; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

Clc05G05220 (gene) of Watermelon (cordophanus) v2 genome

Gene IDClc05G05220
OrganismCitrullus lanatus subsp. cordophanus (Watermelon (cordophanus) v2)
DescriptionC2H2-type domain-containing protein
Genome locationClcChr05:3744240..3748259
RNA-Seq ExpressionClc05G05220
SyntenyClc05G05220
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0049241.1 hypothetical protein E6C27_scaffold171G004810 [Cucumis melo var. makuwa]8.6e-9078.08Show/hide
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KAG6582389.1 hypothetical protein SDJN03_22391, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.5e-2138.16Show/hide
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KAG6597359.1 hypothetical protein SDJN03_10539, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.6e-7866.94Show/hide
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KGN56847.1 hypothetical protein Csa_010766 [Cucumis sativus]1.4e-9580.54Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L892 C2H2-type domain-containing protein6.7e-9680.54Show/hide
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A0A5A7U6I9 C2H2-type domain-containing protein4.2e-9078.08Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGGGTAACTAGTGGCCGTGTGAATGGTCAACATAACACCTATGTATCTTCTGTAAAATGCCCCAGCTCTACGGAAGTTGTTAATACATTTGAGACAGTTGTAATATA
CCTTCCAGTACGCAAATTTGATGTTACCTTCCAGGATGAGAATAGTTGTTATGTGTACTTGTTGAAAATGTTTCAAGTTGTATATGCATTAATTATCAAATGTACATTAT
GCTCAGGTTGCCTTCTCTCCTCTCCGTCTTTCCCAGGGAATTCCTCCTCCTTTGATAAATCTGGCTGGAACCCATCATTTGAGGAGACGTTGTTGACTGCCGGCGAGACT
TTCCGCCGACCGTCTCGCCGGAAGAACACAATTTTCGGTGCTCCTTGTGGGCTCTGTGGCCAAGTGATTTTTGGCTCTGAAGGTCTTAATCACCATTGCAATTACCATTT
CTTGCAGAATGAGCTTGCTTCTTTTGGAGGCCGCTCGAATCCTTGCTCAGGTAACTCTCAGCGGCCGCCGTTATGGACCAATTATTTCCATGGCCAAGCCTCTGCTTCTC
GAGAACCCCAAATGACGCTTAACGATTATTTGACGATACCGCCGTCTTTGAGAAGCTATTCCGGCGCCGGTATTGACATGGGTCACTTGCTTCCGCTTCATCCGTTGTTG
GCCCAACCTCCGCCGCCGCCGCGGACTACCACCGCCAACGGTATGAATGTTCAACAGAATCAAGCTGTGGCTCGGCAGAGGAGGCAGGAAAATGAAGTCCGATGGAATAA
CGGCGGCGGGAGGGCGGTTGGTGGCCGGCCGGCGGCGGAGCAGCAGCCACCTCAAGATGTGATTGATCTGAATTGTGAGGAGAATGATTGTAGCTCTGATGGTTCAGAAG
GCTTGGATTTGACATTGAGTCTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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CTTGCAGAATGAGCTTGCTTCTTTTGGAGGCCGCTCGAATCCTTGCTCAGGTAACTCTCAGCGGCCGCCGTTATGGACCAATTATTTCCATGGCCAAGCCTCTGCTTCTC
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GCTTGGATTTGACATTGAGTCTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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AQPPPPPRTTTANGMNVQQNQAVARQRRQENEVRWNNGGGRAVGGRPAAEQQPPQDVIDLNCEENDCSSDGSEGLDLTLSL