CuGenDBv2

Gene ID	Clc02G21470
Organism	Citrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Description	Unknown protein
Genome location	ClcChr02:33725061..33727158
RNA-Seq Expression	Clc02G21470
Synteny	Clc02G21470
Gene Ontology terms	GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_008448398.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103490597 [Cucumis melo]

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XP_011657164.1 uncharacterized protein LOC101220684 [Cucumis sativus]

1.0e-130

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         S
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XP_023532268.1 uncharacterized protein LOC111794467 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

5.7e-126

82.12

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         S
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XP_038902956.1 uncharacterized protein LOC120089527 [Benincasa hispida]

2.7e-144

90.49

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         S HI
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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KEA0 Uncharacterized protein

4.9e-131

84.97

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        PSS HI
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A0A1S3BJ04 uncharacterized protein LOC103490597

1.9e-130

84.82

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         HI
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A0A5A7V7S7 Uncharacterized protein

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         HI
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A0A6J1G835 uncharacterized protein LOC111451693

6.8e-125

80.32

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        SSTD DLNRL+SSPPPKFRFLREAEEKLYRRLMEE+QKKACKN GS+QN E + I NP A    EE D  CCTKEKE +NH+VSQ        HSS+SSQ
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        VLPLASSP S
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A0A6J1KZH4 uncharacterized protein LOC111499670 isoform X1

6.2e-126

81.79

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        M SFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLLWWKKRSF S+VEDEFT+YAKEFFHLICW   R SSSSSSS+Q NNS    RN E+R QE DIEIG SKDL
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        SSTD DLNRL+SSPPPKFRFLREAEEKLYRRLMEE+QKKACKN GS+QN E  AI NP A    EE D FCC KEKE +NH+VSQ+SS+SSQ+LPLASSP
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         S
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G39560.1 Putative membrane lipoprotein

7.7e-28

40.23

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        M S S +G+ LS+VFGCLL AL+AELYYLLW KKRS T + +   D  T   +E   + C +     SSSS S   ++S  N + ++ + Q       C 
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Query:  KDLLLKSSGGEDGVELELMRLHNLAGP---PRFLFTIKEETKEDLESED-RSRKGSRTRSLSDLILTVDT-----PFLTPLPSPPLKATSTSPLNPL--S
         +         +G E       N+ GP   PRFLFTI EET E++ESED  S KG   +SL+DL L +++     P+LTP  SP L    T PL PL   
Subjt:  KDLLLKSSGGEDGVELELMRLHNLAGP---PRFLFTIKEETKEDLESED-RSRKGSRTRSLSDLILTVDT-----PFLTPLPSPPLKATSTSPLNPL--S

Query:  SFKHHGFNINPLFESSTDLDLNRLL------------SSPPPKFRFLREAEEKLYRRLMEE
        S       I+ LFESS+D + NRL+            SSP  +F+FLR+AEEKLY++ + E
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AT5G59350.1 unknown protein

2.7e-41

48.44

Show/hide

Query:  MTSFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLL---WWKKRSFTSQVEDE------FTNYAKEFFHLICWNWKRGSSSSSSSLQPNN-SRENQRNLEVRAQES
        M + SGLGIGLSL+FG LL ALV E+YYLL     KKR  + + E+E         YAKE   L C+           SLQ NN  RE + ++       
Subjt:  MTSFSGLGIGLSLVFGCLLFALVAELYYLL---WWKKRSFTSQVEDE------FTNYAKEFFHLICWNWKRGSSSSSSSLQPNN-SRENQRNLEVRAQES

Query:  DIEIGCSKDLLLKSSGGEDGVELELMRLHNLAGPPRFLFTIKEETKEDLESED--RSRKGSRT--RSLSDLILTVDTPFLTPLPSPPLKATSTSPLNPLS
        D+E+G  K L    +GG+ G E ELM+LHN     RFLFTI EETK DLESED  +SR GSR+  RSLSD+    +TP  TPL SP  K +S    +PL 
Subjt:  DIEIGCSKDLLLKSSGGEDGVELELMRLHNLAGPPRFLFTIKEETKEDLESED--RSRKGSRT--RSLSDLILTVDTPFLTPLPSPPLKATSTSPLNPLS

Query:  SFKHHGFNINPLFESSTDLDLNRLL---SSPPPKFRFLREAEEKLYRRLMEEAQKK
        S+ HHGF  NPLFES  +L+ N+     SSPPPKF+F+R+AEEKL +RL+EEA+++
Subjt:  SFKHHGFNINPLFESSTDLDLNRLL---SSPPPKFRFLREAEEKLYRRLMEEAQKK

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGACTTCTTTTAGTGGATTGGGAATTGGGTTGAGTTTAGTTTTTGGTTGTCTTCTGTTTGCTCTTGTTGCTGAGCTTTACTATTTGCTTTGGTGGAAGAAAAGAAGCTT
CACTTCACAAGTTGAAGATGAATTTACTAATTATGCTAAAGAGTTTTTTCATCTCATTTGTTGGAATTGGAAAAGGGGCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATTACAACCCA
ACAATTCTAGAGAAAATCAAAGGAATCTAGAAGTGAGAGCTCAAGAATCTGACATTGAAATTGGTTGCAGCAAGGATTTGTTATTGAAATCATCTGGTGGAGAAGATGGA
GTTGAGTTAGAGTTAATGAGACTGCATAATCTTGCAGGTCCACCTAGATTTCTTTTCACCATTAAAGAAGAAACTAAAGAAGATTTAGAGTCTGAAGACAGAAGCAGAAA
GGGATCAAGAACAAGAAGTTTAAGTGATCTTATTTTAACTGTTGACACTCCTTTTCTCACCCCTTTACCTTCTCCTCCATTGAAGGCAACATCAACATCTCCATTAAACC
CTTTGAGTTCTTTCAAACATCACGGATTCAATATAAACCCTCTCTTTGAATCATCAACTGATTTGGATTTGAATAGGCTTTTATCTTCACCTCCCCCAAAATTTAGGTTC
CTAAGAGAAGCAGAAGAGAAACTGTATAGAAGATTAATGGAAGAAGCTCAGAAGAAGGCTTGTAAAAATGATGGGTCAGTTCAGAATTCTGAAATCAAAGCCATTTGCAA
TCCCACAGCAGAAGAAAAAGATGGGTTTTGTTGTACAAAAGAGAAAGAGGCTGAAAATCATCATGTTTCACAGCATTCTTCAACTTCTTCACAGGTTCTTCCTTTAGCTT
CTTCTCCTTCTTCAAGGCATATATAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

AAACAACCAATGGAATTTATATATATTACAATAAACAAAAAAGGCAAAAAATAAAAATTTATTTCACTGCAATTCCACACGCTTTGGCCAAACCCACCCATGTCCATGTG
AGCTGCCATCCAAGCAAGAACAACCCAACCCCCACAAAACAATTACAAACCCAATTTCATATTTCACATATAAAATTTCCTTTCTTAATTTCCATCTTTTGGATTCTTTC
TCATATTAAAATTACAAATTGGGTTTTTGTTCGCATCTATTGATTGTGGCTGCTTCAGCATTCTTTTGCCTTTCTAAAGGCCACAATCTACAGATTCTCAAGTGGTTTGT
TCTTCAGTTGAATTGTTTTTCTTTTATTCCTATTGCTTCTTTGAGTTGAGGAGGCTGTTTCTCTGCTTTCTTGTTTATTTTCACTGCTGATTTTGGGGATTTCAACAATT
CTCTTGTCCTGTTTCTTTCATGGGGTTTTAGATTTTGGAGTTCTATTTCCTTTTTGGGTGTTTAAGCGATGGAGAAGAAAACTTGAGGTTTTGAGGGGTTTTGGTAATTA
ATGGTGGGGATTTGAGATTGTTCCCAATTGAAAGTGAAATGACTTCTTTTAGTGGATTGGGAATTGGGTTGAGTTTAGTTTTTGGTTGTCTTCTGTTTGCTCTTGTTGCT
GAGCTTTACTATTTGCTTTGGTGGAAGAAAAGAAGCTTCACTTCACAAGTTGAAGATGAATTTACTAATTATGCTAAAGAGTTTTTTCATCTCATTTGTTGGAATTGGAA
AAGGGGCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCATTACAACCCAACAATTCTAGAGAAAATCAAAGGAATCTAGAAGTGAGAGCTCAAGAATCTGACATTGAAATTGGTTGCAGCA
AGGATTTGTTATTGAAATCATCTGGTGGAGAAGATGGAGTTGAGTTAGAGTTAATGAGACTGCATAATCTTGCAGGTCCACCTAGATTTCTTTTCACCATTAAAGAAGAA
ACTAAAGAAGATTTAGAGTCTGAAGACAGAAGCAGAAAGGGATCAAGAACAAGAAGTTTAAGTGATCTTATTTTAACTGTTGACACTCCTTTTCTCACCCCTTTACCTTC
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Protein sequence

Show/hide protein sequence

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Clc02G21470 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome