; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc02G20400 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc02G20400
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionGDSL esterase/lipase
Genome locationClcChr02:32891838..32892146
RNA-Seq ExpressionClc02G20400
SyntenyClc02G20400
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0016788 - hydrolase activity, acting on ester bonds (molecular function)
InterPro domainsIPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004151059.1 GDSL esterase/lipase At2g30310 [Cucumis sativus]1.6e-4084.31Show/hide
Query:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP
        MV SRLGIKELVPPFLDPKLS+DD+KTGVSFA AGTG+DDLTA++S VIPVMKQID FKNYIQRLQ +VGVDES +I+ +ALVVISAGTNDLNINFYDLP
Subjt:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP

Query:  TR
        TR
Subjt:  TR

XP_008463830.1 PREDICTED: GDSL esterase/lipase At2g30310-like [Cucumis melo]1.6e-4086.27Show/hide
Query:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP
        MV S+LGIKELVPPFLD KLSDD+VKTGVSFA AG+G+D+LTASVSNVIPVMKQIDMFKNYI+RLQ IVGVDES KIL SALV+ISAGTND+NINFYDLP
Subjt:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP

Query:  TR
        TR
Subjt:  TR

XP_022947820.1 GDSL esterase/lipase At2g30310-like [Cucurbita moschata]7.3e-4185.29Show/hide
Query:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP
        MV SRLGIKELVPPFLDPKLS DDVKTGVSFA AGTG+DDLTA++S VIPVMKQID+FKNY QRLQRI GVDES KI+ SALV+ISAGTNDLNINFYD+P
Subjt:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP

Query:  TR
        TR
Subjt:  TR

XP_023006812.1 GDSL esterase/lipase At2g30310-like [Cucurbita maxima]3.3e-4186.27Show/hide
Query:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP
        MV SRLGIKE VPPFLDPKL +DDVKTGVSFA AGTG+DDLTA++S VIPVMKQID+FKNYIQRLQRIVGVDES KI+ SALV+ISAGTNDLNINFYDLP
Subjt:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP

Query:  TR
        TR
Subjt:  TR

XP_023533087.1 GDSL esterase/lipase At2g30310-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.3e-4185.29Show/hide
Query:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP
        MV SRLGIKELVPPFLDPKLS+DDVKTGVSFA AGTG+DDLTA++S VIPVMKQID+FKNY +RLQRIVGVDES KI+ SALV+ISAGTNDLNINFYD+P
Subjt:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP

Query:  TR
        TR
Subjt:  TR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LNE2 Uncharacterized protein7.9e-4184.31Show/hide
Query:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP
        MV SRLGIKELVPPFLDPKLS+DD+KTGVSFA AGTG+DDLTA++S VIPVMKQID FKNYIQRLQ +VGVDES +I+ +ALVVISAGTNDLNINFYDLP
Subjt:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP

Query:  TR
        TR
Subjt:  TR

A0A1S3CKL4 GDSL esterase/lipase At2g30310-like7.9e-4186.27Show/hide
Query:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP
        MV S+LGIKELVPPFLD KLSDD+VKTGVSFA AG+G+D+LTASVSNVIPVMKQIDMFKNYI+RLQ IVGVDES KIL SALV+ISAGTND+NINFYDLP
Subjt:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP

Query:  TR
        TR
Subjt:  TR

A0A5A7UVN0 GDSL esterase/lipase7.9e-4186.27Show/hide
Query:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP
        MV S+LGIKELVPPFLD KLSDD+VKTGVSFA AG+G+D+LTASVSNVIPVMKQIDMFKNYI+RLQ IVGVDES KIL SALV+ISAGTND+NINFYDLP
Subjt:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP

Query:  TR
        TR
Subjt:  TR

A0A6J1G7Z0 GDSL esterase/lipase At2g30310-like3.5e-4185.29Show/hide
Query:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP
        MV SRLGIKELVPPFLDPKLS DDVKTGVSFA AGTG+DDLTA++S VIPVMKQID+FKNY QRLQRI GVDES KI+ SALV+ISAGTNDLNINFYD+P
Subjt:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP

Query:  TR
        TR
Subjt:  TR

A0A6J1KWV5 GDSL esterase/lipase At2g30310-like1.6e-4186.27Show/hide
Query:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP
        MV SRLGIKE VPPFLDPKL +DDVKTGVSFA AGTG+DDLTA++S VIPVMKQID+FKNYIQRLQRIVGVDES KI+ SALV+ISAGTNDLNINFYDLP
Subjt:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP

Query:  TR
        TR
Subjt:  TR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22918 GDSL esterase/lipase At2g302203.7e-2757.84Show/hide
Query:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP
        ++ ++L IKE VPPFL P +SD D+ TGV FA AG GYDD T+  S  IPV +Q  MFKNYI RL+ IVG  ++M+I+ +ALVVISAG ND  +NFYD+P
Subjt:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP

Query:  TR
         R
Subjt:  TR

O22927 GDSL esterase/lipase At2g303104.3e-2859.8Show/hide
Query:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP
        ++ S+L IKELVPPFL P +S  D+ TGVSFA AG GYDD ++  S  IPV +Q  MFKNYI RL+ IVG  ++M+I+ +ALVVISAG ND  +NFYD+P
Subjt:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP

Query:  TR
        TR
Subjt:  TR

Q9LMJ3 GDSL esterase/lipase At1g069903.1e-2652.48Show/hide
Query:  VGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLPT
        + S +GIK+ VPPFLDP LSD D+ TGV FA AG+GYD+LT   ++ + V KQ DM ++Y++RL +IVG +++  I+  ALV++S+GTND N+N YD P+
Subjt:  VGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLPT

Query:  R
        R
Subjt:  R

Q9SIQ2 GDSL esterase/lipase At2g315501.5e-2552.94Show/hide
Query:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP
        ++ ++L IKE +PPFL P LSD D+ TGV FA AG GYDDLT+  +  I V +Q +MFK+YI RL+ IVG  ++M+I+ +A VV+SAG ND  +N+YD+P
Subjt:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP

Query:  TR
        +R
Subjt:  TR

Q9SJA9 GDSL esterase/lipase At2g245609.0e-2654.9Show/hide
Query:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP
        ++ ++L IK+ VPPFL P LSD ++ TGV FA AG GYDD T+  +  I V+ Q  MFKNYI RL+ IVG  ++M+I+K+ALVVISAG ND  +N+YD+P
Subjt:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP

Query:  TR
        +R
Subjt:  TR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06990.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein2.2e-2752.48Show/hide
Query:  VGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLPT
        + S +GIK+ VPPFLDP LSD D+ TGV FA AG+GYD+LT   ++ + V KQ DM ++Y++RL +IVG +++  I+  ALV++S+GTND N+N YD P+
Subjt:  VGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLPT

Query:  R
        R
Subjt:  R

AT2G24560.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family protein6.4e-2754.9Show/hide
Query:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP
        ++ ++L IK+ VPPFL P LSD ++ TGV FA AG GYDD T+  +  I V+ Q  MFKNYI RL+ IVG  ++M+I+K+ALVVISAG ND  +N+YD+P
Subjt:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP

Query:  TR
        +R
Subjt:  TR

AT2G30220.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family protein2.6e-2857.84Show/hide
Query:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP
        ++ ++L IKE VPPFL P +SD D+ TGV FA AG GYDD T+  S  IPV +Q  MFKNYI RL+ IVG  ++M+I+ +ALVVISAG ND  +NFYD+P
Subjt:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP

Query:  TR
         R
Subjt:  TR

AT2G30310.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family protein3.1e-2959.8Show/hide
Query:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP
        ++ S+L IKELVPPFL P +S  D+ TGVSFA AG GYDD ++  S  IPV +Q  MFKNYI RL+ IVG  ++M+I+ +ALVVISAG ND  +NFYD+P
Subjt:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP

Query:  TR
        TR
Subjt:  TR

AT2G31540.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein3.2e-2651.96Show/hide
Query:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP
        ++ ++L IKE +PPFL P LSD D+ TGV FA AG GYDDLT+  +  I V +Q +MFK+YI RL+ IVG  ++M+I+ +A VV+SAG ND  +N+Y++P
Subjt:  MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLP

Query:  TR
        +R
Subjt:  TR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTGGGCTCTAGGTTGGGGATAAAGGAGCTTGTTCCTCCATTTTTGGATCCTAAATTATCGGACGACGATGTGAAAACAGGAGTTAGTTTTGCATTTGCCGGCACAGG
CTACGACGATCTCACAGCCTCTGTATCGAACGTCATTCCTGTGATGAAGCAAATTGATATGTTCAAAAACTACATTCAAAGGCTTCAAAGGATTGTGGGTGTGGATGAAA
GTATGAAGATTCTTAAAAGTGCTTTGGTTGTTATTAGTGCAGGAACCAATGACTTAAACATCAATTTCTATGACCTTCCCACAAGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTGGGCTCTAGGTTGGGGATAAAGGAGCTTGTTCCTCCATTTTTGGATCCTAAATTATCGGACGACGATGTGAAAACAGGAGTTAGTTTTGCATTTGCCGGCACAGG
CTACGACGATCTCACAGCCTCTGTATCGAACGTCATTCCTGTGATGAAGCAAATTGATATGTTCAAAAACTACATTCAAAGGCTTCAAAGGATTGTGGGTGTGGATGAAA
GTATGAAGATTCTTAAAAGTGCTTTGGTTGTTATTAGTGCAGGAACCAATGACTTAAACATCAATTTCTATGACCTTCCCACAAGGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVGSRLGIKELVPPFLDPKLSDDDVKTGVSFAFAGTGYDDLTASVSNVIPVMKQIDMFKNYIQRLQRIVGVDESMKILKSALVVISAGTNDLNINFYDLPTR