; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc03G00280 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc03G00280
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionNADPH oxidase activator
Genome locationClcChr03:256159..258107
RNA-Seq ExpressionClc03G00280
SyntenyClc03G00280
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007789 - Protein of unknown function DUF688


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004145232.1 uncharacterized protein LOC101203250 [Cucumis sativus]3.9e-5165.37Show/hide
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XP_022970378.1 uncharacterized protein LOC111469381 [Cucurbita maxima]8.1e-4965.92Show/hide
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XP_023519368.1 uncharacterized protein LOC111782803 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-4966.85Show/hide
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XP_038894794.1 uncharacterized protein LOC120083212 [Benincasa hispida]1.7e-5971.5Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LYC9 Uncharacterized protein1.9e-5165.37Show/hide
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A0A1S3C5A7 uncharacterized protein At4g009509.0e-5466.18Show/hide
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A0A5D3BF70 NADPH oxidase activator9.0e-5466.18Show/hide
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A0A6J1HLP7 uncharacterized protein LOC1114647337.4e-4865.17Show/hide
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A0A6J1I3P2 uncharacterized protein LOC1114693813.9e-4965.92Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06930.1 unknown protein9.7e-0835.29Show/hide
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        DY+   SA+VPFKWES+PGTP+            ++   N  + +PLTPPPSYF     SP    H+    P   N++F  L  K    P SP    +SS
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         SSSSS+ P +P R S        D  N   +  +          S+L +   S K  GCY  L KV  R
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AT2G40475.1 unknown protein8.2e-0738.13Show/hide
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        ASVPF WE+ PGTPK  L      L PLTPPPSY+S+ ++S   L+   + K   F+ ++  +   +P+    S +S SSSS SSSS  S     PR+  
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Query:  FDSR--VDDDDNDNDNDNYNYNDDHNVQSPVSTLFFARG
          SR  V +DD +    +          SP STL + RG
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AT3G56260.2 unknown protein5.1e-0936.09Show/hide
Query:  RRRDDMSMVGEDYHTEVSASVPFKWESEPGTPKANLVENRALLSPLTPPPSYFSNH-TNSPLPLTHIPSYKPNFLN-SVFRKLSLKPTPHPPSPT---SF
        R  DD ++  E       AS+PF WES PGTPK +L  + +L  PLTPPPSY+S+   ++P   + + S    FL+ S+F    L+ + H    T   SF
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        S SS SSSSS     P  L    +    D  +     NY +D    SP STL  + G   GC   +  V
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAATAATATGGGAAGAAATAGAGGAGATTTGGGAGGAAGATCAGGGAAGATGAGACTGAAGAAGGTAAGAAGAAGAGACGACATGTCGATGGTGGGGGAAGAT
TACCATACAGAAGTATCAGCGTCAGTGCCATTCAAGTGGGAGTCAGAGCCAGGGACTCCAAAGGCTAATTTGGTTGAGAATAGGGCTCTCCTTTCTCCTCTAACA
CCTCCACCTTCATATTTCTCCAATCACACTAATTCCCCTCTGCCTCTCACCCATATTCCTTCTTATAAGCCAAATTTCCTCAACTCTGTCTTCAGGAAGCTTTCT
CTCAAGCCCACTCCCCACCCTCCCTCCCCCACTTCTTTCTCCTCCTCCTCCCCCTCCTCCTCTTCCTCTACCAGACCAGGAACCCCAAGGAGATTGTCCTTTGAT
TCCAGGGTGGACGACGACGACAATGACAACGACAACGACAACTACAACTACAACGACGACCACAATGTACAATCACCTGTTTCTACTTTGTTCTTTGCACGTGGA
AGTGATAAAGGATGCTACCCAAAATTGGCCAAGGTATTCACCAGAGATTCTAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GAAGAATTGTGTACGGTAAGAAAAATTGAGGACCCAATAAGATAGGGAAAGAGGAAGACCACAAAAACAACATGAAAGCTTTATTGAGTCATTGGTGGTAGCAAT
TAATTAGGTAATTATTGAGCCATGGATTGATATTCTCTTAACAAGGAGGCAATAATGGCAGCCATAATATTACAGTTTGCCTGATGAATATTGGAGAAACAACAG
TTGAAGAACCAATATCAACATTCAACGTAGTAGTAGCTGCTATAATCATCCATTAGAGCAGGGAGAAAGGAAAGATGAATAATATGGGAAGAAATAGAGGAGATT
TGGGAGGAAGATCAGGGAAGATGAGACTGAAGAAGGTAAGAAGAAGAGACGACATGTCGATGGTGGGGGAAGATTACCATACAGAAGTATCAGCGTCAGTGCCAT
TCAAGTGGGAGTCAGAGCCAGGGACTCCAAAGGCTAATTTGGTTGAGAATAGGGCTCTCCTTTCTCCTCTAACACCTCCACCTTCATATTTCTCCAATCACACTA
ATTCCCCTCTGCCTCTCACCCATATTCCTTCTTATAAGCCAAATTTCCTCAACTCTGTCTTCAGGAAGCTTTCTCTCAAGCCCACTCCCCACCCTCCCTCCCCCA
CTTCTTTCTCCTCCTCCTCCCCCTCCTCCTCTTCCTCTACCAGACCAGGAACCCCAAGGAGATTGTCCTTTGATTCCAGGGTGGACGACGACGACAATGACAACG
ACAACGACAACTACAACTACAACGACGACCACAATGTACAATCACCTGTTTCTACTTTGTTCTTTGCACGTGGAAGTGATAAAGGATGCTACCCAAAATTGGCCA
AGGTATTCACCAGAGATTCTAAATGAAAACACAGTTTTTTTTTTTTTTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNNMGRNRGDLGGRSGKMRLKKVRRRDDMSMVGEDYHTEVSASVPFKWESEPGTPKANLVENRALLSPLTPPPSYFSNHTNSPLPLTHIPSYKPNFLNSVFRKLS
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