; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc04G08160 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc04G08160
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionExtensin
Genome locationClcChr04:21925569..21926165
RNA-Seq ExpressionClc04G08160
SyntenyClc04G08160
Gene Ontology termsGO:0009664 - plant-type cell wall organization (biological process)
GO:0005199 - structural constituent of cell wall (molecular function)
InterPro domainsIPR006706 - Extensin domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6592187.1 Extensin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.4e-5570.05Show/hide
Query:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSK---------FYYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLV
        MAYLV  +LVA LS   VIATDY YSSPPPPYYVYK PPP +Y SPPP K          YYSP  P+Y SPPPPVYHSPPPP+YHSPPPPVYHSPPP V
Subjt:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSK---------FYYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLV

Query:  YYSPPPPKKQE-----YKSPPPPIYY--------SPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVY
        Y SPPPP         YKSPPPP+YY        SPPPPVY+SPPPPVY S  PP+YHSPPPP Y+S PPPVYYSPPPPVY SPP P+YHSPPPPVY
Subjt:  YYSPPPPKKQE-----YKSPPPPIYY--------SPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVY

XP_004139745.3 extensin-3 [Cucumis sativus]7.4e-5774.05Show/hide
Query:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKF---YYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYH-------SPPPPVYHSPPPL
        MAYL+  ILVATLSL  V+A +YVYSSPPPPYYVYK PPP +Y SPPP K    Y SP  P+YHSPPPP+YHSPPPP+YH       SPPPPVY SPPP 
Subjt:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKF---YYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYH-------SPPPPVYHSPPPL

Query:  VYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVY
        VY+SPPPP    YKSPPPP+YYSPPPPVYHSPPPPVY S  PP+YHSPPPP Y+S PPPVY+SPPPPVYHSPP PVY SPPPPVY
Subjt:  VYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVY

XP_022143678.1 extensin-1 [Momordica charantia]1.5e-5475.82Show/hide
Query:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYH--SPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPPP
        MAYLV AILVATLSL  V+ATDYVYSSPPPPYY Y  PPP IY SPPP   Y+SP  P Y+SPPPP Y   SPPPP+YHSPPPPVYHSPPP VYYS PPP
Subjt:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYH--SPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPPP

Query:  KKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPP----IYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVYQ
         K EYKSPPPP+YYSPPPPVY+SPPPPVY S  PP     Y SPPPP Y S PPPVYYSPPPPVY+SPP P+YHSPPPPVY+
Subjt:  KKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPP----IYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVYQ

XP_022976067.1 extensin-3-like [Cucurbita maxima]1.8e-5875.98Show/hide
Query:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKF---YYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPP
        MAYLV  +LVA LS   VIA DY YSSPPPPYYVYK PPP +Y SPPP K    Y SP  P+Y+SPPPPVYHSPPPP+YHSPPPPVYHS PP VYYSPPP
Subjt:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKF---YYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPP

Query:  PKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVYQ
          K+EYKSPPPP+YYSPPPPVY SPPPPVYHS  PP+YHSPPPP Y S PPP+Y SPPP VYHSPP PVYHSPPPP+Y+
Subjt:  PKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVYQ

XP_038899768.1 extensin-3-like [Benincasa hispida]1.7e-6173.27Show/hide
Query:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKY------PPPLI---YQSPPPSKF-------YYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVY
        M YLVVAILVATLS   VI  DYVYSSPPPPYYVYK       PPP +   Y+SPPPS +       Y+SPS P+YHSPPPPVYHSP PP+YHSPPPPVY
Subjt:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKY------PPPLI---YQSPPPSKF-------YYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVY

Query:  HSPPPLVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPP-----------EYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPP
        HSPPP VYYSPPPPKKQEYKSPPPP+YYSPPPPVYHSPPPPVYHS  PP+YHSPPPP           EY+S PPPVYYSPPPP+YHSPP PVY SPPPP
Subjt:  HSPPPLVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPP-----------EYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPP

Query:  VY
        VY
Subjt:  VY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7U062 Extensin-3-like3.2e-5072.16Show/hide
Query:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPPPKK
        MAYLV  ILVATLSL  V A +YVYSSPPPPYYVYK PPP +Y SPPP K  Y      Y SPPPP+YHSPPPP+YHSPPPP+Y+SPPP VY+SPPPP  
Subjt:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPPPKK

Query:  QEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPP---EYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPP
          Y SPPPP+Y+SPPPPVYHSPPPPVY S  PPIY+SPPPP   EY+S PPP+YYS PPP+YHSPP  VY SPPPP
Subjt:  QEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPP---EYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPP

A0A5D3E640 Extensin-3-like8.8e-4871.02Show/hide
Query:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPPPKK
        MAYLV  ILVATLSL  V A +YVYSSPPPPYYVYK PPP +Y SPPP K  Y      Y SPPPP+YHSPPPP+YHSPPPP+Y+SPPP VY+SPPPP  
Subjt:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPPPKK

Query:  QEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPP---EYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPP
          Y SPPPP+Y+SPPPPVYHSPPPPVY S  PPIY+SPPPP   EY+S PPP+YYS PPP+YHSPP     SPPPP
Subjt:  QEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPP---EYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPP

A0A6J1CRA7 extensin-17.4e-5575.82Show/hide
Query:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYH--SPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPPP
        MAYLV AILVATLSL  V+ATDYVYSSPPPPYY Y  PPP IY SPPP   Y+SP  P Y+SPPPP Y   SPPPP+YHSPPPPVYHSPPP VYYS PPP
Subjt:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYH--SPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPPP

Query:  KKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPP----IYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVYQ
         K EYKSPPPP+YYSPPPPVY+SPPPPVY S  PP     Y SPPPP Y S PPPVYYSPPPPVY+SPP P+YHSPPPPVY+
Subjt:  KKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPP----IYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVYQ

A0A6J1F6U4 extensin-1-like1.3e-5470.31Show/hide
Query:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKF-----------------YYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPV
        MAYLV  +LVA LS   VIATDY YSSPPPPYYVYK PPP +Y SPPP  +                 YYSP  P+Y SPPPPVY+SPPPP+Y SPPPPV
Subjt:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKF-----------------YYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPV

Query:  YHSPPPLVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVY
        YHSPPP VY+SPPPP    Y SPPPPIY SPPPPVYHSPPPPVY S  PP+Y+SPPPP Y+S PPPVYYSPPPPVY SPP PVYHSPPPPVY
Subjt:  YHSPPPLVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVY

A0A6J1IER1 extensin-3-like8.5e-5975.98Show/hide
Query:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKF---YYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPP
        MAYLV  +LVA LS   VIA DY YSSPPPPYYVYK PPP +Y SPPP K    Y SP  P+Y+SPPPPVYHSPPPP+YHSPPPPVYHS PP VYYSPPP
Subjt:  MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKF---YYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPP

Query:  PKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVYQ
          K+EYKSPPPP+YYSPPPPVY SPPPPVYHS  PP+YHSPPPP Y S PPP+Y SPPP VYHSPP PVYHSPPPP+Y+
Subjt:  PKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVYQ

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q38913 Extensin-14.0e-3761.63Show/hide
Query:  VYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPPPKKQE-----YKSPPPPIYYSPPPPV
        VY SPPPP  V  Y PP +Y+SPPP   YYSP  P+Y SPPPPV++SPPP +YHSPPPPV++SPPP+VY+SPPPP         Y SPPPP++YSPPP V
Subjt:  VYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPPPKKQE-----YKSPPPPIYYSPPPPV

Query:  YHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPP----EYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYH-----------SPPPPVY
        YHSPPPPV++S  P +YHSPPPP    EY+S PPPV+YS PP VYHSPP PV+H           SPPPP Y
Subjt:  YHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPP----EYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYH-----------SPPPPVY

Q9FS16 Extensin-34.1e-3456.46Show/hide
Query:  MAYLVVAILVATLSLKLV--IATDYVYSSPPPPYYVY-----KYPPPLIYQSPPPSKFYY---SPSSPIYHSPPPPVYHSPPPP----IYHSPPPPVYHS
        MA LV  +LV T+SL  V     +Y YSSPPPP   Y      Y PP +Y SPPP K +Y   SP  P+ H  PPPVYHSPPPP    +Y SPPPPV H 
Subjt:  MAYLVVAILVATLSLKLV--IATDYVYSSPPPPYYVY-----KYPPPLIYQSPPPSKFYY---SPSSPIYHSPPPPVYHSPPPP----IYHSPPPPVYHS

Query:  PPPLVYYSPPPPKKQ-EYKSP--------PPPIYYSPPPP----VYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPE----YESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLP----
         PP VY+SPPPPKK   YKSP        PPP+Y+SPPPP    VY SPPPPV H + PP+YHSPPPP+    Y+S PPPV +  PPPVYHSPP P    
Subjt:  PPPLVYYSPPPPKKQ-EYKSP--------PPPIYYSPPPP----VYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPE----YESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLP----

Query:  VYHSPPPPV
        VY SPPPPV
Subjt:  VYHSPPPPV

Q9LJ64 Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 12.3e-2159.87Show/hide
Query:  SPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPP---PKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP
        SPPPP +    PPP +Y  PPP    +SP  P  HSPPPPV HSPPPP+ HSPPPPV HSPPP V+  PPP   P       PPPP++  PPP   +SPP
Subjt:  SPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPP---PKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP

Query:  PPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVY
        PP  HS  PP+ HSPPPP   S PPPV +SPPPPV HSPP PV HSPPPPV+
Subjt:  PPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVY

Q9M1G9 Extensin-22.5e-2355.29Show/hide
Query:  YVYSSPPPPYYV------YKY-PPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPI-YHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHS--PPPLVYYSPPPP-----KKQEYKSPP
        YVYSSPPPPYY       YK  PPP +Y SPPP    YSPS  + Y SPPPP  +S PPP Y+SP P V +   PPP VY SPPPP      K  YKSPP
Subjt:  YVYSSPPPPYYV------YKY-PPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPI-YHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHS--PPPLVYYSPPPP-----KKQEYKSPP

Query:  PPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPP--IYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVY
        PP  YS PPP Y+SP P VY+ + PP  +Y SPPPP Y  +P   Y SPPPP  +S P P Y+SP P VY
Subjt:  PPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPP--IYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVY

Q9XIL9 Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 31.6e-2562.66Show/hide
Query:  VYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP
        ++S PPPP Y    PPP +Y  PPP   Y  P  P  HSPPPPV HSPPPP+ HSPPPPV HSPPP V +SPPPP      SPPPP+ YSPPPP  HSPP
Subjt:  VYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPPPKKQEYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPP

Query:  PPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVY------HSPPLPVYHSPPPPVY
        PPV HS  PP+ HSPPPP Y   PPP  +SPPPPV+      HSPP PVY SPPPPVY
Subjt:  PPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVY------HSPPLPVYHSPPPPVY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G21310.1 extensin 32.9e-3556.46Show/hide
Query:  MAYLVVAILVATLSLKLV--IATDYVYSSPPPPYYVY-----KYPPPLIYQSPPPSKFYY---SPSSPIYHSPPPPVYHSPPPP----IYHSPPPPVYHS
        MA LV  +LV T+SL  V     +Y YSSPPPP   Y      Y PP +Y SPPP K +Y   SP  P+ H  PPPVYHSPPPP    +Y SPPPPV H 
Subjt:  MAYLVVAILVATLSLKLV--IATDYVYSSPPPPYYVY-----KYPPPLIYQSPPPSKFYY---SPSSPIYHSPPPPVYHSPPPP----IYHSPPPPVYHS

Query:  PPPLVYYSPPPPKKQ-EYKSP--------PPPIYYSPPPP----VYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPE----YESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLP----
         PP VY+SPPPPKK   YKSP        PPP+Y+SPPPP    VY SPPPPV H + PP+YHSPPPP+    Y+S PPPV +  PPPVYHSPP P    
Subjt:  PPPLVYYSPPPPKKQ-EYKSP--------PPPIYYSPPPP----VYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPE----YESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLP----

Query:  VYHSPPPPV
        VY SPPPPV
Subjt:  VYHSPPPPV

AT1G26240.1 Proline-rich extensin-like family protein2.9e-2761.33Show/hide
Query:  YVYSSPPPPYYVYKY--PPPLIYQSPPPSKFYY-SPSSP--IYHSPPPP--VYHSPPPP--IYHSPPPP--VYHSPPPLVY-YSPPPPKKQEYKSPPPP-
        YVYSSPPPP YVYK   PPP +Y SPPP  + Y SP  P  +Y SPPPP  VY SPPPP  +Y SPPPP  VY SPPP  Y YS PPP    YKSPPPP 
Subjt:  YVYSSPPPPYYVYKY--PPPLIYQSPPPSKFYY-SPSSP--IYHSPPPP--VYHSPPPP--IYHSPPPP--VYHSPPPLVY-YSPPPPKKQEYKSPPPP-

Query:  -IYYSPPPP--VYHSPPPPVYHSTLPP----IYHSPPPPE--YESTPPP--VYYSPPPP--VYHSPPLP--VYHSPPPPVY
         +Y SPPPP  VY SPPPP Y  + PP    +Y SPPPP   Y S PPP  VY SPPPP  VY SPP P  VY SPPPP Y
Subjt:  -IYYSPPPP--VYHSPPPPVYHSTLPP----IYHSPPPPE--YESTPPP--VYYSPPPP--VYHSPPLP--VYHSPPPPVY

AT1G26250.1 Proline-rich extensin-like family protein2.2e-2761.33Show/hide
Query:  YVYSSPPPPYYVYKY--PPPLIYQSPPPSKFYYSPSSP---IYHSPPPP--VYHSPPPP--IYHSPPPP--VYHSPPPLVY-YSPPPPKKQEYKSPPPPI
        Y+YSSPPPP YVY    PPP +Y SPPP  + YS   P   +Y SPPPP  VY SPPPP  +Y SPPPP  VY SPPP  Y YS PPP    YKSPPPP 
Subjt:  YVYSSPPPPYYVYKY--PPPLIYQSPPPSKFYYSPSSP---IYHSPPPP--VYHSPPPP--IYHSPPPP--VYHSPPPLVY-YSPPPPKKQEYKSPPPPI

Query:  Y-YSPPPP---VYHSPPPP--VYHSTLPP--IYHSPPPPE--YESTPPP--VYYSPPPP--VYHSPPLP--VYHSPPPPVY
        Y YSPPPP   VY SPPPP  VY S  PP  +Y SPPPP   Y S PPP  VY SPPPP  VY SPP P  VY SPPPP Y
Subjt:  Y-YSPPPP---VYHSPPPP--VYHSTLPP--IYHSPPPPE--YESTPPP--VYYSPPPP--VYHSPPLP--VYHSPPPPVY

AT1G76930.1 extensin 46.3e-3057.47Show/hide
Query:  VVAILVATLSLKLVIAT--DYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLV-YYSPPPPKKQ
        + + LV   SL  V  T  +Y YSSPPPP  V  Y PP +Y+SPPP         P+ H  PPPVY SPPPP+ H  PPPVY SPPP V YYSPPP    
Subjt:  VVAILVATLSLKLVIAT--DYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLV-YYSPPPPKKQ

Query:  EYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVY
         YKSPPPP+Y SPPPPV H  PPPVY S  PP+ H  PPP Y+S PPPV +  PPPVY SPP PV H  PPP Y
Subjt:  EYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVY

AT1G76930.2 extensin 46.3e-3057.47Show/hide
Query:  VVAILVATLSLKLVIAT--DYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLV-YYSPPPPKKQ
        + + LV   SL  V  T  +Y YSSPPPP  V  Y PP +Y+SPPP         P+ H  PPPVY SPPPP+ H  PPPVY SPPP V YYSPPP    
Subjt:  VVAILVATLSLKLVIAT--DYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLV-YYSPPPPKKQ

Query:  EYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVY
         YKSPPPP+Y SPPPPV H  PPPVY S  PP+ H  PPP Y+S PPPV +  PPPVY SPP PV H  PPP Y
Subjt:  EYKSPPPPIYYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCTACCTAGTAGTAGCAATTTTGGTGGCAACTTTGAGTTTGAAATTAGTAATCGCTACCGATTATGTCTATTCTTCTCCACCACCTCCTTATTATGTTTACAAATA
TCCTCCTCCTCTTATCTATCAATCACCGCCACCATCAAAATTTTATTACTCTCCTTCGTCTCCTATTTACCATTCTCCTCCTCCTCCAGTTTACCACTCTCCACCACCTC
CTATTTACCATTCTCCTCCACCACCTGTTTATCACTCTCCACCACCTCTAGTTTATTACTCTCCACCCCCACCAAAGAAGCAGGAGTATAAATCACCACCACCTCCTATT
TATTACTCTCCTCCTCCCCCAGTATATCACTCTCCTCCACCTCCAGTTTACCATTCTACTCTCCCACCTATTTATCACTCCCCACCACCTCCGGAGTATGAATCAACACC
ACCTCCTGTTTATTACTCTCCTCCTCCACCTGTGTATCACTCTCCTCCACTTCCAGTTTACCATTCTCCTCCTCCACCTGTTTATCAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCCTACCTAGTAGTAGCAATTTTGGTGGCAACTTTGAGTTTGAAATTAGTAATCGCTACCGATTATGTCTATTCTTCTCCACCACCTCCTTATTATGTTTACAAATA
TCCTCCTCCTCTTATCTATCAATCACCGCCACCATCAAAATTTTATTACTCTCCTTCGTCTCCTATTTACCATTCTCCTCCTCCTCCAGTTTACCACTCTCCACCACCTC
CTATTTACCATTCTCCTCCACCACCTGTTTATCACTCTCCACCACCTCTAGTTTATTACTCTCCACCCCCACCAAAGAAGCAGGAGTATAAATCACCACCACCTCCTATT
TATTACTCTCCTCCTCCCCCAGTATATCACTCTCCTCCACCTCCAGTTTACCATTCTACTCTCCCACCTATTTATCACTCCCCACCACCTCCGGAGTATGAATCAACACC
ACCTCCTGTTTATTACTCTCCTCCTCCACCTGTGTATCACTCTCCTCCACTTCCAGTTTACCATTCTCCTCCTCCACCTGTTTATCAATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAYLVVAILVATLSLKLVIATDYVYSSPPPPYYVYKYPPPLIYQSPPPSKFYYSPSSPIYHSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPLVYYSPPPPKKQEYKSPPPPI
YYSPPPPVYHSPPPPVYHSTLPPIYHSPPPPEYESTPPPVYYSPPPPVYHSPPLPVYHSPPPPVYQ