; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc04G05645 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc04G05645
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Descriptiongag_pre-integrs domain-containing protein
Genome locationClcChr04:18335545..18335883
RNA-Seq ExpressionClc04G05645
SyntenyClc04G05645
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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VFQ66421.1 unnamed protein product [Cuscuta campestris]9.9e-2354.69Show/hide
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VFQ76576.1 unnamed protein product [Cuscuta campestris]2.2e-2253.91Show/hide
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VFQ84242.1 unnamed protein product [Cuscuta campestris]9.9e-2354.69Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A3Q7IYG7 gag_pre-integrs domain-containing protein1.3e-2355.47Show/hide
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A0A484KKF0 Uncharacterized protein4.8e-2354.69Show/hide
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A0A484KMK1 Uncharacterized protein4.8e-2354.69Show/hide
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A0A484M5X8 Uncharacterized protein4.8e-2354.69Show/hide
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A0A484MAU4 Uncharacterized protein (Fragment)4.8e-2354.69Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGGAGAATTTTTTGTATTGCAAAGATTTGTTTGATCCAATTGAAACAACCACAAAAGCTAATGACACCATTTCTAAACCTGCAAAACTAGAGTTAAGTGGTGGATT
GATATTAGCATTTTCAATCATGTGCCTAAGGAGTATGACCTATGAGTTGTGGAAGATATTGGAAGGTCTTTATGCAAGGAAGATCGCACATAACAAAGCTTCACTAATCA
AGCGACTTGTTGATTTGAAATTGAAAGGTGAGAAGTCTATTTCTGAGCATTTGAGTGACTTTCAAGATATTATTAACAAGCTGACTACTATGAAGATTGATCTTAATGAC
CAATTATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATGGAGAATTTTTTGTATTGCAAAGATTTGTTTGATCCAATTGAAACAACCACAAAAGCTAATGACACCATTTCTAAACCTGCAAAACTAGAGTTAAGTGGTGGATT
GATATTAGCATTTTCAATCATGTGCCTAAGGAGTATGACCTATGAGTTGTGGAAGATATTGGAAGGTCTTTATGCAAGGAAGATCGCACATAACAAAGCTTCACTAATCA
AGCGACTTGTTGATTTGAAATTGAAAGGTGAGAAGTCTATTTCTGAGCATTTGAGTGACTTTCAAGATATTATTAACAAGCTGACTACTATGAAGATTGATCTTAATGAC
CAATTATAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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