| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6572189.1 Protein THYLAKOID ASSEMBLY 8-like, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 5.6e-111 | 85.14 | Show/hide |
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MSF+AT PS TILSPP+ L GGK S LRLG EGYRRVTMRGGSENRKPLQKGRNLSIEAIQAVQSLKRAKKDLQQLDRV+D+K+RRLLKFDMMAVLR
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ELLRQNECSLALKVFEDVR E WYKPQVSLYADI++VLASNGLFE+V+IIHSY KAE DLAPEI+GFN LLKALV +NLG+LAMESYYLMKEVGCEPDK
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SFRI+IKGLEST E+VDLRTVK+DAQ+LYGESLEFLEEE+E AT ISMH
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|
| TYK08129.1 pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa] | 3.0e-112 | 87.15 | Show/hide |
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MSF+ T PSPTILSPP LPS K CL+LG AEGY RVTMRGGSENRKPLQKGRNLSIEAIQAVQSLKR KKDLQQLDRV+D+K+RRLLKFDM+AVLR
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ELLRQNECSLALKVFEDVRNEHWYKPQVSLYADIITVLASNGLFERV+II SY+KAE DLAPEIDGFNALLK LV HNLG+LAMESYYLMKEVGCEP+KA
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SFRI+IKGLE GEAVDLRTVKQDAQKLYGESLEFLEE EE ATAIS+H
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| XP_008451190.1 PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At3g46870-like [Cucumis melo] | 1.0e-112 | 87.55 | Show/hide |
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MSF+ T PSPTILSPP LPS K CL+LG AEGY RVTMRGGSENRKPLQKGRNLSIEAIQAVQSLKR KKDLQQLDRV+D+K+RRLLKFDM+AVLR
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ELLRQNECSLALKVFEDVRNEHWYKPQVSLYADIITVLASNGLFERV+II SY+KAE DLAPEIDGFNALLKALV HNLG+LAMESYYLMKEVGCEP+KA
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SFRI+IKGLE GEAVDLRTVKQDAQKLYGESLEFLEE EE ATAIS+H
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| XP_031744771.1 protein THYLAKOID ASSEMBLY 8-like, chloroplastic [Cucumis sativus] | 1.7e-112 | 87.5 | Show/hide |
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MSF+ATP SPTI SP PS G A CL+LG AEGY RVTMRGGSENRKPLQKGRNLSIEAIQAVQSLKR KKDLQQLDRV+D+K+RRLLKFDM+AVLR
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ELLRQNECSLALKVFEDVR EHWYKPQVSLYADIITVLASNGLFERV+II SY+KAEADLAPEIDGFNALLKALV HNLGELAMESYYLMK+VGCEPDKA
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SFRI+IKGLES GEAVDLRTVKQDAQ+LYGESLEFLEEEEE ATA S+
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| XP_038888189.1 protein THYLAKOID ASSEMBLY 8, chloroplastic-like [Benincasa hispida] | 3.1e-117 | 89.56 | Show/hide |
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MSF+ PPSPTILSP + L S GG+ASCL LG AEGYR+VTMRGGSENRKPLQKGRNLSIEAIQAVQSLKR KKDLQQLDRV+D+K+RRLLKFDMMAVLR
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SFRI+IKGLES GEAVDLRTVKQDAQKLYGESLEFLEEEEE A AIS H
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|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0K6A9 Uncharacterized protein | 8.5e-113 | 87.5 | Show/hide |
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MSF+ATP SPTI SP PS G A CL+LG AEGY RVTMRGGSENRKPLQKGRNLSIEAIQAVQSLKR KKDLQQLDRV+D+K+RRLLKFDM+AVLR
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SFRI+IKGLES GEAVDLRTVKQDAQ+LYGESLEFLEEEEE ATA S+
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|
| A0A1S3BRZ8 pentatricopeptide repeat-containing protein At3g46870-like | 5.0e-113 | 87.55 | Show/hide |
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MSF+ T PSPTILSPP LPS K CL+LG AEGY RVTMRGGSENRKPLQKGRNLSIEAIQAVQSLKR KKDLQQLDRV+D+K+RRLLKFDM+AVLR
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SFRI+IKGLE GEAVDLRTVKQDAQKLYGESLEFLEE EE ATAIS+H
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| A0A5A7UZI6 Pentatricopeptide repeat-containing protein | 5.0e-113 | 87.55 | Show/hide |
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SFRI+IKGLE GEAVDLRTVKQDAQKLYGESLEFLEE EE ATAIS+H
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|
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| A0A5D3CCT4 Pentatricopeptide repeat-containing protein | 1.4e-112 | 87.15 | Show/hide |
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SFRI+IKGLE GEAVDLRTVKQDAQKLYGESLEFLEE EE ATAIS+H
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|
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| A0A6J1HX85 protein THYLAKOID ASSEMBLY 8-like, chloroplastic | 3.6e-111 | 85.54 | Show/hide |
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MSF+AT PS TILSPP+ L GGK S LRLG EGYRRVTMRGGSENRKPLQKGRNLSIEAIQAVQSLKRAKKDLQQLDRV+D+K+RRLLKFDMMAVLR
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ELLRQNECSLALKVFEDVR E WYKPQVSLYADI++VLASNGLFE+V+IIHSYLKAE DLAPEI+GFN LLKALV +NLGELAMESYYLMKEVGCEPDKA
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Query: SFRILIKGLESTGEAVDLRTVKQDAQKLYGESLEFLEEEEETATAISMH
SFRI+IKGLEST E+VDLR VK+DAQ+LYGESLEFLEEE+E AT IS H
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|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| O82178 Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g35130 | 1.9e-08 | 29.41 | Show/hide |
Query: LALKVFEDVRNEHWYKPQVSLYADIITVLASNGLFERVEIIHSYLKAEADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVGCEPDKASFRILIKGL
++ K++ ++R+ H KP + Y ++ A GL E+ E I L+ E L P++ +NAL+++ A E + LM+ +GCEPD+AS+ I++
Subjt: LALKVFEDVRNEHWYKPQVSLYADIITVLASNGLFERVEIIHSYLKAEADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVGCEPDKASFRILIKGL
Query: ESTGEAVDLRTVKQDAQKL
G D V ++ ++L
Subjt: ESTGEAVDLRTVKQDAQKL
|
|
| Q1PFH7 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62350 | 3.5e-15 | 33.14 | Show/hide |
Query: LSIEAIQAVQSLKRAKKDLQQLDRVHDAKLRRLLKFDMMAVLRELLRQNECSLALKVFEDVRNEHWYKPQVSLYADIITVLASNGLFERVEIIHSYLKAE
+S E + A + LKR + +LDR + + RLLK D+++VL E RQN+ L +K++E VR E WY+P + Y D++ +LA N + + + LK E
Subjt: LSIEAIQAVQSLKRAKKDLQQLDRVHDAKLRRLLKFDMMAVLRELLRQNECSLALKVFEDVRNEHWYKPQVSLYADIITVLASNGLFERVEIIHSYLKAE
Query: ADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVGCEPDKASFRILIKGLESTGEAVDLRTVKQDAQKLY
L + F L++ + + L AM Y M+E P FR+++KGL E + VK D +L+
Subjt: ADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVGCEPDKASFRILIKGLESTGEAVDLRTVKQDAQKLY
|
|
| Q9LVW6 Protein THYLAKOID ASSEMBLY 8, chloroplastic | 3.8e-17 | 38.98 | Show/hide |
Query: GGSENRKPLQKGRNLSIEAIQAVQSLKRAKKDLQQLDRVHDAKLRRLLKFDMMAVLRELLRQNECSLALKVFEDVRNEHWYKP-QVSLYADIITVLASNG
G +NR PL KGR LS EAIQ++QSLKRA + L + LRRL+K D+++VLRELLRQ+ C+LA+ V +R E Y P + LYADI+ L N
Subjt: GGSENRKPLQKGRNLSIEAIQAVQSLKRAKKDLQQLDRVHDAKLRRLLKFDMMAVLRELLRQNECSLALKVFEDVRNEHWYKP-QVSLYADIITVLASNG
Query: LFERVEIIHSYLKAEADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVG-----CEPDKASFRILIKGLESTGE
F+ ++ + + D + L++A+V E + Y LM+E G E D+ +L KGL GE
Subjt: LFERVEIIHSYLKAEADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVG-----CEPDKASFRILIKGLESTGE
|
|
| Q9SCP4 Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g53170 | 2.1e-07 | 28.32 | Show/hide |
Query: MMAVLRELLRQNECSLALKVFEDVRNEHWYKPQVSLYADIITVLASNGLFERVEIIHSYLKAEADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVG
++ L E +++N ALK+F +R +HWY+P+ Y + VL + ++ ++ + +E L P ID + +L+ L + A + MK V
Subjt: MMAVLRELLRQNECSLALKVFEDVRNEHWYKPQVSLYADIITVLASNGLFERVEIIHSYLKAEADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVG
Query: -CEPDKASFRILI
C+PD +F +LI
Subjt: -CEPDKASFRILI
|
|
| Q9STF9 Protein THYLAKOID ASSEMBLY 8-like, chloroplastic | 3.4e-18 | 32.64 | Show/hide |
Query: RKPLQKGRNL-SIEAIQAVQSLKRAKKDLQQLDRVHDAKLRRLLKFDMMAVLRELLRQNECSLALKVFEDVRNEHWYKPQVSLYADIITVLASNGLFERV
R PL +G+ L EA+ + LKR K+D ++LD+ + RLLK DM+AV+ EL RQ E +LA+K+FE ++ + WY+P V +Y D+I LA + +
Subjt: RKPLQKGRNL-SIEAIQAVQSLKRAKKDLQQLDRVHDAKLRRLLKFDMMAVLRELLRQNECSLALKVFEDVRNEHWYKPQVSLYADIITVLASNGLFERV
Query: EIIHSYLKAEADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVGCEPDKASFRILIKGLESTGEAVDLRTVKQDAQKLYGESLEFLEEEE
+ +K E +L P+ + +++ + AM Y M + P++ FR+L+KGL + VK+D ++L+ E + EE
Subjt: EIIHSYLKAEADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVGCEPDKASFRILIKGLESTGEAVDLRTVKQDAQKLYGESLEFLEEEE
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G62350.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | 2.5e-16 | 33.14 | Show/hide |
Query: LSIEAIQAVQSLKRAKKDLQQLDRVHDAKLRRLLKFDMMAVLRELLRQNECSLALKVFEDVRNEHWYKPQVSLYADIITVLASNGLFERVEIIHSYLKAE
+S E + A + LKR + +LDR + + RLLK D+++VL E RQN+ L +K++E VR E WY+P + Y D++ +LA N + + + LK E
Subjt: LSIEAIQAVQSLKRAKKDLQQLDRVHDAKLRRLLKFDMMAVLRELLRQNECSLALKVFEDVRNEHWYKPQVSLYADIITVLASNGLFERVEIIHSYLKAE
Query: ADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVGCEPDKASFRILIKGLESTGEAVDLRTVKQDAQKLY
L + F L++ + + L AM Y M+E P FR+++KGL E + VK D +L+
Subjt: ADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVGCEPDKASFRILIKGLESTGEAVDLRTVKQDAQKLY
|
|
| AT2G35130.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein | 1.3e-09 | 29.41 | Show/hide |
Query: LALKVFEDVRNEHWYKPQVSLYADIITVLASNGLFERVEIIHSYLKAEADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVGCEPDKASFRILIKGL
++ K++ ++R+ H KP + Y ++ A GL E+ E I L+ E L P++ +NAL+++ A E + LM+ +GCEPD+AS+ I++
Subjt: LALKVFEDVRNEHWYKPQVSLYADIITVLASNGLFERVEIIHSYLKAEADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVGCEPDKASFRILIKGL
Query: ESTGEAVDLRTVKQDAQKL
G D V ++ ++L
Subjt: ESTGEAVDLRTVKQDAQKL
|
|
| AT3G27750.1 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown | 2.7e-18 | 38.98 | Show/hide |
Query: GGSENRKPLQKGRNLSIEAIQAVQSLKRAKKDLQQLDRVHDAKLRRLLKFDMMAVLRELLRQNECSLALKVFEDVRNEHWYKP-QVSLYADIITVLASNG
G +NR PL KGR LS EAIQ++QSLKRA + L + LRRL+K D+++VLRELLRQ+ C+LA+ V +R E Y P + LYADI+ L N
Subjt: GGSENRKPLQKGRNLSIEAIQAVQSLKRAKKDLQQLDRVHDAKLRRLLKFDMMAVLRELLRQNECSLALKVFEDVRNEHWYKP-QVSLYADIITVLASNG
Query: LFERVEIIHSYLKAEADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVG-----CEPDKASFRILIKGLESTGE
F+ ++ + + D + L++A+V E + Y LM+E G E D+ +L KGL GE
Subjt: LFERVEIIHSYLKAEADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVG-----CEPDKASFRILIKGLESTGE
|
|
| AT3G46870.1 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein | 2.4e-19 | 32.64 | Show/hide |
Query: RKPLQKGRNL-SIEAIQAVQSLKRAKKDLQQLDRVHDAKLRRLLKFDMMAVLRELLRQNECSLALKVFEDVRNEHWYKPQVSLYADIITVLASNGLFERV
R PL +G+ L EA+ + LKR K+D ++LD+ + RLLK DM+AV+ EL RQ E +LA+K+FE ++ + WY+P V +Y D+I LA + +
Subjt: RKPLQKGRNL-SIEAIQAVQSLKRAKKDLQQLDRVHDAKLRRLLKFDMMAVLRELLRQNECSLALKVFEDVRNEHWYKPQVSLYADIITVLASNGLFERV
Query: EIIHSYLKAEADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVGCEPDKASFRILIKGLESTGEAVDLRTVKQDAQKLYGESLEFLEEEE
+ +K E +L P+ + +++ + AM Y M + P++ FR+L+KGL + VK+D ++L+ E + EE
Subjt: EIIHSYLKAEADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVGCEPDKASFRILIKGLESTGEAVDLRTVKQDAQKLYGESLEFLEEEE
|
|
| AT5G09320.1 Vacuolar sorting protein 9 (VPS9) domain | 6.3e-60 | 55.8 | Show/hide |
Query: VTMRGGSENRKPLQKGRNLSIEAIQAVQSLKRAKKDLQQ---------------LDRVHDAKLRRLLKFDMMAVLRELLRQNECSLALKVFEDVRNEHWY
+ MR S+NRKPLQ+GR LSIEAIQAVQ+LKRA L LDRV +K RRLLKFDM+AVLRELLRQNECSLALKVFE++R E+WY
Subjt: VTMRGGSENRKPLQKGRNLSIEAIQAVQSLKRAKKDLQQ---------------LDRVHDAKLRRLLKFDMMAVLRELLRQNECSLALKVFEDVRNEHWY
Query: KPQVSLYADIITVLASNGLFERVEIIHSYLKAEADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVGCEPDKASFRILIKGLESTGEAVDLRTVKQD
KPQV +Y D+ITV+A N L E V ++S +K+E L EI+ FN LL L+ H L +L M+ Y M+ +G EPD+ASFR+L+ GLES GE V+QD
Subjt: KPQVSLYADIITVLASNGLFERVEIIHSYLKAEADLAPEIDGFNALLKALVCHNLGELAMESYYLMKEVGCEPDKASFRILIKGLESTGEAVDLRTVKQD
Query: AQKLYGESLEFLEEEEETATAISM
A + YGESLEF+EE+EE ++ S+
Subjt: AQKLYGESLEFLEEEEETATAISM
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