTFQNQANNTEEGVTIFVPKDGAFSAQK
        KM+ S+   V + ++     SA+A+TASP  P+L PTPAPAPAP+ VNLT+LL+VAGPFHTFL YL ST VI+TFQNQANNTEEG+TIFVPKD AF AQK
Subjt:  KMEFSMIFTVCSALLLLSSSSANARTASP--PLLSPTPAPAPAPDFVNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIDTFQNQANNTEEGVTIFVPKDGAFSAQK

Query:  KPSLSNLTEDQLKSLILFHGLPHYYSLAEFRNLSLQNPIPTFAGGQYSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKILLPEAIFGTDVPP
         P LSNLT+DQLK L+LFH LPHYYSL+EF+NLS   P+ TFAGGQYSL FTDVSGT+ I S WT TKVSSSV S+DPVAVYQV+++LLPEAIFGTDVPP
Subjt:  KPSLSNLTEDQLKSLILFHGLPHYYSLAEFRNLSLQNPIPTFAGGQYSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKILLPEAIFGTDVPP

Query:  TPAPAPAPDIAPAADAPSVV-SDGKAAPSSEPKPSSSHRIINWGILIHIVLAISG
         PAPAPAP ++  +D+PSV  S+G ++P S  K S         +L  I + ISG
Subjt:  TPAPAPAPDIAPAADAPSVV-SDGKAAPSSEPKPSSSHRIINWGILIHIVLAISG

AT2G20520.1 FASCICLIN-like arabinogalactan 65.8e-2637.09Show/hide
Query:  PPLLSPTPAPAPAPDF--VNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIDTFQNQANNTEEGVTIFVPKDGAFSAQKKPSLSNLTEDQLKSLILFHGLPHYYSLA
        P + S   APAP  +   +NLT +L     F T +  L +T+V      Q N++++G+TIF P D AF+  K  +L++LT  Q   L+L+H +P YYSL+
Subjt:  PPLLSPTPAPAPAPDF--VNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIDTFQNQANNTEEGVTIFVPKDGAFSAQKKPSLSNLTEDQLKSLILFHGLPHYYSLA

Query:  EFRNLSLQNPIPTFA----GGQYSLNFTD--VSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKILLPEAIFGTDVPPTPAPAPAPDIAPA-ADAPSVVS
        +   L   NP+ T A    GG + LNFT    S  +++ +G   T++++++    P+AVY VD +LLPE +FGT   PT APAP    + + AD+P+   
Subjt:  EFRNLSLQNPIPTFA----GGQYSLNFTD--VSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKILLPEAIFGTDVPPTPAPAPAPDIAPA-ADAPSVVS

Query:  DGKAAPSSEPKPS
        + K+A SS  + S
Subjt:  DGKAAPSSEPKPS

AT5G03170.1 FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 111.7e-2534.84Show/hide
Query:  APAPAPDF-VNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIDTFQNQAN-NTEEGVTIFVPKDGAFSAQKKPSLSNLTEDQLKSLILFHGLPHYYSLAEFRNLSLQ
        APAP P    N+T +L  AG F  F+  L+ST+  D    Q N ++  G+T+F P D AF++ K  +L++L++ Q   L+ FH LP   ++ +F+ +S  
Subjt:  APAPAPDF-VNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIDTFQNQAN-NTEEGVTIFVPKDGAFSAQKKPSLSNLTEDQLKSLILFHGLPHYYSLAEFRNLSLQ

Query:  NPIPTFAG----GQYSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKILLPEAIFGTDVPPTPAPAPAPDIAPAADAPSVVSDGKAAPSSEPK
        NP+ T AG    G++ LN T     ++I +G  +  V++SV+S   +AVYQVD++LLP A+FG+ V P PAP     ++  +      S G     S   
Subjt:  NPIPTFAG----GQYSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKILLPEAIFGTDVPPTPAPAPAPDIAPAADAPSVVSDGKAAPSSEPK

Query:  PSSSHRIINWGILIHIVLAIS
          +      +GI I  V AI+
Subjt:  PSSSHRIINWGILIHIVLAIS

AT5G60490.1 FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 122.6e-3443.46Show/hide
Query:  MEFSMIFTVCSALLLLSSSSANARTASPPLLS-PTPAPAPAPDF-VNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIDTFQNQANNTEEGVTIFVPKDGAFSAQKK
        ME S+I  + + LLLL        T +P +LS P+PA APAP    N+T +L  AG F  F+  L+ST V +    Q NN++ G+TIF P D +F+  K 
Subjt:  MEFSMIFTVCSALLLLSSSSANARTASPPLLS-PTPAPAPAPDF-VNLTDLLTVAGPFHTFLSYLQSTKVIDTFQNQANNTEEGVTIFVPKDGAFSAQKK

Query:  PSLSNLTEDQLKSLILFHGLPHYYSLAEFRNLSLQNPIPTFAG----GQYSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKILLPEAIFGTD
         +L++LT++Q   LI FH +P Y S + F+ +S  NP+ T AG    G + LN T    T++I SG TNT VS +V+S   +AVYQVDK+LLP+ +F   
Subjt:  PSLSNLTEDQLKSLILFHGLPHYYSLAEFRNLSLQNPIPTFAG----GQYSLNFTDVSGTIHIGSGWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKILLPEAIFGTD

Query:  VPPTPAPAPAPDIA
         P  PAPAPAP ++
Subjt:  VPPTPAPAPAPDIA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACTCAATTACTATCTCTTCTTCACCAGCTCTTACAAACCCACCCCCCCCATTTGCTTTTCTCCTCCATTTCTTTAAATACTTGCTTCAATTTTCAATCTTTATTTGT
ATTACTCATCTCCTTCCCCATTATTTCTCTGTCAGACAGACCTTCTCTCTTGCCTGGCTGGAAGTTGTGGAAAATGGAATTTTCCATGATTTTCACTGTTTGTAGTGCAT
TGTTGCTTCTGAGCTCTTCATCTGCCAATGCCCGAACAGCCAGCCCCCCTTTACTTAGCCCGACCCCGGCACCGGCTCCAGCCCCAGATTTTGTCAACCTCACAGATCTG
CTCACTGTAGCTGGTCCATTTCACACCTTCCTCAGCTACCTACAGTCCACCAAAGTTATTGACACCTTCCAAAACCAAGCTAATAACACAGAGGAAGGAGTGACTATCTT
TGTCCCCAAAGACGGCGCTTTCTCGGCGCAAAAGAAACCGTCTCTCTCGAATCTCACCGAAGATCAGCTCAAGTCTCTTATCCTATTTCATGGCTTGCCACATTACTATT
CCCTTGCTGAATTTAGGAACCTCAGCCTTCAGAATCCGATCCCAACGTTCGCTGGTGGGCAGTACAGTTTGAACTTCACAGACGTTTCGGGAACTATCCACATTGGCTCT
GGCTGGACTAACACAAAAGTGAGTAGCAGTGTGCATTCAAGTGATCCTGTTGCAGTTTACCAAGTTGACAAAATTCTGCTGCCTGAGGCAATCTTTGGAACCGATGTCCC
ACCAACCCCAGCCCCAGCACCCGCGCCTGATATCGCTCCTGCTGCAGACGCTCCATCGGTTGTTAGTGATGGAAAGGCTGCTCCATCTTCAGAACCAAAGCCATCATCTT
CCCATAGGATTATCAACTGGGGAATTTTGATTCACATTGTTTTGGCAATTTCAGGTGGATTTTTGTTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGTAAGAGAAGAAGAAGAAAAGATGGAAAAAATGGAGTGATGGGGTAGAGTGCAAGGTTGGGTTTAAGAAGAAGAAAATAGAAAAAGAAAAAGGTAAAAAAGAATTAGTT
GAAATGTGATTAAGAAAGGGTACCCTACATGTCCCACTTCTTAAGAAAAAGCCTTCCCAATAAAGTATGGTTTTTTTATGTCTAAGGAAGATCCCATCTCTTAGTTTATG
ACTCAATTACTATCTCTTCTTCACCAGCTCTTACAAACCCACCCCCCCCATTTGCTTTTCTCCTCCATTTCTTTAAATACTTGCTTCAATTTTCAATCTTTATTTGTATT
ACTCATCTCCTTCCCCATTATTTCTCTGTCAGACAGACCTTCTCTCTTGCCTGGCTGGAAGTTGTGGAAAATGGAATTTTCCATGATTTTCACTGTTTGTAGTGCATTGT
TGCTTCTGAGCTCTTCATCTGCCAATGCCCGAACAGCCAGCCCCCCTTTACTTAGCCCGACCCCGGCACCGGCTCCAGCCCCAGATTTTGTCAACCTCACAGATCTGCTC
ACTGTAGCTGGTCCATTTCACACCTTCCTCAGCTACCTACAGTCCACCAAAGTTATTGACACCTTCCAAAACCAAGCTAATAACACAGAGGAAGGAGTGACTATCTTTGT
CCCCAAAGACGGCGCTTTCTCGGCGCAAAAGAAACCGTCTCTCTCGAATCTCACCGAAGATCAGCTCAAGTCTCTTATCCTATTTCATGGCTTGCCACATTACTATTCCC
TTGCTGAATTTAGGAACCTCAGCCTTCAGAATCCGATCCCAACGTTCGCTGGTGGGCAGTACAGTTTGAACTTCACAGACGTTTCGGGAACTATCCACATTGGCTCTGGC
TGGACTAACACAAAAGTGAGTAGCAGTGTGCATTCAAGTGATCCTGTTGCAGTTTACCAAGTTGACAAAATTCTGCTGCCTGAGGCAATCTTTGGAACCGATGTCCCACC
AACCCCAGCCCCAGCACCCGCGCCTGATATCGCTCCTGCTGCAGACGCTCCATCGGTTGTTAGTGATGGAAAGGCTGCTCCATCTTCAGAACCAAAGCCATCATCTTCCC
ATAGGATTATCAACTGGGGAATTTTGATTCACATTGTTTTGGCAATTTCAGGTGGATTTTTGTTTTGATTGTGATCAGAAATCCTACCATCCATTTATTACATTTAAGAA
AACTATATTGGTATTTTGTTCTGTTATTGATGTGAAGCTCCATTTTTTTGTGAACATATATGTTGTTGGATTTGTGCAAGAGAATTTCTAATGTTTGGTCTATAAATTAT
GATGGGGAAGGAATTTTGTTTTAAAGTTCAATGTTTCAATATATCAACTATGTGAGTTTTCTTGACAACCAAATATTGTAGGGTCAGGCAGGTTGTCTTGTCAAATTAGT
CGAGGTGCACATAAGCTGGTCCAGACACGCACGAATACATATATAAAAAAAAAGTCATAATATGAAGCAATACCACTCATCGTCCTCTAACATATCAATTCTTGTATTTG
ATTGAAAAACAAAGTTTCTTTTTCTTCCTTTGGTATGTAGATTCTCCCTACTAATCTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MTQLLSLLHQLLQTHPPHLLFSSISLNTCFNFQSLFVLLISFPIISLSDRPSLLPGWKLWKMEFSMIFTVCSALLLLSSSSANARTASPPLLSPTPAPAPAPDFVNLTDL
LTVAGPFHTFLSYLQSTKVIDTFQNQANNTEEGVTIFVPKDGAFSAQKKPSLSNLTEDQLKSLILFHGLPHYYSLAEFRNLSLQNPIPTFAGGQYSLNFTDVSGTIHIGS
GWTNTKVSSSVHSSDPVAVYQVDKILLPEAIFGTDVPPTPAPAPAPDIAPAADAPSVVSDGKAAPSSEPKPSSSHRIINWGILIHIVLAISGGFLF