; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc04G06070 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc04G06070
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Description10 kDa chaperonin-like
Genome locationClcChr04:19000115..19001538
RNA-Seq ExpressionClc04G06070
SyntenyClc04G06070
Gene Ontology termsGO:0051085 - chaperone cofactor-dependent protein refolding (biological process)
GO:0005759 - mitochondrial matrix (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0016887 - ATPase activity (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0051082 - unfolded protein binding (molecular function)
GO:0051087 - chaperone binding (molecular function)
InterPro domainsIPR011032 - GroES-like superfamily
IPR018369 - Chaperonin GroES, conserved site
IPR020818 - GroES chaperonin family
IPR037124 - GroES chaperonin superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_008455733.1 PREDICTED: 10 kDa chaperonin-like [Cucumis melo]2.6e-3389.66Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF
        MAKRL+PLLNRVLIEKIVPP KTNSGILLPEKSSKLNSGKVI+VGPGARDREGKIIP++VKEGD VLLPEYGG EVKLGEKQ+ YLF
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF

XP_022154455.1 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like [Momordica charantia]5.3e-3490.8Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF
        MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTN+GILLPEKSSKLNSGKV+SVGPG RDREG +IPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLG+KQ +YLF
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF

XP_022931931.1 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like [Cucurbita moschata]1.5e-3390.8Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF
        MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPG RDR+G IIPV VKEG+TVLLPEYGGTEVKLGEKQ+ YL+
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF

XP_022966634.1 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like [Cucurbita maxima]9.0e-3491.95Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF
        MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPG RDR+G IIPV VKEG+TVLLPEYGGTEVKLGEKQ+ YLF
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF

XP_038881343.1 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like [Benincasa hispida]3.3e-3696.55Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF
        MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVIS+GPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQ+ YLF
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KYT6 Uncharacterized protein2.8e-3388.51Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF
        MAKRL+PLLNRVLIEKIVPP KTNSGILLPEKS+KLNSGKVI+VGPGARDREGKIIP++VKEGD VLLPEYGG EVKLGEKQ+ YLF
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF

A0A1S3C2U3 10 kDa chaperonin-like1.3e-3389.66Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF
        MAKRL+PLLNRVLIEKIVPP KTNSGILLPEKSSKLNSGKVI+VGPGARDREGKIIP++VKEGD VLLPEYGG EVKLGEKQ+ YLF
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF

A0A6J1DJN1 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like2.6e-3490.8Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF
        MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTN+GILLPEKSSKLNSGKV+SVGPG RDREG +IPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLG+KQ +YLF
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF

A0A6J1EUZ7 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like7.4e-3490.8Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF
        MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPG RDR+G IIPV VKEG+TVLLPEYGGTEVKLGEKQ+ YL+
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF

A0A6J1HUD0 10 kDa chaperonin, mitochondrial-like4.4e-3491.95Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF
        MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPG RDR+G IIPV VKEG+TVLLPEYGGTEVKLGEKQ+ YLF
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O59804 10 kDa heat shock protein, mitochondrial1.6e-1754.22Show/hide
Query:  AKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKS-SKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQY
        AK +VPLL+R+L+++I    KT SGI LPEKS  KL+ G+VISVG G  ++EGK+   +V  GD VLLP YGG+ +K+GE++Y
Subjt:  AKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKS-SKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQY

P34893 10 kDa chaperonin, mitochondrial1.5e-3174.7Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQY
        M KRL+P  NR+L+++++ PAKT SGILLPEKSSKLNSGKVI+VGPG+RD++GK+IPV+VKEGDTVLLPEYGGT+VKLGE +Y
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQY

P38910 10 kDa heat shock protein, mitochondrial1.5e-1549.43Show/hide
Query:  AKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKS-SKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF
        AK +VPL++RVL+++I   AKT SG+ LPEK+  KLN  +V++VGPG  D  G  +   VK GD VL+P++GG+ +KLG    V LF
Subjt:  AKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKS-SKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF

Q96539 10 kDa chaperonin2.5e-3174.7Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQY
        M KRL+P  NR+L++ ++ PAKT SGILLPEK+SKLNSGKVI+VGPG+RD++GK+IPV+VKEGDTVLLPEYGGT+VKLGEK+Y
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQY

Q9W6X3 10 kDa heat shock protein, mitochondrial2.8e-1445.35Show/hide
Query:  KRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKS-SKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF
        ++ +PL +RVL+E+++    T  GI+LPEKS  K+    V++VGPG+ +++G++ P++VK G+ VLLP+YGGT+V L +K Y +LF
Subjt:  KRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKS-SKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLF

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G14980.1 chaperonin 101.1e-3274.7Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQY
        M KRL+P  NR+L+++++ PAKT SGILLPEKSSKLNSGKVI+VGPG+RD++GK+IPV+VKEGDTVLLPEYGGT+VKLGE +Y
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQY

AT1G23100.1 GroES-like family protein1.1e-3277.38Show/hide
Query:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYV
        MAKRL+P LNRVL+EKI+PP+KT SGILLPEKSS+LNSG+VI+VGPGARDR G +IPV+VKEGD VLLPE+GGT+VKLGEK+++
Subjt:  MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYV

AT5G20720.1 chaperonin 202.8e-0946.05Show/hide
Query:  KRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKS-SKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVK
        K L PL +RV I+      KT  G+LL E +  K + G VI+VGPG+ D EGKI P+ V  G TVL  +Y G + K
Subjt:  KRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKS-SKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVK

AT5G20720.2 chaperonin 202.8e-0946.05Show/hide
Query:  KRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKS-SKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVK
        K L PL +RV I+      KT  G+LL E +  K + G VI+VGPG+ D EGKI P+ V  G TVL  +Y G + K
Subjt:  KRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKS-SKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVK

AT5G20720.3 chaperonin 202.8e-0946.05Show/hide
Query:  KRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKS-SKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVK
        K L PL +RV I+      KT  G+LL E +  K + G VI+VGPG+ D EGKI P+ V  G TVL  +Y G + K
Subjt:  KRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKS-SKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGAAGCGTTTGGTTCCATTGCTGAATCGCGTTCTGATCGAGAAGATCGTGCCTCCTGCCAAAACCAATTCCGGCATTCTGCTTCCTGAGAAGTCCAGTAAGCTTAA
CTCTGGAAAAGTTATCTCTGTTGGTCCTGGGGCTCGTGATAGAGAGGGAAAGATTATTCCTGTCACTGTAAAAGAAGGTGACACCGTCCTCCTACCAGAATATGGAGGCA
CTGAAGTCAAGCTTGGAGAAAAACAGTATGTATACTTGTTCTCTTACTTTTGTTATTTATTTAAGTTTTGGTCTGTTATTTGCTCAAGAATTTGGTTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGAAGCGTTTGGTTCCATTGCTGAATCGCGTTCTGATCGAGAAGATCGTGCCTCCTGCCAAAACCAATTCCGGCATTCTGCTTCCTGAGAAGTCCAGTAAGCTTAA
CTCTGGAAAAGTTATCTCTGTTGGTCCTGGGGCTCGTGATAGAGAGGGAAAGATTATTCCTGTCACTGTAAAAGAAGGTGACACCGTCCTCCTACCAGAATATGGAGGCA
CTGAAGTCAAGCTTGGAGAAAAACAGTATGTATACTTGTTCTCTTACTTTTGTTATTTATTTAAGTTTTGGTCTGTTATTTGCTCAAGAATTTGGTTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAKRLVPLLNRVLIEKIVPPAKTNSGILLPEKSSKLNSGKVISVGPGARDREGKIIPVTVKEGDTVLLPEYGGTEVKLGEKQYVYLFSYFCYLFKFWSVICSRIWF