; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc04G12740 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc04G12740
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionMini zinc finger
Genome locationClcChr04:26105629..26109572
RNA-Seq ExpressionClc04G12740
SyntenyClc04G12740
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000976 - transcription regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006456 - ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0036083.1 mini zinc finger protein 1 [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-3791.84Show/hide
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XP_004137410.1 mini zinc finger protein 1 [Cucumis sativus]4.3e-3790.82Show/hide
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XP_008442199.1 PREDICTED: mini zinc finger protein 1 [Cucumis melo]1.1e-3791.84Show/hide
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XP_022137501.1 mini zinc finger protein 2 [Momordica charantia]2.8e-3686.6Show/hide
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XP_038894079.1 mini zinc finger protein 1-like isoform X2 [Benincasa hispida]1.5e-3487Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LVI9 ZF-HD dimerization-type domain-containing protein2.1e-3790.82Show/hide
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A0A1S3B557 mini zinc finger protein 15.5e-3891.84Show/hide
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A0A5A7SZK7 Mini zinc finger protein 15.5e-3891.84Show/hide
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A0A5D3BJJ4 Mini zinc finger protein 15.5e-3891.84Show/hide
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A0A6J1C6T5 mini zinc finger protein 21.3e-3686.6Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BIU8 Mini zinc finger protein 14.6e-1854.88Show/hide
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Q0J5F8 Mini zinc finger protein 49.9e-2170.97Show/hide
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Q2Q493 Mini zinc finger protein 36.2e-2363.16Show/hide
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Q9CA51 Mini zinc finger protein 11.6e-2667.71Show/hide
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Q9LJW5 Mini zinc finger protein 21.3e-2562Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G14440.1 homeobox protein 312.8e-1861.29Show/hide
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AT1G18835.1 mini zinc finger4.4e-2463.16Show/hide
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AT1G74660.1 mini zinc finger 11.1e-2767.71Show/hide
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AT2G02540.1 homeobox protein 212.1e-1866.67Show/hide
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        V++Y EC KNHAA +GG A+DGC EF+ +GEEGS  ALTC+ C CHRNFHRRE E E
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AT3G28917.1 mini zinc finger 29.5e-2762Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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