; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc03G08690 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc03G08690
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionVQ motif-containing protein 4-like
Genome locationClcChr03:8937535..8939959
RNA-Seq ExpressionClc03G08690
SyntenyClc03G08690
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33
IPR039827 - VQ motif-containing protein 4/13


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0056997.1 VQ motif-containing protein 4 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]9.6e-11788.49Show/hide
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XP_031736090.1 VQ motif-containing protein 4 [Cucumis sativus]2.1e-11688.49Show/hide
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XP_038876999.1 VQ motif-containing protein 4 [Benincasa hispida]2.6e-13096.06Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV54 VQ domain-containing protein1.0e-11688.49Show/hide
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A0A1S3B685 VQ motif-containing protein 4 isoform X13.0e-11688.45Show/hide
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A0A1S3B6X5 VQ motif-containing protein 4 isoform X23.0e-11688.45Show/hide
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A0A5A7UQT0 VQ motif-containing protein 4 isoform X24.6e-11788.49Show/hide
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A0A6J1KRE6 VQ motif-containing protein 4-like2.2e-11487.5Show/hide
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        ASV PA    NSDS SKTHIPPIKSLP+RQQSGFKLYERRNS+NKLKINPVFPVFGST HSGFSPRK EILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLA
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 132.9e-3148.45Show/hide
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        TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P   K  + +P P  P   S     IPPIK++  ++Q S F+L ERRNS+ + L INP         HS
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        G      EIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGF+L PSP+TTPRD+EPRLL LFPMT    P
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Q5M750 VQ motif-containing protein 42.3e-6056.92Show/hide
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        ME S  ++E     +L+PSP    +N+S   SS+S   +  PPT P +          TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  +S+K
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        SG +N        +  +  AEEKA+KE+GF+LHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV G
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 331.7e-3145.06Show/hide
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        M  S+SS SS    +Q  PP  + P    Q+ SP    + + + NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS           AP   N++++ S   IPPIK
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Query:  SLPRRQQSGFKLYERRN------SLNKLKINP---------VFPVFGSTAHSG--FSPR-----KHEILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGL
             + + FKLYERR       + N L IN          +F    S+ H    FSPR     ++ +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF++S  
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Query:  ANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFFLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
           S L  GN    +  E+KAI +KGF+LHPSP +TPRDS+P LLPLFP+ SP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 317.4e-1133.15Show/hide
Query:  TTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPGAPNSDSQSKTHIPPIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLN-KLKINPVFPVFGSTAHSGFSPRKHEILS
        TTFVQ DT++F+++VQ LTG  E    A+   A       +  KT I        +++   KL+ERR  +  KL+I      F  T  +  S   +  L 
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Query:  PSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFFLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPG
         S +  P+   S ++ +  +P               +   + E EEKAIKE+ F+LHPSP + P  +EP LL LFP+TSP   G
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 193.6e-3446.67Show/hide
Query:  TNSSSSSSSTSNGLQVMPPTPPPQLHQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPGAPNSDSQSKTHIPPIKSLPRR
        ++SSS SSS  NG           LH       ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S +P P  P+   +    IPPIK+   +
Subjt:  TNSSSSSSSTSNGLQVMPPTPPPQLHQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPGAPNSDSQSKTHIPPIKSLPRR

Query:  QQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPVFPVFGSTAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDA
        + SG KLYERR       N  N L IN +    G      FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+                  
Subjt:  QQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPVFPVFGSTAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDA

Query:  EAEEKAIKEKGFFLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
          EE+ I +KG++LH SP +TPRDSEP+LLPLFP+TSPR+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein1.6e-6156.92Show/hide
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        ME S  ++E     +L+PSP    +N+S   SS+S   +  PPT P +          TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  +S+K
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        P P     D   + S   IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINP+ PVF +  +S FSPRK EILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDR
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        SG +N        +  +  AEEKA+KE+GF+LHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV G
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein4.7e-6156.98Show/hide
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        ME S  ++E     +L+PSP    +N+S   SS+S   +  PPT P +          TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  +S+K
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Query:  PAPGAPNSD---SQSKTHIPPIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSTAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDR
        P P     D   + S   IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNS+  LKINP+ PVF +  +S FSPRK EILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDR
Subjt:  PAPGAPNSD---SQSKTHIPPIKSLPRRQQ-----SGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSTAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDR

Query:  SGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFFLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
        SG +N        +  +  AEEKA+KE+GF+LHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV
Subjt:  SGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFFLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV

AT2G33780.1 VQ motif-containing protein2.0e-3248.45Show/hide
Query:  TRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPGAPNSDSQSKTHIPPIKSLP-RRQQSGFKLYERRNSL-NKLKINPVFPVFGSTAHS
        TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P   K  + +P P  P   S     IPPIK++  ++Q S F+L ERRNS+ + L INP         HS
Subjt:  TRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPGAPNSDSQSKTHIPPIKSLP-RRQQSGFKLYERRNSL-NKLKINPVFPVFGSTAHS

Query:  GFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFFLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVP
        G      EIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGF+L PSP+TTPRD+EPRLL LFPMT    P
Subjt:  GFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFFLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVP

AT3G15300.1 VQ motif-containing protein2.6e-3546.67Show/hide
Query:  TNSSSSSSSTSNGLQVMPPTPPPQLHQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPGAPNSDSQSKTHIPPIKSLPRR
        ++SSS SSS  NG           LH       ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S +P P  P+   +    IPPIK+   +
Subjt:  TNSSSSSSSTSNGLQVMPPTPPPQLHQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPGAPNSDSQSKTHIPPIKSLPRR

Query:  QQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPVFPVFGSTAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDA
        + SG KLYERR       N  N L IN +    G      FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+                  
Subjt:  QQSGFKLYERR-------NSLNKLKINPVFPVFGSTAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDA

Query:  EAEEKAIKEKGFFLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV
          EE+ I +KG++LH SP +TPRDSEP+LLPLFP+TSPR+
Subjt:  EAEEKAIKEKGFFLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRV

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein1.2e-3245.06Show/hide
Query:  MTNSSSSSSSTSNGLQVMPP--TPPPQLHQLHSPKPITRSESV-NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPGAPNSDSQ-SKTHIPPIK
        M  S+SS SS    +Q  PP  + P    Q+ SP    + + + NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS           AP   N++++ S   IPPIK
Subjt:  MTNSSSSSSSTSNGLQVMPP--TPPPQLHQLHSPKPITRSESV-NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPGAPNSDSQ-SKTHIPPIK

Query:  SLPRRQQSGFKLYERRN------SLNKLKINP---------VFPVFGSTAHSG--FSPR-----KHEILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGL
             + + FKLYERR       + N L IN          +F    S+ H    FSPR     ++ +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF++S  
Subjt:  SLPRRQQSGFKLYERRN------SLNKLKINP---------VFPVFGSTAHSG--FSPR-----KHEILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFDRSGL

Query:  ANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFFLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP
           S L  GN    +  E+KAI +KGF+LHPSP +TPRDS+P LLPLFP+ SP
Subjt:  ANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFFLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACCTCTTCAATTCATCAAGAAAACCCATGTCCTCCTTCTCTCCTTCCTTCTCCAAGCAGTCGCATGACTAACAGCAGCAGCAGCAGTAGCAGCACCAGCAATGG
CCTCCAAGTCATGCCTCCAACTCCGCCGCCTCAATTGCATCAGTTGCATTCTCCCAAACCCATCACTCGATCCGAATCTGTCAATCCTTACCCTACTACCTTCGTTCAAG
CTGATACTTCCTCTTTTAAACAAGTAGTTCAAATGCTCACTGGATCCCCTGAAACTGCCAAGCAAGCCTCTGTCAAGCCAGCTCCGGGTGCTCCTAACTCTGATTCTCAG
TCCAAAACCCACATTCCACCCATTAAATCTTTGCCCAGAAGGCAGCAATCTGGATTCAAGCTCTACGAGCGTAGGAACTCTTTGAATAAACTTAAGATTAACCCTGTGTT
TCCCGTTTTTGGTTCTACTGCTCATTCTGGGTTTTCTCCGAGGAAACATGAAATTCTTTCTCCTAGCATTCTGGACTTTCCGGCGCTTGCTCTCAGTCCGGTCACGCCGC
TAATTCCTGACCCGTTTGATCGATCTGGGTTGGCGAATTGTAGCTATTTGAAGAATGGGAATGCTAAGTTGGATGCAGAGGCGGAAGAGAAAGCGATTAAAGAAAAGGGG
TTTTTCTTGCATCCATCGCCGACCACCACTCCTCGGGACTCCGAGCCTCGGCTGTTGCCACTGTTCCCAATGACATCTCCTAGAGTCCCAGGATTAGAAAATTCACCATT
GGACATGTTAGATGTGACCCCATCTGAAGTTGATTCTGGAAGCAGATTTGTACCAGTCAACAAACTAGCTGACAAAGTAAGAAGGAACCATCCAACCTTGATAAGTTGTT
CTCTAGAACAGTTGGGGCCCTTGAAGGTGAAGCCTTGGGGCTGTGCTAAAGTGAATCGATCATGGAAAAAGGTAGTGGTGCTTTTAATCTCTCTCTCGAGTCTTAACACT
TACGCTGTGGCCTACTTGCTTGACTCTGAACAGTCCGCCGAAACAACCTCAAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCCCACCAAAACATTTCTTACCAAACCACAAAACAGAGCATAGGCAGAGGAAGAAATAAACAATCCAACCTTCTTAATCTCTCATCTACCCCACTCCCACGCCTCTGCTT
CTCAACACTTTCCTTCTCTCCCTTTTCTTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAACCTCTTCACTGATCAGAACCCCATCAATGGAAACCTCT
TCAATTCATCAAGAAAACCCATGTCCTCCTTCTCTCCTTCCTTCTCCAAGCAGTCGCATGACTAACAGCAGCAGCAGCAGTAGCAGCACCAGCAATGGCCTCCAAGTCAT
GCCTCCAACTCCGCCGCCTCAATTGCATCAGTTGCATTCTCCCAAACCCATCACTCGATCCGAATCTGTCAATCCTTACCCTACTACCTTCGTTCAAGCTGATACTTCCT
CTTTTAAACAAGTAGTTCAAATGCTCACTGGATCCCCTGAAACTGCCAAGCAAGCCTCTGTCAAGCCAGCTCCGGGTGCTCCTAACTCTGATTCTCAGTCCAAAACCCAC
ATTCCACCCATTAAATCTTTGCCCAGAAGGCAGCAATCTGGATTCAAGCTCTACGAGCGTAGGAACTCTTTGAATAAACTTAAGATTAACCCTGTGTTTCCCGTTTTTGG
TTCTACTGCTCATTCTGGGTTTTCTCCGAGGAAACATGAAATTCTTTCTCCTAGCATTCTGGACTTTCCGGCGCTTGCTCTCAGTCCGGTCACGCCGCTAATTCCTGACC
CGTTTGATCGATCTGGGTTGGCGAATTGTAGCTATTTGAAGAATGGGAATGCTAAGTTGGATGCAGAGGCGGAAGAGAAAGCGATTAAAGAAAAGGGGTTTTTCTTGCAT
CCATCGCCGACCACCACTCCTCGGGACTCCGAGCCTCGGCTGTTGCCACTGTTCCCAATGACATCTCCTAGAGTCCCAGGATTAGAAAATTCACCATTGGACATGTTAGA
TGTGACCCCATCTGAAGTTGATTCTGGAAGCAGATTTGTACCAGTCAACAAACTAGCTGACAAAGTAAGAAGGAACCATCCAACCTTGATAAGTTGTTCTCTAGAACAGT
TGGGGCCCTTGAAGGTGAAGCCTTGGGGCTGTGCTAAAGTGAATCGATCATGGAAAAAGGTAGTGGTGCTTTTAATCTCTCTCTCGAGTCTTAACACTTACGCTGTGGCC
TACTTGCTTGACTCTGAACAGTCCGCCGAAACAACCTCAAAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
METSSIHQENPCPPSLLPSPSSRMTNSSSSSSSTSNGLQVMPPTPPPQLHQLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVKPAPGAPNSDSQ
SKTHIPPIKSLPRRQQSGFKLYERRNSLNKLKINPVFPVFGSTAHSGFSPRKHEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKG
FFLHPSPTTTPRDSEPRLLPLFPMTSPRVPGLENSPLDMLDVTPSEVDSGSRFVPVNKLADKVRRNHPTLISCSLEQLGPLKVKPWGCAKVNRSWKKVVVLLISLSSLNT
YAVAYLLDSEQSAETTSK