CuGenDBv2

Gene ID	Clc04G09130
Organism	Citrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
Description	Unknown protein
Genome location	ClcChr04:22769780..22774098
RNA-Seq Expression	Clc04G09130
Synteny	Clc04G09130
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

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XP_038880948.1 uncharacterized protein LOC120072617 isoform X2 [Benincasa hispida]

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0KF21 Uncharacterized protein

2.2e-147

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A0A1S3BLN6 uncharacterized protein LOC103491201

8.4e-147

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A0A5A7TWJ8 Uncharacterized protein

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A0A6J1E431 uncharacterized protein LOC111429751

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        M+ Q+FSTPPSKG   KSGSITTP SSPLLPS+ RLWRPSAQRNIRNQWSKLS LKQQWASSSS+GRSHATS+VNAYLS+KYMPSMELGSLSDM+DIRNK
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         LLMEL S+ S SS  SLVWSEELYSGEFDNL LCNL SEET+  LHP+LKGHESNT +VS N  PN EVLQVYLVAWLA+VNIHTKRVDEIFELVSEEI
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         V LS
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A0A6J1JD30 uncharacterized protein LOC111485701

1.5e-132

82.3

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         LLMEL S+ S SS  SLVWSEELYSGEFDNL LCNL SEET+  LHP+LKG ESNT +VS N  PN EVLQVYLVAWLA+VNIHTKRVDEIFE+VSEEI
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        HV LS
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G07950.1 unknown protein

1.4e-77

54.61

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        M    F  P S      S S+ +   SP    S  RLWRP+AQRN+RNQWS LS  +QQW  + S+GRSHAT +VN+YLS+KYMP MELG LSDM DI  
Subjt:  MDTQYFSTPPSKGTTLKSGSITTPGSSP-LLPSITRLWRPSAQRNIRNQWSKLSLLKQQWASSSSSGRSHATSIVNAYLSEKYMPSMELGSLSDMIDIRN

Query:  KACLKLSKQQKLYRSKLLSSYKEMVDVVVQMVNASRLMKCYFKRSSSSTLVQFSNSSEDNNNDDVGDGGGISVFTLLTIPCFEKLAEELVHMFELELNLK
        KA  KL  QQ  YR KLLSSYKEMV VVV+MVNASR ++CY K S+ S L+QFS + ED+N  D GD GGI VF    +  FEK+AEELV MF+ E+ LK
Subjt:  KACLKLSKQQKLYRSKLLSSYKEMVDVVVQMVNASRLMKCYFKRSSSSTLVQFSNSSEDNNNDDVGDGGGISVFTLLTIPCFEKLAEELVHMFELELNLK

Query:  RWLLMELFSLGSE-SSPKSLVWSEELYSGEFDNLCLCNLWSEETNELLHPSLKGHESNTPIVSSNQHPNAEVLQVYLVAWLAEVNIHTKRVDEIFELVSE
        R L+MEL SL +E   P +  WS+ELY GEFD+L  C+L+S E  + + P +K +   +  +S    P AE+LQ+YL  WLAEVNI T RVDEI  LV E
Subjt:  RWLLMELFSLGSE-SSPKSLVWSEELYSGEFDNLCLCNLWSEETNELLHPSLKGHESNTPIVSSNQHPNAEVLQVYLVAWLAEVNIHTKRVDEIFELVSE

Query:  EIHV
        EI V
Subjt:  EIHV

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGACACTCAATATTTCTCTACACCTCCTTCTAAAGGAACTACTTTGAAATCTGGAAGTATTACAACACCAGGCTCATCGCCTCTACTCCCATCGATAACAAGGCTATG
GAGGCCATCAGCACAAAGGAACATTAGGAATCAATGGTCGAAGTTGTCTTTACTCAAACAACAATGGGCTTCTTCTTCTTCAAGTGGGCGATCTCATGCTACCTCCATTG
TTAATGCTTATTTATCTGAAAAGTACATGCCTTCTATGGAGCTGGGTTCTCTCAGCGACATGATTGATATACGAAACAAAGCTTGTTTGAAATTGTCTAAGCAGCAGAAA
CTTTATCGAAGTAAACTCTTATCGTCTTACAAGGAAATGGTTGATGTTGTAGTTCAGATGGTTAATGCTAGCAGACTAATGAAGTGTTATTTCAAGAGATCAAGTAGTAG
TACACTCGTACAATTTTCAAATAGCTCTGAGGACAATAACAATGACGATGTTGGAGATGGTGGTGGCATCTCAGTATTTACATTATTGACAATCCCTTGCTTTGAGAAAT
TGGCAGAGGAGCTTGTTCATATGTTTGAGTTGGAGCTGAATTTGAAGCGATGGCTTTTGATGGAACTATTTTCTCTTGGTTCTGAATCCTCACCAAAAAGCTTGGTCTGG
TCGGAAGAGCTTTACTCAGGGGAATTCGACAACTTGTGTTTGTGCAACTTGTGGTCCGAGGAAACCAACGAGCTGCTCCATCCAAGCTTGAAGGGTCATGAATCCAATAC
ACCTATTGTCAGTTCTAACCAACACCCAAATGCAGAAGTTTTGCAGGTCTATCTTGTCGCGTGGCTTGCAGAAGTGAACATACACACAAAAAGAGTAGATGAAATATTTG
AATTGGTTAGTGAGGAGATTCATGTCGGCCTATCCTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

GGTGTTTGACGACGGAATGAGATTGCAGTTTAATGTAATCCAACATCAAATGTTTGAATTCAACGTTTTAAGCTCGACCCAGCGCTTACCATTTTCACGCTTCACATTCC
AACTTTTCAGACAACCCCTTGGGTATCGGGACTGTTCTCGGCTCTGATCGATTTCGGTTTCCAGGAAACCCTAGAATCGAATTTTGGGAAAATCCTTGGAGGAAAGGAAA
AACCCATAACCATTGCATGATATTTGCCCCTCCGTCCAGCTCAAGCGCTCTTCATTGATGGTCCTTCTAGGAATTGTGGTTCCTTTTGTTGCTCCGGCAGTGAACCCGCA
AGATCTGCCCGTCCATTATTCCAGTTTCATTGCCATAGTTTTGGTGCAGTAGGGACGTAAACCTTTAACGCCATGGACACTCAATATTTCTCTACACCTCCTTCTAAAGG
AACTACTTTGAAATCTGGAAGTATTACAACACCAGGCTCATCGCCTCTACTCCCATCGATAACAAGGCTATGGAGGCCATCAGCACAAAGGAACATTAGGAATCAATGGT
CGAAGTTGTCTTTACTCAAACAACAATGGGCTTCTTCTTCTTCAAGTGGGCGATCTCATGCTACCTCCATTGTTAATGCTTATTTATCTGAAAAGTACATGCCTTCTATG
GAGCTGGGTTCTCTCAGCGACATGATTGATATACGAAACAAAGCTTGTTTGAAATTGTCTAAGCAGCAGAAACTTTATCGAAGTAAACTCTTATCGTCTTACAAGGAAAT
GGTTGATGTTGTAGTTCAGATGGTTAATGCTAGCAGACTAATGAAGTGTTATTTCAAGAGATCAAGTAGTAGTACACTCGTACAATTTTCAAATAGCTCTGAGGACAATA
ACAATGACGATGTTGGAGATGGTGGTGGCATCTCAGTATTTACATTATTGACAATCCCTTGCTTTGAGAAATTGGCAGAGGAGCTTGTTCATATGTTTGAGTTGGAGCTG
AATTTGAAGCGATGGCTTTTGATGGAACTATTTTCTCTTGGTTCTGAATCCTCACCAAAAAGCTTGGTCTGGTCGGAAGAGCTTTACTCAGGGGAATTCGACAACTTGTG
TTTGTGCAACTTGTGGTCCGAGGAAACCAACGAGCTGCTCCATCCAAGCTTGAAGGGTCATGAATCCAATACACCTATTGTCAGTTCTAACCAACACCCAAATGCAGAAG
TTTTGCAGGTCTATCTTGTCGCGTGGCTTGCAGAAGTGAACATACACACAAAAAGAGTAGATGAAATATTTGAATTGGTTAGTGAGGAGATTCATGTCGGCCTATCCTAG
GAAGATAGATAGGAGTGCTCTTCCCTCATGCTATTGTAGCTATGAAGGAGCTTTGTGATTCTTCGTCGTGGATCGATCAGCATTGGCGGCCCCCTACAGAAACAGAAGAC
GGTTTGTGAGAGTTCTGAATCGAAATCTCATACAGATTATGGGATTGTTGTTTATGGCCGCAATCAACAACTATTTACGACTTAAAAGGGTTGGCGCAGTTCGTTTTCCT
ACCAATGGGGTCAAGTAGGAACCAACACTCGTTATTTCGGGCTATTTGGAATGATTTTCTAAGTTTTTTATGCTTAAAAATTATTCCAAATAGGTTCTCATTTAGTGATA
GTTTAACATTAAATTGTTATTTGATTAGTTGGCGGAAGGAATTTGTTGCTTAATTTCGTGCCAAATAAATTACCTAATAGTAGTAGCGGCAAGTCGGGTCGAACACAGGG
AGTGCTTAAATTTCTTAGACTTACAATTCTAGGTAACTAAAAGGGGTTTTGTGAGAAGGTTGTTTGTAAAGAATTTAAATGGCATAAAAGTAAATGCAAAAATAGAAATA
AAATTCAAATGGAGAAAGTTCTAGTTTGTGTTACAACAAAA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MDTQYFSTPPSKGTTLKSGSITTPGSSPLLPSITRLWRPSAQRNIRNQWSKLSLLKQQWASSSSSGRSHATSIVNAYLSEKYMPSMELGSLSDMIDIRNKACLKLSKQQK
LYRSKLLSSYKEMVDVVVQMVNASRLMKCYFKRSSSSTLVQFSNSSEDNNNDDVGDGGGISVFTLLTIPCFEKLAEELVHMFELELNLKRWLLMELFSLGSESSPKSLVW
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Clc04G09130 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome