; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc04G11610 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc04G11610
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionUnknown protein
Genome locationClcChr04:25186671..25187720
RNA-Seq ExpressionClc04G11610
SyntenyClc04G11610
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6584364.1 hypothetical protein SDJN03_20296, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.7e-8075.65Show/hide
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KAG7019949.1 hypothetical protein SDJN02_18916, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.9e-8075.22Show/hide
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XP_011660345.1 uncharacterized protein LOC105436376 [Cucumis sativus]1.1e-8981.59Show/hide
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XP_022924029.1 uncharacterized protein LOC111431577 [Cucurbita moschata]3.0e-7974.78Show/hide
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XP_038894861.1 uncharacterized protein LOC120083261 [Benincasa hispida]4.2e-9788Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LQD5 Uncharacterized protein5.3e-9081.59Show/hide
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A0A314YXI4 Uncharacterized protein3.5e-3348.36Show/hide
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A0A6J1E811 uncharacterized protein LOC1114315771.5e-7974.78Show/hide
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A0A6J1GR95 uncharacterized protein LOC1114568052.7e-7871.93Show/hide
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A0A6J1K097 uncharacterized protein LOC1114899168.2e-7569.3Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G13360.1 unknown protein8.9e-1334.25Show/hide
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AT1G13360.2 unknown protein1.1e-1033.33Show/hide
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Query:  -DFMPACCSPDVFELEGKLGFEDEIPCYDSFELGMGISSGTAEENGLGGGEFVALGGLFDYS
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AT1G13360.3 unknown protein9.2e-1033.54Show/hide
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Query:  -DFMPACCSPDVFELEGKLGFEDEIPCYDSFELGMGISSGTAEENGLGGGEFVALGGL
         D + A  S D   ++   GFED +  Y   + G G+           GG++VA+ GL
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AT3G25870.1 unknown protein7.3e-0732.96Show/hide
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        D V ++ ++D L   L+  D    RD+  +  GL     +LDS +KSFE E+    A   +   Q +LGYLF ASDDELGLPP               +P
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Query:  ACCSPDVFEL---------EGKL-GFEDEIPCYDSFELGMGISSGTAEENGLGGGEFVALGGLFDYSDV-PFRPESLSA
          C   V EL          G+L GFED +  +   +LG         ++GL    F    G  D  D+  +RPE L A
Subjt:  ACCSPDVFEL---------EGKL-GFEDEIPCYDSFELGMGISSGTAEENGLGGGEFVALGGLFDYSDV-PFRPESLSA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAAATTACTCCGACGATAAGAAACGAGTTCGCGACGAGTTCGACGACTCGCTAGCCGATTCGGCTGAGTCCAAGCTCCGACGACTCAACTCGTCGGATTTGAGATT
GGTCAAGCCATGCACCAAGGAGAATTTGAATGTTGTCCAACGTTCAACCGCTGCTGCCGGTGATTTGAATATTGATGATTTGGTGGAATCTGAGGAGATTCAGGATGAGT
TACTCAATATCCTTGAAGATTCCGACGCTGTAGTGGAGCGGGATGAGAGTATTGAAGGTCTTGAACTGGATTCGTTTATTAAAAGCTTTGAGGAAGAGATTCAAGCTTTA
CCGGCGGAGGATCAGAATGAAAGTCCTCAGGCGGAACTCGGATATCTTTTTGGAGCGTCGGATGATGAGCTAGGGCTGCCTCCGAGCGGAGGTTTGAGTACGGAAGGCAA
GATGGAGGCGATTGATTTTATGCCTGCTTGTTGTTCACCTGATGTGTTTGAGTTGGAAGGGAAGTTAGGGTTTGAAGATGAGATTCCGTGTTACGACTCGTTCGAGTTGG
GAATGGGGATTAGTTCCGGTACGGCGGAGGAGAATGGGTTGGGCGGCGGAGAGTTTGTTGCATTGGGCGGTTTGTTTGATTATTCGGACGTGCCATTTCGGCCGGAGTCG
TTATCGGCTTTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAAAAGTGGAAGAAGACGACCGAGAATGGTTTTTCTAAACCCTCTCTTTATTCGCCACGTGTCCTTGTCTCTTTCTTCCCATCAAACCCTACCATTTCAAATTCCGATGC
TCCTTTTCTCTTCTCTTTTTAAACCTCCTTCCTTCCATTTCACACACCACTTCATCTTTTCTTCTCTATAACGGCGGCGTAAAATCCCTAATTCTTCTTCTTCTTCTTCT
TCTTCTTCTTCTTCTTCTGTCTCTGTTTCTAAATTTCTTCCATGGAAAATTACTCCGACGATAAGAAACGAGTTCGCGACGAGTTCGACGACTCGCTAGCCGATTCGGCT
GAGTCCAAGCTCCGACGACTCAACTCGTCGGATTTGAGATTGGTCAAGCCATGCACCAAGGAGAATTTGAATGTTGTCCAACGTTCAACCGCTGCTGCCGGTGATTTGAA
TATTGATGATTTGGTGGAATCTGAGGAGATTCAGGATGAGTTACTCAATATCCTTGAAGATTCCGACGCTGTAGTGGAGCGGGATGAGAGTATTGAAGGTCTTGAACTGG
ATTCGTTTATTAAAAGCTTTGAGGAAGAGATTCAAGCTTTACCGGCGGAGGATCAGAATGAAAGTCCTCAGGCGGAACTCGGATATCTTTTTGGAGCGTCGGATGATGAG
CTAGGGCTGCCTCCGAGCGGAGGTTTGAGTACGGAAGGCAAGATGGAGGCGATTGATTTTATGCCTGCTTGTTGTTCACCTGATGTGTTTGAGTTGGAAGGGAAGTTAGG
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GTTTGTTTGATTATTCGGACGTGCCATTTCGGCCGGAGTCGTTATCGGCTTTGTAGAAACGGTTTTCGAATGAGAGGAGGTGCTTTTTGGTTTTCTTTTTAGAGTTGGGT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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PAEDQNESPQAELGYLFGASDDELGLPPSGGLSTEGKMEAIDFMPACCSPDVFELEGKLGFEDEIPCYDSFELGMGISSGTAEENGLGGGEFVALGGLFDYSDVPFRPES
LSAL