CuGenDBv2

Gene ID	Clc02G04590
Organism	Citrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Description	Nodulin-like domain-containing protein
Genome location	ClcChr02:3997504..4002137
RNA-Seq Expression	Clc02G04590
Synteny	Clc02G04590
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	IPR010658 - Nodulin-like IPR036259 - MFS transporter superfamily

Homology

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KAA0049742.1 protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like [Cucumis melo var. makuwa]

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XP_011658596.1 protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4 isoform X1 [Cucumis sativus]

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XP_022928343.1 protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like [Cucurbita moschata]

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XP_038887463.1 protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like isoform X1 [Benincasa hispida]

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A0A0A0K0K5 Nodulin-like domain-containing protein

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A0A1S3BI29 protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like

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A0A5A7U1S8 Protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like

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A0A6J1ENR3 protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like

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A0A6J1JP36 protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like

1.5e-140

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SwissProt top hits

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F4I9E1 Protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4

9.7e-33

30.26

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Query:  GTVSGILKGYIALSTAIFTDLCTALFSDNPSSFLALLSLTPFAVCLTAVLFLREIPC-----SADNETEDSRYFWVLNAVSVAVAVILLAFDSIPNPTSS
             +   +  +S A+++    A+   + + +L L SL P  V   A+  +   P        D+   DS  F +LN ++V  +  LL    + + ++S
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Query:  VSRIFSMVLLILLASPLVIPLHSFVK-----------NRGRSGEV---AEALLADESAVEG---------AEEGKPV-IGEDHTIVEAMKTVEFWILFGS
         +R+  +  ++LL  PL  PL  + +           N   SG V    + L   +++V           A+EG  V +G++H+    +  +EFW+ + +
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Query:  FLCGVGTGLAVMNNMGQIGLALGYDEVSIFISLMSIWGFFGRILSGS
        + CG   GL   NN+GQI  +LG +  ++ +++ S + FFGR+LS +
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Arabidopsis top hits

e value

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Alignment

AT2G16660.1 Major facilitator superfamily protein

9.1e-119

66.67

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        MNL+QL+LNNLSVAKD+GKAFG+LAGLASDR  T ++LLIG  EGL+GYG QWLVVS+ I+P+PYWQMCIFLCMGGNSTTWMNT VLVTC+RNFRRNRG 
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Query:  VSGILKGYIALSTAIFTDLCTALFSDNPSSFLALLSLTPFAVCLTAVLFLREIP--CSADNETEDSRYFWVLNAVSVAVAVILLAFDSIPNPTSSVSRIF
        VSGILKGY+ LSTAIFTDLCTALFS++P+SFL LL++ PFAVCLTAV FLREIP   SA  E E++RYF + N V+V VAV L ++D I   T   S  F
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Query:  SMVLLILLASPLVIPLHSFVK--NRGR----SGEVAEALLADE-----------SAVEGAEE----GKPVIGEDHTIVEAMKTVEFWILFGSFLCGVGTG
        + +LL LLASP+ IP HSF+K  N G      G + E LL  E           +AV   EE     KPV+GEDHTI+EA+ TV+FW+LF SFLCGVGTG
Subjt:  SMVLLILLASPLVIPLHSFVK--NRGR----SGEVAEALLADE-----------SAVEGAEE----GKPVIGEDHTIVEAMKTVEFWILFGSFLCGVGTG

Query:  LAVMNNMGQIGLALGYDEVSIFISLMSIWGFFGRILSGS
        LAVMNNMGQIGLALGY  VSIF+S+ SIWGFFGRILSG+
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AT3G01930.2 Major facilitator superfamily protein

4.2e-47

31.73

Show/hide

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        +N +Q QL+ L VAKDLG + G LAG  S+       LL+GS++ L+GYG  WL+V+ +   LP W MCI + +G N  T+ NT  LV+ ++NF ++RG 
Subjt:  MNLSQLQLNNLSVAKDLGKAFGLLAGLASDRFSTSLLLLIGSIEGLIGYGAQWLVVSQKIKPLPYWQMCIFLCMGGNSTTWMNTGVLVTCLRNFRRNRGT

Query:  VSGILKGYIALSTAIFTDLCTALFSDNPSSFLALLSLTPFAVCLTAVLFLREIPCSADNETEDSRYFWVLNAVSVAVAVILLA---FDSIPNPTSSVSRI
        V GILKG+  L  AI + + T + S + +S + ++++ P  V +  + F+R +       + D+  F V+ AV + +A  L+A    +   + + S+   
Subjt:  VSGILKGYIALSTAIFTDLCTALFSDNPSSFLALLSLTPFAVCLTAVLFLREIPCSADNETEDSRYFWVLNAVSVAVAVILLA---FDSIPNPTSSVSRI

Query:  FSMVLLILLASPLVIPLHS--FVKNRGRSGEVAEALLAD---------------------------------------------------ESAVEGAEEG
        F++VL  +L  P+ IP+ +  F  +      + E LL D                                                   ++A EGA   
Subjt:  FSMVLLILLASPLVIPLHS--FVKNRGRSGEVAEALLAD---------------------------------------------------ESAVEGAEEG

Query:  K----PVIGEDHTIVEAMKTVEFWILFGSFLCGVGTGLAVMNNMGQIGLALGYDEVSIFISLMSIWGFFGRILSG
        K    P  GED T+ +A+   +FW++F S L G G+GL V++N+GQ+  +LGYD   +F+S++SIW F GRI  G
Subjt:  K----PVIGEDHTIVEAMKTVEFWILFGSFLCGVGTGLAVMNNMGQIGLALGYDEVSIFISLMSIWGFFGRILSG

AT4G34950.1 Major facilitator superfamily protein

7.2e-116

61.45

Show/hide

Query:  MNLSQLQLNNLSVAKDLGKAFGLLAGLASDRFSTSLLLLIGSIEGLIGYGAQWLVVSQKIKPLPYWQMCIFLCMGGNSTTWMNTGVLVTCLRNFRRNRGT
        MNL+QL+LN+LSVAKD+GKAFG+LAGLASDR ST ++LLIGS EGL+GYG QWLVVS+ I+P+PYWQMC+FLCMGGNSTTWMNT VLVTC+RNFRRNRG 
Subjt:  MNLSQLQLNNLSVAKDLGKAFGLLAGLASDRFSTSLLLLIGSIEGLIGYGAQWLVVSQKIKPLPYWQMCIFLCMGGNSTTWMNTGVLVTCLRNFRRNRGT

Query:  VSGILKGYIALSTAIFTDLCTALFSDNPSSFLALLSLTPFAVCLTAVLFLREIPCSAD--NETEDSRYFWVLNAVSVAVAVILLAFDSIPNPTSSVSRIF
        VSGILKGY+ LSTAIFTDLC ALFS +P+SFL LLS+ PFAVCLTAV FLREIP S     + E+S+YF V N V+V VAV L ++D I   T + S  F
Subjt:  VSGILKGYIALSTAIFTDLCTALFSDNPSSFLALLSLTPFAVCLTAVLFLREIPCSAD--NETEDSRYFWVLNAVSVAVAVILLAFDSIPNPTSSVSRIF

Query:  SMVLLILLASPLVIPLHSFVKNRGR-----SGEVAEALLADESAVE------GA-----------------------------EEGKPVIGEDHTIVEAM
        + +LLILLASP+ +P H+F++++        G + E LL   S +E      GA                             E+ +PV+GE+HTI+EAM
Subjt:  SMVLLILLASPLVIPLHSFVKNRGR-----SGEVAEALLADESAVE------GA-----------------------------EEGKPVIGEDHTIVEAM

Query:  KTVEFWILFGSFLCGVGTGLAVMNNMGQIGLALGYDEVSIFISLMSIWGFFGRILSGS
         TV+FW+LF SFLCGVGTGLAVMNNMGQIGLALGY +VSIF+S+ SIWGFFGRILSG+
Subjt:  KTVEFWILFGSFLCGVGTGLAVMNNMGQIGLALGYDEVSIFISLMSIWGFFGRILSGS

AT5G14120.1 Major facilitator superfamily protein

4.2e-47

30.54

Show/hide

Query:  MNLSQLQLNNLSVAKDLGKAFGLLAGLASDRFSTSLLLLIGSIEGLIGYGAQWLVVSQKIKPLPYWQMCIFLCMGGNSTTWMNTGVLVTCLRNFRRNRGT
        +N +Q +L+ L VAKDLG + G +AG  S+       LL+G+++ LIGYG  WL+V+ +   LP W MC+ + +G N  T+ NTG LV+ ++NF ++RG 
Subjt:  MNLSQLQLNNLSVAKDLGKAFGLLAGLASDRFSTSLLLLIGSIEGLIGYGAQWLVVSQKIKPLPYWQMCIFLCMGGNSTTWMNTGVLVTCLRNFRRNRGT

Query:  VSGILKGYIALSTAIFTDLCTALFSDNPSSFLALLSLTPFAVCLTAVLFLREIPCSADNETEDSRYFWVLNAVSVAVAVILLAFDSIPN---PTSSVSRI
        V GILKG+  L  AI + + T + S NP+S + ++++TP  V +  + F+R +         D   F  +  V + +A  L++   I +    + +V  +
Subjt:  VSGILKGYIALSTAIFTDLCTALFSDNPSSFLALLSLTPFAVCLTAVLFLREIPCSADNETEDSRYFWVLNAVSVAVAVILLAFDSIPN---PTSSVSRI

Query:  FSMVLLILLASPLVIPLHS--FVKNRGRSGEVAEALL--------------------------------------------------ADESAVEGAEEGK
        F++VL ++L  P+++P+ +  F +       + E L+                                                  A E AV       
Subjt:  FSMVLLILLASPLVIPLHS--FVKNRGRSGEVAEALL--------------------------------------------------ADESAVEGAEEGK

Query:  PVIGEDHTIVEAMKTVEFWILFGSFLCGVGTGLAVMNNMGQIGLALGYDEVSIFISLMSIWGFFGRILSG
        P  GED T+ +A+   +FW++F S L G G+GL V++N+GQ+  +LGYD   + +S++SIW F GRI  G
Subjt:  PVIGEDHTIVEAMKTVEFWILFGSFLCGVGTGLAVMNNMGQIGLALGYDEVSIFISLMSIWGFFGRILSG

AT5G50630.1 Major facilitator superfamily protein

7.4e-44

32.93

Show/hide

Query:  MNLSQLQLNNLSVAKDLGKAFGLLAGLASDRFSTSLLLLIGSIEGLIGYGAQWLVVSQKIKPLPYWQMCIFLCMGGNSTTWMNTGVLVTCLRNFRRNRGT
        +  +Q Q+  L VAK+LG A G ++G  S+   + ++LL+G+ + L GYG  WLVV+ ++  LP W + + + +G N  T+ NT  LV+C+ NF  +RG 
Subjt:  MNLSQLQLNNLSVAKDLGKAFGLLAGLASDRFSTSLLLLIGSIEGLIGYGAQWLVVSQKIKPLPYWQMCIFLCMGGNSTTWMNTGVLVTCLRNFRRNRGT

Query:  VSGILKGYIALSTAIFTDLCTALFSDNPSSFLALLSLTPFAVCLTAVLFLR--EIPCSADNETEDSRYFWVLN-AVSVAVAVI-LLAFDSIPNPTSSVSR
        V GILKG+  LS AI T +       + SS + +++L P  V L  +  +R  E  C  +  ++D R+  +    V +AV ++ LL   S+ + T ++  
Subjt:  VSGILKGYIALSTAIFTDLCTALFSDNPSSFLALLSLTPFAVCLTAVLFLR--EIPCSADNETEDSRYFWVLN-AVSVAVAVI-LLAFDSIPNPTSSVSR

Query:  IFSMVLLILLASPLVIPLHSF---------VKNRGRSGEVAE---ALLADESAVEGAEEGKPVIGEDHTIVEAMKTVEFWILFGSFLCGVGTGLAVMNNM
            +L+I +  P+++P  S          VK    +  V +     L + S     ++  P IGED T+++A+   +FW++F S + GVG+G+ +++N+
Subjt:  IFSMVLLILLASPLVIPLHSF---------VKNRGRSGEVAE---ALLADESAVEGAEEGKPVIGEDHTIVEAMKTVEFWILFGSFLCGVGTGLAVMNNM

Query:  GQIGLALGYDEVSIFISLMSIWGFFGRILSG
        GQI  +LGY    IF+SL+SI  F GR+  G
Subjt:  GQIGLALGYDEVSIFISLMSIWGFFGRILSG

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGAACCTCTCCCAGCTCCAACTCAACAATCTCTCCGTCGCCAAAGACCTCGGAAAGGCCTTTGGCCTCCTCGCCGGCCTCGCCTCCGACCGCTTCTCCACCTCCCTCCT
GCTCCTCATCGGCTCCATCGAAGGCCTTATTGGCTACGGCGCTCAATGGCTCGTCGTCAGTCAAAAAATCAAACCACTCCCTTACTGGCAGATGTGTATATTTTTGTGTA
TGGGAGGGAATAGTACCACTTGGATGAACACCGGCGTGCTTGTTACTTGCCTGAGAAACTTCCGGCGAAACAGAGGCACTGTTTCCGGCATTCTCAAAGGCTACATCGCT
CTCAGTACCGCCATTTTCACCGATCTTTGTACCGCTCTTTTCTCCGATAATCCCTCTTCTTTTCTCGCCCTCCTTTCCCTCACCCCCTTCGCCGTTTGTCTCACTGCTGT
TCTCTTCCTCCGTGAAATCCCCTGTTCCGCCGATAACGAAACAGAGGACTCGAGATACTTCTGGGTACTCAACGCCGTTTCCGTCGCTGTCGCTGTCATTCTCTTAGCCT
TCGATTCGATCCCAAATCCCACCTCGTCCGTATCGAGAATTTTCTCCATGGTGTTGCTGATTTTGCTAGCCTCACCTCTGGTAATCCCACTCCACTCGTTTGTCAAAAAC
AGGGGTCGGTCCGGTGAAGTTGCAGAGGCGTTGCTGGCGGACGAGAGTGCGGTGGAGGGTGCGGAAGAGGGGAAGCCGGTGATCGGAGAAGATCATACGATTGTTGAGGC
GATGAAGACGGTTGAATTTTGGATTCTGTTTGGGTCGTTTCTGTGTGGAGTGGGAACGGGATTGGCAGTGATGAACAATATGGGACAGATTGGATTGGCTCTTGGATACG
ACGAGGTTTCGATTTTCATATCTCTGATGAGTATTTGGGGGTTTTTTGGCCGGATTTTATCGGGATCAGGTGTCGGAGCATTTCATCAAGAAAGCAGGAATGCCAAGGCC
ACTATGGAACGCAGCTTCTCAAATTCTAATGGCACTTGGCTACATTCTCTTAGCCATTGCCATGCCTGGATCCTTATACATCGGCTCGGTTGTTGTCGGGATTTGCTATG
GCGTCCGTCTTGCCATCACCGTCCCAATGGCCTCTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AATATAATAAACTAAATAAATAAATAAAAACTTCAAATTGTAGAGTTTGAGTATCTTCCCACGTGTAAAGACATGCTAAGCACTTTGCACGTGTCACTTCCTTCCACTTT
AAATGCTCTACACAACTTCCCAGAAAACAAACTGCCTCTTCTACTCTCTCCCTCCCATTTCTAACTTCAATGAGCATCCACCACCGCCCTCCGCCGTCCTCCTCCGCCCT
TAAATGGCTCGGCTTAGTTACCGCCGTCTGGGTCCAATCCATCTCCGGCAACAATTAAACCTTCTCCAACTACTCCGCCGCCCTCAAATCCCTCATGAACCTCTCCCAGC
TCCAACTCAACAATCTCTCCGTCGCCAAAGACCTCGGAAAGGCCTTTGGCCTCCTCGCCGGCCTCGCCTCCGACCGCTTCTCCACCTCCCTCCTGCTCCTCATCGGCTCC
ATCGAAGGCCTTATTGGCTACGGCGCTCAATGGCTCGTCGTCAGTCAAAAAATCAAACCACTCCCTTACTGGCAGATGTGTATATTTTTGTGTATGGGAGGGAATAGTAC
CACTTGGATGAACACCGGCGTGCTTGTTACTTGCCTGAGAAACTTCCGGCGAAACAGAGGCACTGTTTCCGGCATTCTCAAAGGCTACATCGCTCTCAGTACCGCCATTT
TCACCGATCTTTGTACCGCTCTTTTCTCCGATAATCCCTCTTCTTTTCTCGCCCTCCTTTCCCTCACCCCCTTCGCCGTTTGTCTCACTGCTGTTCTCTTCCTCCGTGAA
ATCCCCTGTTCCGCCGATAACGAAACAGAGGACTCGAGATACTTCTGGGTACTCAACGCCGTTTCCGTCGCTGTCGCTGTCATTCTCTTAGCCTTCGATTCGATCCCAAA
TCCCACCTCGTCCGTATCGAGAATTTTCTCCATGGTGTTGCTGATTTTGCTAGCCTCACCTCTGGTAATCCCACTCCACTCGTTTGTCAAAAACAGGGGTCGGTCCGGTG
AAGTTGCAGAGGCGTTGCTGGCGGACGAGAGTGCGGTGGAGGGTGCGGAAGAGGGGAAGCCGGTGATCGGAGAAGATCATACGATTGTTGAGGCGATGAAGACGGTTGAA
TTTTGGATTCTGTTTGGGTCGTTTCTGTGTGGAGTGGGAACGGGATTGGCAGTGATGAACAATATGGGACAGATTGGATTGGCTCTTGGATACGACGAGGTTTCGATTTT
CATATCTCTGATGAGTATTTGGGGGTTTTTTGGCCGGATTTTATCGGGATCAGGTGTCGGAGCATTTCATCAAGAAAGCAGGAATGCCAAGGCCACTATGGAACGCAGCT
TCTCAAATTCTAATGGCACTTGGCTACATTCTCTTAGCCATTGCCATGCCTGGATCCTTATACATCGGCTCGGTTGTTGTCGGGATTTGCTATGGCGTCCGTCTTGCCAT
CACCGTCCCAATGGCCTCTGAAGTCTTCGGTCTCAAAAACTATGGCATGATCTACAATGTTCTAATCCTCAACCTCCCACTCGGTTCGTTCCTCTTCTCAGGACTGCTTG
CCGGGATCCTCTATGATTGGGAGGCGACAACGACGAAGGAAGGCGGCAATATGTGTGTGGGAGGGCATTGTTATAGGCTTGTGTTTGTTGTAATGGCTTGTTCATGTGTG
GTTGGGTTTGCCATGGACTTGTTTTTGGCCTTTAGAACCAAGAGGTTGTATTCCAAAATGAGGGGTCTAAAGGGATAAAAGGTGACGAAGGCTATTGGTCTTTACATACA
TCTCTATTGATGCATGCTCTTTTTCCCTTTATTCTTGAAGTCTTAAATAGTAATTATTTGCAAATAAAAAGGTTGAGAAGTTTATGAATTTTGCTTTACGAGGGTTATAT
TATAATTTTAGTTATTTAACTTTTAAGTTTGTGTTAAATAAATTTTGAATTTTGAATTAATTACGGTGTTAGTTGATCTTTTATGTATAAACTTCTAATTTTTGATATGG
TATCTGATAATAACTCCTTAGACCTTGG

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MNLSQLQLNNLSVAKDLGKAFGLLAGLASDRFSTSLLLLIGSIEGLIGYGAQWLVVSQKIKPLPYWQMCIFLCMGGNSTTWMNTGVLVTCLRNFRRNRGTVSGILKGYIA
LSTAIFTDLCTALFSDNPSSFLALLSLTPFAVCLTAVLFLREIPCSADNETEDSRYFWVLNAVSVAVAVILLAFDSIPNPTSSVSRIFSMVLLILLASPLVIPLHSFVKN
RGRSGEVAEALLADESAVEGAEEGKPVIGEDHTIVEAMKTVEFWILFGSFLCGVGTGLAVMNNMGQIGLALGYDEVSIFISLMSIWGFFGRILSGSGVGAFHQESRNAKA
TMERSFSNSNGTWLHSLSHCHAWILIHRLGCCRDLLWRPSCHHRPNGL

Clc02G04590 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome